| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 注释表 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-15页 |
| 1.1 研究目的及意义 | 第12-13页 |
| 1.2 论文研究的关键问题 | 第13页 |
| 1.3 研究方案与创新性 | 第13-14页 |
| 1.4 论文的研究内容与安排 | 第14-15页 |
| 1.5 本章小结 | 第15页 |
| 第二章lincRNA及研究背景介绍 | 第15-24页 |
| 2.1 研究历程 | 第16-17页 |
| 2.2 lincRNA的功能 | 第17-18页 |
| 2.2.1 表观遗传调控 | 第17页 |
| 2.2.2 胚胎干细胞多能性调控 | 第17-18页 |
| 2.3 lincRNA的特性 | 第18-20页 |
| 2.3.1 lincRNA的保守性 | 第18-19页 |
| 2.3.2 lincRNA与miRNA的结合功能 | 第19-20页 |
| 2.3.3 lincRNA上的SNP | 第20页 |
| 2.4 lincRNA与疾病的关系 | 第20-21页 |
| 2.5 lincRNA的数据库 | 第21-22页 |
| 2.6 本文研究背景 | 第22-24页 |
| 2.7 本章小结 | 第24页 |
| 第三章lincRNA作用的识别 | 第24-35页 |
| 3.1 数据集的构建 | 第25页 |
| 3.1.1 数据的来源 | 第25页 |
| 3.1.2 数据的处理 | 第25页 |
| 3.2 MINDy算法 | 第25-28页 |
| 3.2.1 MINDy算法的简介 | 第25-28页 |
| 3.2.2 MINDy分析软件实现 | 第28页 |
| 3.3 MINDy算法的应用 | 第28-33页 |
| 3.3.1 计算结果 | 第28-31页 |
| 3.3.2 lincRNA对mRNA-miRNA作用分析 | 第31-33页 |
| 3.3.3 三元组的 ΔI的分布 | 第33页 |
| 3.4 讨论 | 第33-34页 |
| 3.5 本章小结 | 第34-35页 |
| 第四章lincRNA结合miRNA的特性分析 | 第35-52页 |
| 4.1 lincRNA-miRNA结合位点预测 | 第35-36页 |
| 4.2 lincRNA的热力学稳定性和结构保守性评估 | 第36-38页 |
| 4.2.1 lincRNA的热力学稳定性 | 第36-37页 |
| 4.2.2 lincRNA的结构保守性 | 第37-38页 |
| 4.3 特征分析 | 第38-45页 |
| 4.3.1 lincRNA序列结构对lincRNA作用的影响 | 第38-41页 |
| 4.3.2 lincRNA-miRNA双链结合特征对lincRNA作用的影响 | 第41-42页 |
| 4.3.3 靶点区域特征对lincRNA作用的影响 | 第42-45页 |
| 4.4 SNP对lincRNA结构以及结合miRNA的影响 | 第45-50页 |
| 4.4.1 SNP的相关介绍 | 第45-46页 |
| 4.4.2 SNP对RNA结合miRNA的影响 | 第46-47页 |
| 4.4.3 SNP对lincRNA结合miRNA影响的分析 | 第47-50页 |
| 4.5 讨论 | 第50-51页 |
| 4.6 本章小结 | 第51-52页 |
| 第五章lincRNA与miRNA竞争结合miRNA特征分析 | 第52-60页 |
| 5.1 靶点预测 | 第52-53页 |
| 5.2 lincRNA与mRNA的特征对比 | 第53-59页 |
| 5.2.1 lincRNA和mRNA的 3’UTR自身序列结构特征分析 | 第53-55页 |
| 5.2.2 linc RNA和mRNA的 3’UTR上靶点区域特征分析 | 第55-57页 |
| 5.2.3 lincRNA和mRNA的 3’UTR与miRNA的结合特征分析 | 第57-58页 |
| 5.2.4 讨论 | 第58-59页 |
| 5.3 本章小结 | 第59-60页 |
| 第六章 总结和展望 | 第60-62页 |
| 6.1 本文工作总结 | 第60-61页 |
| 6.2 后续研究工作展望 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 在学期间的研究成果及学术论文情况 | 第69页 |
