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基于mRNA等融合特征的单定位和多定位细胞凋亡蛋白质亚细胞定位预测

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第11-18页
    1.1 研究背景和意义第11页
    1.2 国内外细胞凋亡蛋白质亚细胞定位预测研究现状及分析第11-13页
    1.3 细胞凋亡简介第13-15页
    1.4 细胞的结构与功能简介第15-17页
    1.5 论文结构安排第17-18页
第二章 特征参数提取与分类预测算法第18-30页
    2.1 引言第18页
    2.2 蛋白质序列特征提取第18-24页
        2.2.1 氨基酸n肽组分信息第18-19页
        2.2.2 蛋白质骨架信息第19-20页
        2.2.3 氨基酸物理化学特性第20-22页
        2.2.4 氨基酸粘性信息第22-23页
        2.2.5 进化信息第23-24页
    2.3 mRNA序列及二级结构特征提取第24-25页
        2.3.1 k-mer mRNA序列信息第24-25页
        2.3.2 mRNA二级结构-序列模式信息第25页
    2.4 预测算法第25-29页
        2.4.1 支持向量机(SVM)算法第25-26页
        2.4.2 多定位离散增量(ID)算法第26-28页
        2.4.3 算法评价第28-29页
    2.5 小结第29-30页
第三章 单定位细胞凋亡蛋白质的预测分析第30-39页
    3.1 引言第30页
    3.2 数据集第30-33页
        3.2.1 对CL317数据集的重新统计第30-31页
        3.2.2 数据集的构建第31-33页
    3.3 特征参数对预测结果的影响第33-36页
        3.3.1 三阅读框下3-mer mRNA序列信息对预测结果的影响第33-34页
        3.3.2 mRNA二级结构-序列模式信息对预测结果的影响第34页
        3.3.3 物理化学性质对预测结果的影响第34-35页
        3.3.4 氨基酸粘性信息对预测结果的影响第35页
        3.3.5 进化信息对预测结果的影响第35-36页
    3.4 结果与讨论第36-38页
        3.4.1 基于Jackknife检验预测结果比较第36-38页
        3.4.2 融合特征的独立检验预测结果第38页
    3.5 小结第38-39页
第四章 多定位细胞凋亡蛋白质的预测分析第39-46页
    4.1 引言第39页
    4.2 数据集第39-41页
    4.3 特征参数的筛选第41-42页
    4.4 结果与讨论第42-45页
        4.4.1 氨基酸二肽组分信息对预测结果的影响第42页
        4.4.2 蛋白质骨架特性对预测结果的影响第42-43页
        4.4.3 氨基酸物理化学特性对预测结果的影响第43-44页
        4.4.4 进化信息对预测结果的影响第44页
        4.4.5 融合特征对预测结果的影响第44-45页
    4.5 小结第45-46页
第五章 总结与展望第46-48页
    5.1 论文工作总结第46页
    5.2 工作展望第46-48页
参考文献第48-55页
附录第55-60页
致谢第60-61页
作者攻读硕士学位期间发表和完成的论文目录第61页

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