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三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum Bohlin)减数分裂相关基因的系统学分析、表达检测及功能验证

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
0 前言第13-43页
    1 有性生殖的概述第13-18页
        1.1 繁殖的概念和类型第13-14页
        1.2 细胞增殖的方式第14-16页
            1.2.1 无丝分裂第14-15页
            1.2.2 有丝分裂第15页
            1.2.3 减数分裂第15-16页
        1.3 有性生殖的意义第16-18页
    2. 判定有性生殖的方法第18-29页
        2.1 性过程的形态学证据第18-19页
        2.2 性过程的DNA证据第19-28页
            2.2.1 染色体的形态和杂合度第19-20页
            2.2.2 系统演化不确定性第20页
            2.2.3 群体遗传学第20-21页
            2.2.4 梅塞尔效应(Meselson effect)第21-23页
            2.2.5 转座子(Transposble elements,TEs)第23-24页
            2.2.6 比较基因组学第24-28页
        2.3 基因功能的验证第28-29页
            2.3.1 计算机预测基因功能第28-29页
            2.3.2 实验验证基因功能第29页
    3 减数分裂相关的基因第29-35页
        3.1 减数分裂开始,DNA的复制和同源染色体配对第30页
        3.2 减数分裂的进行,同源染色体重组第30-34页
        3.3 减数分裂过程的延续第34-35页
    4 三角褐指藻研究现状第35-41页
        4.1 硅藻的分类地位及研究现状第35-39页
        4.2 三角褐指藻的生物学特性及研究现状第39-41页
    5. 本实验的目的和意义第41-43页
1 三角褐指藻减数分裂相关基因的系统学研究第43-64页
    1.1 材料与方法第44-47页
        1.1.1 材料第44-45页
            1.1.1.1 数据来源第44页
            1.1.1.2 所用的软件、程序第44-45页
        1.1.2 方法第45-47页
            1.1.2.1 本地数据库的建立及本地搜索第45-46页
            1.1.2.2 多序列比对和系统发育分析第46-47页
    1.2 结果与讨论第47-63页
    1.3 小结第63-64页
2 三角褐指藻(P.tricornutum Bohlin)减数分裂相关基因同源基因的表达分析第64-72页
    2.1 材料方法第64-69页
        2.1.1 藻种及培养方法第64-65页
        2.1.2. 三角褐指藻(P.tricornutum)总RNA的提取第65-66页
        2.1.3. DNase处理总RNA,消化基因组DNA第66页
        2.1.4. cDNA合成反应(TaKaRa M-MLV RTase cDNA Synthesis Kit)第66-68页
            2.1.4.1 第一链cDNA合成反应第66-67页
            2.1.4.2 第二链cDNA合成及平末端化第67页
            2.1.4.3 cDNA纯化第67-68页
        2.1.5 减数分裂相关基因引物设计与合成第68页
        2.1.6 减数分裂相关基因的RT-PCR扩增第68-69页
    2.2 结果讨论第69-71页
        2.2.1. RNA提取1%琼脂糖电泳检测第69-70页
        2.2.2. 减数分裂相关基因的是否表达检测第70-71页
    2.3 小结第71-72页
3 三角褐指藻(P.tricornutum Bohlin)SPO11及DMC1同源基因的克隆第72-87页
    3.1 材料与方法第73-81页
        3.1.1 三角褐指藻(P.tricornutum)基因组总DNA的提取第73页
        3.1.2 引物设计及合成第73-74页
        3.1.3 质粒的制备和提取第74-77页
            3.1.3.1 质粒来源及结构第74-76页
            3.1.3.2 质粒制备第76页
            3.1.3.3 质粒的提取(碱裂解法小量提取质粒)第76页
            3.1.3.4 溶液的配制第76-77页
        3.1.4 三角褐指藻基因组目的片段的PCR扩增第77页
        3.1.5 PCR产物琼脂糖凝胶回收(回收试剂盒)第77-78页
        3.1.6 pYC2 NT/C及PCR产物双酶切及产物纯化回收第78页
        3.1.7 连接反应第78-79页
        3.1.8 转化第79-80页
        3.1.9 阳性克隆的筛选与菌检第80页
        3.1.10 阳性克隆的测序第80-81页
    3.2 结果与讨论第81-86页
        3.2.1 三角褐指藻基因组DNA提取第81页
        3.2.2 SPO11及DMC1同源基因全长扩增第81-82页
        3.2.3 SPO11同源基因表达载体构建第82-83页
        3.2.4 DMC1同源基因表达载体构建第83-84页
        3.2.5. 表达载体检验第84-86页
    3.3 小结第86-87页
4 三角褐指藻(P.tricornutum)SPO11、DMC1同源基因在酵母(S.cerevisiae)中的功能验证第87-107页
    4.1 材料与方法第87-96页
        4.1.1 切除三角褐指藻SPO11-1、DMC1-9基因内含子第88-91页
            4.1.1.1 三角褐指藻SPO11-1、DMC1-9基因切除内含子原理第88-89页
            4.1.1.2 引物设计第89页
            4.1.1.3 切除内含子第89-90页
            4.1.1.4 DpnI酶切及延伸产物转化E.coli第90页
            4.1.1.5 挑阳性单克隆扩大培养、提质粒及产物检测第90-91页
            4.1.1.6 阳性克隆测序第91页
        4.1.2 三角褐指藻SPO11、DMC1同源基因在酵母中的功能验证第91-96页
            4.1.2.1 菌种、培养基和主要试剂第91-92页
            4.1.2.2 酵母突变株的鉴定第92-94页
            4.1.2.3 二倍体酵母突变株的获得第94页
            4.1.2.4 酵母二倍体突变株的流式细胞检测第94-95页
            4.1.2.5 酵母高效转化(醋酸锂转化法)第95页
            4.1.2.6 酵母转化株的产孢实验第95-96页
    4.2. 结果与讨论第96-106页
        4.2.1 三角褐指藻SPO11-1、DMC1-9基因内含子的切除第96-99页
            4.2.1.1 三角褐指藻SPO11-1、DMC1-9基因切除内含子RCR反应第96-97页
            4.2.1.2 内含子切除反应产物的DpnI酶切第97-98页
            4.2.1.3 阳性单克隆的扩大培养及质粒检测第98-99页
        4.2.2 三角褐指藻SPO11、DMC1同源基因功能验证第99-106页
            4.2.2.1 酵母突变株的鉴定第99-100页
            4.2.2.2 二倍体酵母突变株的获得及流式细胞检测第100-101页
            4.2.2.3 酵母spo11-/-突变株的产孢实验第101-104页
            4.2.2.4 酵母dmc1-/-突变株的产孢实验第104-106页
    4.3 小结第106-107页
5 结论第107-109页
参考文献第109-122页
附录第122-126页
致谢第126-127页
个人简历第127页
发表的学术论文第127页

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