| 摘要 | 第6-10页 |
| ABSTRACT | 第10-15页 |
| 符号说明 | 第16-20页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-46页 |
| 1.1 沙门氏菌 | 第20-23页 |
| 1.1.1 沙门氏菌生物学特征 | 第20-21页 |
| 1.1.2 沙门氏菌流行病学 | 第21-22页 |
| 1.1.3 沙门氏菌命名与分类 | 第22-23页 |
| 1.1.4 沙门氏菌血清分型 | 第23页 |
| 1.2 沙门氏菌血清组及其特异基因 | 第23-29页 |
| 1.2.1 沙门氏菌O抗原与血清组 | 第23-27页 |
| 1.2.2 基于比较基因组学的血清组特异基因的发掘 | 第27-29页 |
| 1.3 沙门氏菌C1血清组 | 第29-34页 |
| 1.3.1 沙门氏菌C1血清组特征 | 第29-30页 |
| 1.3.2 沙门氏菌C1血清组特异基因及其研究进展 | 第30-34页 |
| 1.4 沙门氏菌基因功能研究方法及现状 | 第34-44页 |
| 1.4.1 生物信息学预测基因功能 | 第34-35页 |
| 1.4.2 缺失突变验证基因功能 | 第35-36页 |
| 1.4.3 高通量技术发掘调控网络 | 第36-43页 |
| 1.4.4 RT-qPCR验证表达差异基因 | 第43-44页 |
| 1.5 研究的目的、意义及思路 | 第44-46页 |
| 1.5.1 研究目的及意义 | 第44页 |
| 1.5.2 研究思路 | 第44-46页 |
| 第二章 C1血清组特异基因SC2092的功能分析 | 第46-95页 |
| 2.1 材料与设备 | 第46-52页 |
| 2.1.1 菌株和质粒 | 第46页 |
| 2.1.2 主要培养基及其配制方法 | 第46-47页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第47-51页 |
| 2.1.4 工具酶与试剂盒 | 第51页 |
| 2.1.5 仪器设备与耗材 | 第51-52页 |
| 2.2 实验方法 | 第52-73页 |
| 2.2.1 C1血清组特异基因SC2092的生物信息学预测 | 第52-53页 |
| 2.2.2 SC2092基因缺失突变株的构建 | 第53-61页 |
| 2.2.3 沙门氏菌血清玻片凝集 | 第61-62页 |
| 2.2.4 沙门氏菌表面脂多糖（LPS）的鉴定 | 第62-63页 |
| 2.2.5 表型特征鉴定 | 第63-65页 |
| 2.2.6 菌体形态观察 | 第65-67页 |
| 2.2.7 反转录荧光定量PCR检测 | 第67-73页 |
| 2.3 结果与分析 | 第73-91页 |
| 2.3.1 生物信息学预测 | 第73-75页 |
| 2.3.2 C1血清组特异基因SC2092缺失突变株△wzxC1的构建 | 第75-80页 |
| 2.3.3 C1血清组特异基因SC2092与表面抗原的相关性分析 | 第80-81页 |
| 2.3.4 缺失突变株△wzxC1的表型特征检测 | 第81-87页 |
| 2.3.5 缺失突变株△wzxC1中与抗原合成及运动性相关基因的表达差异分析 | 第87-91页 |
| 2.4 小结与讨论 | 第91-95页 |
| 第三章 C1血清组特异基因SC0368与SC0595的功能分析 | 第95-132页 |
| 3.1 材料与设备 | 第95-97页 |
| 3.1.1 菌株和质粒 | 第95页 |
| 3.1.2 主要培养基及其配制方法 | 第95页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第95-96页 |
| 3.1.4 工具酶与试剂盒 | 第96-97页 |
| 3.1.5 仪器设备与耗材 | 第97页 |
| 3.2 实验方法 | 第97-104页 |
| 3.2.1 C1血清组特异基因SC0368与SC0595的生物信息学预测 | 第97页 |
| 3.2.2 SC0368与SC0595基因缺失突变株的构建 | 第97-99页 |
| 3.2.3 沙门氏菌血清玻片凝集 | 第99页 |
| 3.2.4 沙门氏菌菌体总蛋白的提取 | 第99页 |
| 3.2.5 沙门氏菌表面脂多糖（LPS）的鉴定 | 第99-100页 |
| 3.2.6 表型特征鉴定 | 第100-101页 |
| 3.2.7 菌体形态观察 | 第101页 |
| 3.2.8 RNAseq测定 | 第101-103页 |
| 3.2.9 RT-qPCR数据验证 | 第103-104页 |
| 3.3 结果与分析 | 第104-129页 |
| 3.3.1 生物信息学预测 | 第104-105页 |
| 3.3.2 C1血清组特异基因缺失突变株△0368、△0595与△0368△0595的构建 | 第105-108页 |
| 3.3.3 C1血清组特异基因SC0368、SC0595与表面抗原的相关性分析 | 第108-110页 |
| 3.3.4 缺失突变株△0368、△0595与△0368△0595的表型特征检测 | 第110-114页 |
| 3.3.5 野生型，突变株△0368、△0595与△0368△0595的RNA序列测定及分析 | 第114-129页 |
| 3.4 小结与讨论 | 第129-132页 |
| 第四章 结论与展望 | 第132-134页 |
| 4.1 主要结论 | 第132-133页 |
| 4.2 特色与创新 | 第133页 |
| 4.3 展望 | 第133-134页 |
| 参考 文献 | 第134-146页 |
| 附录 1 | 第146-147页 |
| 附录 2 | 第147-151页 |
| 附录 3 | 第151-153页 |
| 致谢 | 第153-155页 |
| 攻读学位期间已发表和准备中的学术论文 | 第155-156页 |
