摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第11-18页 |
1.1 研究背景和意义 | 第11页 |
1.2 国内外细胞凋亡蛋白质亚细胞定位预测研究现状及分析 | 第11-13页 |
1.3 细胞凋亡简介 | 第13-15页 |
1.4 细胞的结构与功能简介 | 第15-17页 |
1.5 论文结构安排 | 第17-18页 |
第二章 特征参数提取与分类预测算法 | 第18-30页 |
2.1 引言 | 第18页 |
2.2 蛋白质序列特征提取 | 第18-24页 |
2.2.1 氨基酸n肽组分信息 | 第18-19页 |
2.2.2 蛋白质骨架信息 | 第19-20页 |
2.2.3 氨基酸物理化学特性 | 第20-22页 |
2.2.4 氨基酸粘性信息 | 第22-23页 |
2.2.5 进化信息 | 第23-24页 |
2.3 mRNA序列及二级结构特征提取 | 第24-25页 |
2.3.1 k-mer mRNA序列信息 | 第24-25页 |
2.3.2 mRNA二级结构-序列模式信息 | 第25页 |
2.4 预测算法 | 第25-29页 |
2.4.1 支持向量机(SVM)算法 | 第25-26页 |
2.4.2 多定位离散增量(ID)算法 | 第26-28页 |
2.4.3 算法评价 | 第28-29页 |
2.5 小结 | 第29-30页 |
第三章 单定位细胞凋亡蛋白质的预测分析 | 第30-39页 |
3.1 引言 | 第30页 |
3.2 数据集 | 第30-33页 |
3.2.1 对CL317数据集的重新统计 | 第30-31页 |
3.2.2 数据集的构建 | 第31-33页 |
3.3 特征参数对预测结果的影响 | 第33-36页 |
3.3.1 三阅读框下3-mer mRNA序列信息对预测结果的影响 | 第33-34页 |
3.3.2 mRNA二级结构-序列模式信息对预测结果的影响 | 第34页 |
3.3.3 物理化学性质对预测结果的影响 | 第34-35页 |
3.3.4 氨基酸粘性信息对预测结果的影响 | 第35页 |
3.3.5 进化信息对预测结果的影响 | 第35-36页 |
3.4 结果与讨论 | 第36-38页 |
3.4.1 基于Jackknife检验预测结果比较 | 第36-38页 |
3.4.2 融合特征的独立检验预测结果 | 第38页 |
3.5 小结 | 第38-39页 |
第四章 多定位细胞凋亡蛋白质的预测分析 | 第39-46页 |
4.1 引言 | 第39页 |
4.2 数据集 | 第39-41页 |
4.3 特征参数的筛选 | 第41-42页 |
4.4 结果与讨论 | 第42-45页 |
4.4.1 氨基酸二肽组分信息对预测结果的影响 | 第42页 |
4.4.2 蛋白质骨架特性对预测结果的影响 | 第42-43页 |
4.4.3 氨基酸物理化学特性对预测结果的影响 | 第43-44页 |
4.4.4 进化信息对预测结果的影响 | 第44页 |
4.4.5 融合特征对预测结果的影响 | 第44-45页 |
4.5 小结 | 第45-46页 |
第五章 总结与展望 | 第46-48页 |
5.1 论文工作总结 | 第46页 |
5.2 工作展望 | 第46-48页 |
参考文献 | 第48-55页 |
附录 | 第55-60页 |
致谢 | 第60-61页 |
作者攻读硕士学位期间发表和完成的论文目录 | 第61页 |