| 致谢 | 第6-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 缩略语表 | 第12-15页 |
| 1 绪论 | 第15-28页 |
| 1.1 基因组学研究 | 第16-24页 |
| 1.1.1 连锁图谱构建 | 第16-17页 |
| 1.1.2 桃全基因组测序 | 第17-18页 |
| 1.1.3 桃重要候选基因的定位 | 第18-19页 |
| 1.1.4 桃数量性状的基因定位 | 第19-20页 |
| 1.1.5 分子标记在桃遗传育种中的应用 | 第20-23页 |
| 1.1.6 SNP分子标记的开发及应用 | 第23-24页 |
| 1.1.7 分子标记辅助育种的应用 | 第24页 |
| 1.2 全基因组关联分析 | 第24-26页 |
| 1.2.1 全基因组关联分析的概念及其基本原理 | 第24页 |
| 1.2.2 全基因组关联分析在植物复杂性状分析中的应用 | 第24-25页 |
| 1.2.3 全基因组关联分析在桃上的应用 | 第25-26页 |
| 1.3 本论文研究意义和主要内容 | 第26-28页 |
| 2 桃亲子鉴定与F1代杂交群体构建 | 第28-35页 |
| 2.1 材料和方法 | 第28-30页 |
| 2.1.1 植物材料DNA提取 | 第28-29页 |
| 2.1.2 引物来源 | 第29页 |
| 2.1.3 PCR反应体系和程序 | 第29-30页 |
| 2.2 数据分析 | 第30页 |
| 2.3 结果与分析 | 第30-33页 |
| 2.3.1 桃基因组DNA质量检测与浓度调整 | 第30-31页 |
| 2.3.2 多态性引物筛选及特异性分析 | 第31页 |
| 2.3.3 杂交后代筛选 | 第31-33页 |
| 2.4 讨论 | 第33-34页 |
| 2.5 本章小结 | 第34-35页 |
| 3 桃高密度SNP遗传图谱构建 | 第35-47页 |
| 3.1 材料和方法 | 第35-40页 |
| 3.1.1 植物材料及DNA的提取 | 第35页 |
| 3.1.2 仪器与试剂 | 第35-36页 |
| 3.1.3 桃Illumina 9K SNP芯片检测的步骤 | 第36-40页 |
| 3.2 数据分析 | 第40-41页 |
| 3.2.1 SNP基因分型 | 第40-41页 |
| 3.2.2 SNP图谱构建 | 第41页 |
| 3.3 结果与分析 | 第41-44页 |
| 3.3.1 SNP基因分型 | 第41页 |
| 3.3.2 作图群体SNP标记多态性分析与分离检测 | 第41-42页 |
| 3.3.3 高密度SNP图谱构建 | 第42-44页 |
| 3.4 讨论 | 第44-46页 |
| 3.4.1 偏分离现象 | 第44-45页 |
| 3.4.2 ‘C0’连锁图谱及其与桃基因组测序数据比对 | 第45-46页 |
| 3.5 本章小结 | 第46-47页 |
| 4 基于连锁图谱的QTL定位 | 第47-55页 |
| 4.1 材料与方法 | 第47-48页 |
| 4.1.1 作图群体 | 第47页 |
| 4.1.2 SNP标记检测 | 第47页 |
| 4.1.3 表型检测 | 第47-48页 |
| 4.1.4 遗传图谱的构建 | 第48页 |
| 4.2 数据分析 | 第48页 |
| 4.3 结果与分析 | 第48-52页 |
| 4.3.1 作图群体的表型性状的统计与描述 | 第48-50页 |
| 4.3.2 酸度、质地关联分析及QTL定位 | 第50-52页 |
| 4.4 讨论 | 第52-54页 |
| 4.4.1 F1代杂交群体表型性状的多态性 | 第52页 |
| 4.4.2 表型性状的QTL分析 | 第52-54页 |
| 4.5 本章小结 | 第54-55页 |
| 5 结论与展望 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-68页 |
| 作者简介及在校期间取得的科研成果 | 第68页 |
