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北极新奥尔松地区土壤微生物多样性初步分析

摘要第2-3页
Abstract第3页
第一章 文献综述第7-19页
    1.1 引言第7页
    1.2 北极土壤微生物研究现状第7-12页
        1.2.1 北极简介第7-8页
        1.2.2 北极土壤第8-9页
        1.2.3 土壤微生物第9-10页
        1.2.4 北极土壤微生物研究现状第10-12页
    1.3 土壤微生物多样性研究方法第12-16页
        1.3.1 显微镜观察第13页
        1.3.2 生物化学法第13页
        1.3.3 分子生物学技术第13页
        1.3.4 PCR—指纹识别技术第13-14页
        1.3.5 分子杂交技术第14页
        1.3.6 测序技术第14页
        1.3.7 阵列技术第14-15页
        1.3.8 第二代测序技术和平台第15页
        1.3.9 发展与展望第15-16页
    1.4 研究背景及意义第16-19页
        1.4.1 研究背景第16页
        1.4.2 研究区域选择第16-17页
        1.4.3 研究方法第17页
        1.4.4 研究意义第17-19页
第二章 土壤可培养微生物多样性系统发育分析第19-35页
    2.1 土壤样品采集第19-21页
        2.1.1 采样地点第19-20页
        2.1.2 采样第20-21页
        2.1.3 仪器及试剂第21页
    2.2 可培养微生物的分离培养第21-23页
        2.2.1 培养基第21-22页
        2.2.2 菌悬液制备第22页
        2.2.3 涂布第22页
        2.2.4 计数及菌落描述第22页
        2.2.5 分离纯化第22-23页
        2.2.6 菌种保存第23页
    2.3 菌种初步鉴定第23-24页
        2.3.1 DNA提取第23页
        2.3.2 PCR扩增第23-24页
        2.3.3 测序及分析第24页
    2.4 可培养细菌实验结果第24-30页
        2.4.1 各站位可培养细菌计数统计第24-25页
        2.4.2 菌株的分离纯化与形态观察第25-27页
        2.4.3 16SrRNA测序和系统发育分析第27-30页
    2.5 可培养真菌实验结果第30-33页
        2.5.1 各站位可培养细菌计数统计第30页
        2.5.2 菌株的分离纯化与形态观察第30-31页
        2.5.3 ITS区测序和系统发育分析第31-33页
    2.6 讨论第33-35页
第三章 454高通量测序技术对北极不同植物根际土壤细菌多样性分析第35-54页
    3.1 454高通量测序技术简介第35页
    3.2 研究方法第35-39页
        3.2.1 土壤样品采集第35-37页
        3.2.2 土壤理化性质测定第37页
        3.2.3 DNA提取第37-38页
        3.2.4 PCR扩增、凝胶回收和454高通量测序第38-39页
        3.2.5 测序结果分析方法第39页
    3.3 结果第39-49页
        3.3.1 土壤理化性质第39-40页
        3.3.2 高通量测序结果第40-42页
        3.3.3 细菌多样性和群落结构的分析第42-46页
        3.3.4 不同影响因素对土壤中细菌群落结构的作用第46-49页
    3.4 讨论第49-54页
        3.4.1 典型站位土壤细菌群落结构第49-51页
        3.4.2 细菌群落结构与环境因子第51-52页
        3.4.3 总结第52-54页
结论第54-55页
参考文献第55-64页
攻读学位期间的研究成果第64-65页
致谢第65-66页

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