中文摘要 | 第3-5页 |
英文摘要 | 第5-6页 |
1 绪论 | 第9-19页 |
1.1 蛋白的正确折叠与错误折叠 | 第9-12页 |
1.1.1 蛋白的正确折叠 | 第9-10页 |
1.1.2 蛋白的错误折叠 | 第10-12页 |
1.2 多肽自组装应用价值 | 第12-13页 |
1.3 肽的定量序列-功效关系研究进展 | 第13-15页 |
1.4 本文研究思路及意义 | 第15-19页 |
2 原理与方法 | 第19-25页 |
2.1 定量序列-聚集关系建模 | 第19-21页 |
2.1.1 分子结构表征 | 第19页 |
2.1.2 定量序列聚集关系建模方法 | 第19-20页 |
2.1.3 模型验证与评价 | 第20-21页 |
2.2 分子动力学 | 第21-22页 |
2.2.1 分子动力学基本原理 | 第21-22页 |
2.2.2 分子力场 | 第22页 |
2.2.3 分子动力学一般流程 | 第22页 |
2.3 量子化学 | 第22-25页 |
2.3.1 量子化学基本原理 | 第22-23页 |
2.3.2 分子间相互作用能 | 第23页 |
2.3.3 自然键轨道理论 | 第23-25页 |
3 定量序列—聚集关系模型构建 | 第25-41页 |
3.1 数据来源与处理 | 第25-30页 |
3.1.1 数据来源 | 第25-29页 |
3.1.2 分子结构表征与模型构建 | 第29-30页 |
3.2 结果分析与讨论 | 第30-39页 |
3.2.1 基于FASGAI结构表征的SVM预测模型 | 第30-31页 |
3.2.2 基于NNAAIndex结构表征的SVM预测模型 | 第31-32页 |
3.2.3 基于FASGAI结构表征的其他预测模型 | 第32-35页 |
3.2.4 不同结构表征及方法建立模型对比评价 | 第35-37页 |
3.2.5 多肽聚集热点及关键因素讨论 | 第37-39页 |
3.3 小结 | 第39-41页 |
4 FASGAI—SVM模型用于多肽聚集特征的预测与评价 | 第41-57页 |
4.1 数据来源与处理 | 第41-43页 |
4.1.1 数据来源 | 第41-42页 |
4.1.2 分子结构表征与FASGAI—SVM模型预测 | 第42页 |
4.1.3 分子动力学与量子化学对多肽聚集性评价 | 第42-43页 |
4.2 结果分析与讨论 | 第43-55页 |
4.2.1 基于FASGAI— SVM的预测模型 | 第43-47页 |
4.2.2 基于分子动力学多肽聚集性评价 | 第47-50页 |
4.2.3 基于量子化学多肽聚集性评价 | 第50-52页 |
4.2.4 多肽聚集热点及关键因素讨论 | 第52-54页 |
4.2.5 不同环境下对多肽聚集性的影响 | 第54-55页 |
4.3 小结 | 第55-57页 |
5 FASGAI—SVM模型用于可聚集多肽的设计与理论验证 | 第57-69页 |
5.1 数据来源与处理 | 第57-58页 |
5.1.1 数据来源 | 第57页 |
5.1.2 分子结构表征与FASGAI—SVM模型预测 | 第57页 |
5.1.3 分子动力学与量子化学对多肽聚集性验证 | 第57-58页 |
5.2 结果分析与讨论 | 第58-67页 |
5.2.1 基于FASGAI—SVM的预测模型 | 第58-61页 |
5.2.2 基于分子动力学多肽聚集性验证 | 第61-63页 |
5.2.3 基于量子化学多肽聚集性验证 | 第63-65页 |
5.2.4 多肽聚集热点及关键因素讨论 | 第65-66页 |
5.2.5 不同环境下对多肽聚集性的影响 | 第66-67页 |
5.3 小结 | 第67-69页 |
6 结论与展望 | 第69-71页 |
6.1 结论 | 第69-70页 |
6.2 展望 | 第70-71页 |
致谢 | 第71-73页 |
参考文献 | 第73-83页 |
附录 | 第83页 |
A 作者在攻读硕士学位期间发表的论文和专利 | 第83页 |