摘要 | 第2-3页 |
Abstract | 第3页 |
第一章 文献综述 | 第7-19页 |
1.1 引言 | 第7页 |
1.2 北极土壤微生物研究现状 | 第7-12页 |
1.2.1 北极简介 | 第7-8页 |
1.2.2 北极土壤 | 第8-9页 |
1.2.3 土壤微生物 | 第9-10页 |
1.2.4 北极土壤微生物研究现状 | 第10-12页 |
1.3 土壤微生物多样性研究方法 | 第12-16页 |
1.3.1 显微镜观察 | 第13页 |
1.3.2 生物化学法 | 第13页 |
1.3.3 分子生物学技术 | 第13页 |
1.3.4 PCR—指纹识别技术 | 第13-14页 |
1.3.5 分子杂交技术 | 第14页 |
1.3.6 测序技术 | 第14页 |
1.3.7 阵列技术 | 第14-15页 |
1.3.8 第二代测序技术和平台 | 第15页 |
1.3.9 发展与展望 | 第15-16页 |
1.4 研究背景及意义 | 第16-19页 |
1.4.1 研究背景 | 第16页 |
1.4.2 研究区域选择 | 第16-17页 |
1.4.3 研究方法 | 第17页 |
1.4.4 研究意义 | 第17-19页 |
第二章 土壤可培养微生物多样性系统发育分析 | 第19-35页 |
2.1 土壤样品采集 | 第19-21页 |
2.1.1 采样地点 | 第19-20页 |
2.1.2 采样 | 第20-21页 |
2.1.3 仪器及试剂 | 第21页 |
2.2 可培养微生物的分离培养 | 第21-23页 |
2.2.1 培养基 | 第21-22页 |
2.2.2 菌悬液制备 | 第22页 |
2.2.3 涂布 | 第22页 |
2.2.4 计数及菌落描述 | 第22页 |
2.2.5 分离纯化 | 第22-23页 |
2.2.6 菌种保存 | 第23页 |
2.3 菌种初步鉴定 | 第23-24页 |
2.3.1 DNA提取 | 第23页 |
2.3.2 PCR扩增 | 第23-24页 |
2.3.3 测序及分析 | 第24页 |
2.4 可培养细菌实验结果 | 第24-30页 |
2.4.1 各站位可培养细菌计数统计 | 第24-25页 |
2.4.2 菌株的分离纯化与形态观察 | 第25-27页 |
2.4.3 16SrRNA测序和系统发育分析 | 第27-30页 |
2.5 可培养真菌实验结果 | 第30-33页 |
2.5.1 各站位可培养细菌计数统计 | 第30页 |
2.5.2 菌株的分离纯化与形态观察 | 第30-31页 |
2.5.3 ITS区测序和系统发育分析 | 第31-33页 |
2.6 讨论 | 第33-35页 |
第三章 454高通量测序技术对北极不同植物根际土壤细菌多样性分析 | 第35-54页 |
3.1 454高通量测序技术简介 | 第35页 |
3.2 研究方法 | 第35-39页 |
3.2.1 土壤样品采集 | 第35-37页 |
3.2.2 土壤理化性质测定 | 第37页 |
3.2.3 DNA提取 | 第37-38页 |
3.2.4 PCR扩增、凝胶回收和454高通量测序 | 第38-39页 |
3.2.5 测序结果分析方法 | 第39页 |
3.3 结果 | 第39-49页 |
3.3.1 土壤理化性质 | 第39-40页 |
3.3.2 高通量测序结果 | 第40-42页 |
3.3.3 细菌多样性和群落结构的分析 | 第42-46页 |
3.3.4 不同影响因素对土壤中细菌群落结构的作用 | 第46-49页 |
3.4 讨论 | 第49-54页 |
3.4.1 典型站位土壤细菌群落结构 | 第49-51页 |
3.4.2 细菌群落结构与环境因子 | 第51-52页 |
3.4.3 总结 | 第52-54页 |
结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-64页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第64-65页 |
致谢 | 第65-66页 |