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大白菜细胞核雄性不育相关基因挖掘与鉴定

摘要第10-12页
ABSTRACT第12-14页
缩略词表第15-17页
前言第17-18页
第一章 文献综述第18-32页
    1.1 植物雄性不育的研究概况第18-20页
        1.1.1 植物雄性不育的起源第18页
        1.1.2 植物雄性不育的类型第18-19页
        1.1.3 十字花科植物雄性不育第19-20页
    1.2 植物雄性不育的生理生化研究进展第20-23页
        1.2.1 植物雄性不育与物质代谢第20-21页
        1.2.2 植物雄性不育与能量代谢第21-22页
        1.2.3 植物雄性不育与内源激素第22-23页
    1.3 植物雄性不育在细胞水平上的研究第23-24页
        1.3.1 植物雄性不育系花器官形态特征第23页
        1.3.2 植物雄性不育的细胞学观察第23-24页
    1.4 植物雄性不育相关基因研究进展第24-26页
        1.4.1 植物细胞核雄性不育相关基因第24页
        1.4.2 拟南芥花药和花粉发育相关基因第24-25页
        1.4.3 十字花科植物花药和花粉发育相关基因第25-26页
    1.5 植物雄性不育的转录组分析第26-29页
        1.5.1 转录组测序技术的发展第26-27页
        1.5.2 RNA-seq技术测序流程第27-28页
        1.5.3 RNA-seq技术在植物雄性不育研究中的应用第28-29页
    1.6 植物雄性不育的蛋白质组分析第29-31页
        1.6.1 蛋白质组相关分离技术第29页
        1.6.2 iTRAQ技术实验原理第29-31页
        1.6.3 iTRAQ技术在植物雄性不育研究中的应用第31页
    1.7 本研究的目的与意义第31-32页
第二章 大白菜雄性不育两用系'AB01'花蕾转录组分析第32-62页
    2.1 材料与方法第32-38页
        2.1.1 植物材料第32页
        2.1.2 石蜡切片第32-33页
        2.1.3 RNA样品制备第33-34页
        2.1.4 RNA质量检测第34页
        2.1.5 cDNA文库构建和Illumina测序第34页
        2.1.6 转录组测序分析第34-35页
        2.1.7 RNA反转录第35-36页
        2.1.8 qRT-PCR检测第36页
        2.1.9 DNA提取与PCR第36-37页
        2.1.10 原位杂交第37-38页
    2.2 结果与分析第38-61页
        2.2.1 可育株与不育株花器官表型特征第38-40页
        2.2.2 RNA-seq数据与参考基因组比对结果第40-42页
        2.2.3 基因表达水平的分析第42-43页
        2.2.4 可育株与不育株花蕾的差异表达基因第43-45页
        2.2.5 花粉壁发育相关的差异表达基因第45页
        2.2.6 内源激素相关的差异表达基因第45页
        2.2.7 差异表达的转录因子相关基因第45-50页
        2.2.8 差异表达基因的GO功能注释和KEGG Pathway富集分析第50-53页
        2.2.9 差异表达基因的qRT-PCR验证第53-57页
        2.2.10 原位杂交检测结果第57-61页
    2.3 小结第61-62页
第三章 大白菜雄性不育两用系'AB01'花蕾蛋白质组分析第62-84页
    3.1 材料与方法第62-65页
        3.1.1 植物材料第62页
        3.1.2 六种蛋白质提取方法第62-64页
        3.1.3 可育株与不育株花蕾蛋白质提取第64页
        3.1.4 SDS电泳第64页
        3.1.5 蛋白质的酶解第64页
        3.1.6 iTRAQ试剂的标记第64页
        3.1.7 SCX液相分离肽段第64页
        3.1.8 Triple TOF 5600的LC-EST-MSMS分析第64页
        3.1.9 生物信息学分析第64页
        3.1.10 qRT-PCR验证第64-65页
    3.2 结果与分析第65-82页
        3.2.1 蛋白质样品浓度检测第65-66页
        3.2.2 蛋白质提取方法的2-DE图谱比较分析第66-67页
        3.2.3 蛋白质样品的检测第67-68页
        3.2.4 蛋白质质量评估第68-69页
        3.2.5 蛋白质鉴定第69页
        3.2.6 蛋白质相对分子质量检测第69页
        3.2.7 肽段序列覆盖度分布第69-70页
        3.2.8 差异表达蛋白的筛选第70-73页
        3.2.9 花粉壁发育相关的差异表达蛋白第73-74页
        3.2.10 位于A07染色体位点差异表达分析第74-76页
        3.2.11 GO功能注释第76页
        3.2.12 COG注释第76页
        3.2.13 KEGG Pathway分析第76-79页
        3.2.14 差异表达蛋白的GO功能注释第79页
        3.2.15 差异表达蛋白的KEGG Pathway富集分析第79-81页
        3.2.16 差异表达蛋白的表达模式验证第81-82页
    3.3 小结第82-84页
第四章 大白菜雄性不育两用系'AB01'花蕾转录组与蛋白质组关联分析第84-95页
    4.1 材料与方法第84页
        4.1.1 植物材料第84页
        4.1.2 差异表达基因与差异表达蛋白的关联性分析第84页
        4.1.3 GO功能注释和KEGG Pathway富集分析第84页
    4.2 结果与分析第84-93页
        4.2.1 转录组与蛋白质组关联比对结果第84页
        4.2.2 差异表达基因与差异表达蛋白的关联性分析结果第84-89页
        4.2.3 差异表达基因与差异表达蛋白的GO功能分类第89-91页
        4.2.4 差异表达基因与差异表达蛋白的KEGG Pathway富集分析第91-93页
    4.3 小结第93-95页
讨论第95-100页
结论第100-101页
参考文献第101-114页
附录第114-123页
致谢第123-124页
攻读学位期间发表的学术论文第124-125页

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