基于调控路径的失调模块检测方法
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 符号对照表 | 第10-11页 |
| 缩略语对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-18页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第14-15页 |
| 1.2 研究现状 | 第15页 |
| 1.3 本文工作及论文组织结构 | 第15-18页 |
| 第二章 失调模块检测方法基础 | 第18-28页 |
| 2.1 相关生物数据 | 第18-20页 |
| 2.1.1 基因表达数据及GEO数据库 | 第18-20页 |
| 2.1.2 生物分子网络数据 | 第20页 |
| 2.2 基因差异表达分析方法 | 第20-23页 |
| 2.2.1 倍数改变分析 | 第20-21页 |
| 2.2.2 SAM | 第21-23页 |
| 2.3 失调模块检测方法 | 第23-28页 |
| 第三章 失调模块检测方法 | 第28-36页 |
| 3.1 基因表达数据预处理 | 第28-31页 |
| 3.1.1 数据的对数转换 | 第28页 |
| 3.1.2 缺失数据的填充 | 第28-29页 |
| 3.1.3 重复数据的合并 | 第29-31页 |
| 3.2 赋权差异调控网络构建 | 第31-33页 |
| 3.2.1 构建差异调控网络 | 第31页 |
| 3.2.2 调控强度打分 | 第31-33页 |
| 3.3 失调模块检测 | 第33-34页 |
| 3.3.1 以种子基因为核心的调控子系统构建 | 第33-34页 |
| 3.3.2 推导失调模块 | 第34页 |
| 3.4 失调模块评估 | 第34-36页 |
| 第四章 实验结果与分析 | 第36-46页 |
| 4.1 实验数据 | 第36页 |
| 4.2 结果验证及分析 | 第36-46页 |
| 4.2.1 实验结果 | 第36-43页 |
| 4.2.2 文献验证及分析 | 第43-46页 |
| 第五章 结论与展望 | 第46-48页 |
| 参考文献 | 第48-54页 |
| 致谢 | 第54-56页 |
| 作者简介 | 第56-57页 |
