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Notch信号传导通路基因多态性与非小细胞肺癌总体生存期的关联性研究

前言第4-5页
中文摘要第5-9页
Abstract第9-13页
第1章 绪论第18-28页
    1.1 肺癌的流行病学概况第18-19页
    1.2 肺癌的基因多态性研究进展第19-26页
        1.2.1 肺癌易感性基因多态性研究第20-23页
        1.2.2 肺癌预后相关基因多态性研究第23-25页
        1.2.3 肺癌基因多态性研究展望第25-26页
    1.3 Notch通路研究基础第26-28页
        1.3.1 Notch通路简介第26-27页
        1.3.2 Notch通路与肿瘤发生发展相关的分子生物学研究第27页
        1.3.3 Notch通路与肿瘤相关的基因多态性研究第27-28页
第2章 材料和方法第28-42页
    2.1 研究对象第28-29页
        2.1.1 PLCO数据库第28页
        2.1.2 基因型分型技术简介第28-29页
    2.2 确定Notch通路基因第29-35页
        2.2.1 基因来源第29页
        2.2.2 基因筛选第29-30页
        2.2.3 基因汇总第30-35页
    2.3 SNP选择策略第35-37页
        2.3.1 基因型填补第35-36页
        2.3.2 质量控制第36页
        2.3.3 多重假设检验校正第36页
        2.3.4 连锁不平衡分析第36-37页
    2.4 功能分析第37-39页
        2.4.1 In-silico功能预测第37-39页
        2.4.2 SNP基因型和基因表达相关性分析第39页
        2.4.3 TCGA数据库癌及癌旁组织基因表达差异性分析第39页
    2.5 生存数据分析第39-41页
        2.5.1 标签SNPs生存分析第39-40页
        2.5.2 组合分析第40页
        2.5.3 分层分析第40-41页
        2.5.4 异质性检验第41页
    2.6 应用软件及网站汇总第41-42页
        2.6.1 应用软件第41页
        2.6.2 应用网址第41-42页
第3章 结果第42-78页
    3.1 PLCO数据库1185名NSCLC患者各临床变量与疾病总体生存期的相关性分析第42-44页
    3.2 Notch通路基因SNPs与NSCLC总体生存期相关性分析第44-46页
        3.2.1 实验流程图第44-45页
        3.2.2 Notch通路基因SNPs与NSCLC总体生存期多变量分析第45-46页
    3.3 选择标签SNPs第46-52页
        3.3.1 筛选可以影响基因m RNA表达的SNPs第46-48页
        3.3.2 连锁分析第48页
        3.3.3 In-silico功能预测结果第48-49页
        3.3.4 标签SNPs确定第49-52页
    3.4 标签SNPs与NSCLC总体生存期相关性分析第52-55页
        3.4.1 标签SNPs与NSCLC总体生存期单变量分析第52-54页
        3.4.2 标签SNPs与NSCLC总体生存期多变量分析第54-55页
    3.5 单体型(Haplotype)分析第55-56页
    3.6 组合分析第56-58页
        3.6.1 单变量分析第56-58页
        3.6.2 多变量分析第58页
    3.7 分层分析第58-73页
        3.7.1 每个标签SNP分层分析第58-69页
        3.7.2 标签SNPs组合后分层分析第69-73页
    3.8 Receiver operating characteristic(ROC)曲线第73-74页
    3.9 功能分析第74-78页
        3.9.1 SNP-基因表达分析第74-75页
        3.9.2 基因在癌及癌旁组织的表达分析第75-78页
第4章 讨论第78-86页
    4.1 本研究对Notch通路的研究发现第78-79页
    4.2 ADAM12基因对NSCLC预后的新发现第79-80页
    4.3 DTX1基因对NSCLC预后的新发现第80-81页
    4.4 TLE1基因对NSCLC预后的新发现第81-83页
    4.5 E2F3基因对NSCLC预后的新发现第83-84页
    4.6 本研究的局限性第84-86页
第5章 结论第86-88页
参考文献第88-100页
作者简介及在学期间所取得的科研成果第100-102页
致谢第102页

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