| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第一章 引言 | 第9-16页 |
| 1.1 前列腺癌 | 第9页 |
| 1.2 前列腺癌的实验模型 | 第9-10页 |
| 1.3 肿瘤微环境对前列腺癌发生发展的影响 | 第10-12页 |
| 1.4 课题的研究内容和意义 | 第12-14页 |
| 1.5 生物信息学方法介绍 | 第14-16页 |
| 1.5.1 基因本体论分析 | 第14-15页 |
| 1.5.2 通路分析方法 | 第15-16页 |
| 第二章 前列腺癌实验模型的研究现状及数据准备 | 第16-26页 |
| 2.1 标本模型 | 第16-17页 |
| 2.2 细胞系模型 | 第17-21页 |
| 2.3 小鼠模型 | 第21-24页 |
| 2.4 实验数据的收集与整理 | 第24-26页 |
| 2.4.1 数据收集来源 | 第24页 |
| 2.4.2 数据分类整理 | 第24-26页 |
| 第三章 基因芯片数据预处理及差异表达基因的筛选 | 第26-35页 |
| 3.1 基因芯片数据预处理 | 第26-32页 |
| 3.1.1 数据提取及质量控制 | 第26-27页 |
| 3.1.2 背景校正、标准化和汇总 | 第27-28页 |
| 3.1.3 预处理的一体化算法 | 第28-32页 |
| 3.2 差异表达基因的统计学筛选 | 第32-35页 |
| 3.2.1 t检验 | 第33页 |
| 3.2.2 经验贝叶斯 | 第33-34页 |
| 3.2.3 方差分析 | 第34-35页 |
| 第四章 前列腺癌实验模型的比较分析 | 第35-63页 |
| 4.1 三种模型在激素依赖转化为激素非依赖过程中的差别 | 第35-49页 |
| 4.1.1 分子层次比较分析 | 第35-40页 |
| 4.1.2 网络层次比较分析 | 第40-49页 |
| 4.2 标本与细胞系模型在前列腺癌转移过程中的差别 | 第49-56页 |
| 4.2.1 分子层次比较分析 | 第49-52页 |
| 4.2.2 网络层次比较分析 | 第52-56页 |
| 4.3 标本与小鼠模型在转移性前列腺癌中的差别 | 第56-63页 |
| 4.3.1 分子层次比较分析 | 第56-59页 |
| 4.3.2 网络层次比较分析 | 第59-63页 |
| 第五章 总结与展望 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-76页 |
| 附录一 | 第76-80页 |
| 附录二 | 第80-84页 |
| 附录三 | 第84-88页 |
| 附录四 | 第88-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |