前言 | 第4-5页 |
中文摘要 | 第5-9页 |
Abstract | 第9-13页 |
第1章 绪论 | 第18-28页 |
1.1 肺癌的流行病学概况 | 第18-19页 |
1.2 肺癌的基因多态性研究进展 | 第19-26页 |
1.2.1 肺癌易感性基因多态性研究 | 第20-23页 |
1.2.2 肺癌预后相关基因多态性研究 | 第23-25页 |
1.2.3 肺癌基因多态性研究展望 | 第25-26页 |
1.3 Notch通路研究基础 | 第26-28页 |
1.3.1 Notch通路简介 | 第26-27页 |
1.3.2 Notch通路与肿瘤发生发展相关的分子生物学研究 | 第27页 |
1.3.3 Notch通路与肿瘤相关的基因多态性研究 | 第27-28页 |
第2章 材料和方法 | 第28-42页 |
2.1 研究对象 | 第28-29页 |
2.1.1 PLCO数据库 | 第28页 |
2.1.2 基因型分型技术简介 | 第28-29页 |
2.2 确定Notch通路基因 | 第29-35页 |
2.2.1 基因来源 | 第29页 |
2.2.2 基因筛选 | 第29-30页 |
2.2.3 基因汇总 | 第30-35页 |
2.3 SNP选择策略 | 第35-37页 |
2.3.1 基因型填补 | 第35-36页 |
2.3.2 质量控制 | 第36页 |
2.3.3 多重假设检验校正 | 第36页 |
2.3.4 连锁不平衡分析 | 第36-37页 |
2.4 功能分析 | 第37-39页 |
2.4.1 In-silico功能预测 | 第37-39页 |
2.4.2 SNP基因型和基因表达相关性分析 | 第39页 |
2.4.3 TCGA数据库癌及癌旁组织基因表达差异性分析 | 第39页 |
2.5 生存数据分析 | 第39-41页 |
2.5.1 标签SNPs生存分析 | 第39-40页 |
2.5.2 组合分析 | 第40页 |
2.5.3 分层分析 | 第40-41页 |
2.5.4 异质性检验 | 第41页 |
2.6 应用软件及网站汇总 | 第41-42页 |
2.6.1 应用软件 | 第41页 |
2.6.2 应用网址 | 第41-42页 |
第3章 结果 | 第42-78页 |
3.1 PLCO数据库1185名NSCLC患者各临床变量与疾病总体生存期的相关性分析 | 第42-44页 |
3.2 Notch通路基因SNPs与NSCLC总体生存期相关性分析 | 第44-46页 |
3.2.1 实验流程图 | 第44-45页 |
3.2.2 Notch通路基因SNPs与NSCLC总体生存期多变量分析 | 第45-46页 |
3.3 选择标签SNPs | 第46-52页 |
3.3.1 筛选可以影响基因m RNA表达的SNPs | 第46-48页 |
3.3.2 连锁分析 | 第48页 |
3.3.3 In-silico功能预测结果 | 第48-49页 |
3.3.4 标签SNPs确定 | 第49-52页 |
3.4 标签SNPs与NSCLC总体生存期相关性分析 | 第52-55页 |
3.4.1 标签SNPs与NSCLC总体生存期单变量分析 | 第52-54页 |
3.4.2 标签SNPs与NSCLC总体生存期多变量分析 | 第54-55页 |
3.5 单体型(Haplotype)分析 | 第55-56页 |
3.6 组合分析 | 第56-58页 |
3.6.1 单变量分析 | 第56-58页 |
3.6.2 多变量分析 | 第58页 |
3.7 分层分析 | 第58-73页 |
3.7.1 每个标签SNP分层分析 | 第58-69页 |
3.7.2 标签SNPs组合后分层分析 | 第69-73页 |
3.8 Receiver operating characteristic(ROC)曲线 | 第73-74页 |
3.9 功能分析 | 第74-78页 |
3.9.1 SNP-基因表达分析 | 第74-75页 |
3.9.2 基因在癌及癌旁组织的表达分析 | 第75-78页 |
第4章 讨论 | 第78-86页 |
4.1 本研究对Notch通路的研究发现 | 第78-79页 |
4.2 ADAM12基因对NSCLC预后的新发现 | 第79-80页 |
4.3 DTX1基因对NSCLC预后的新发现 | 第80-81页 |
4.4 TLE1基因对NSCLC预后的新发现 | 第81-83页 |
4.5 E2F3基因对NSCLC预后的新发现 | 第83-84页 |
4.6 本研究的局限性 | 第84-86页 |
第5章 结论 | 第86-88页 |
参考文献 | 第88-100页 |
作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第100-102页 |
致谢 | 第102页 |