全基因组重测序筛选山羊经济性状候选基因
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-25页 |
| 1.1 DNA测序的发展 | 第11-13页 |
| 1.2 山羊经济性状研究进展 | 第13-17页 |
| 1.2.1 被毛性状 | 第14-16页 |
| 1.2.2 繁殖性能 | 第16-17页 |
| 1.3 自然选择与选择信号 | 第17-21页 |
| 1.3.1 选择模式 | 第17-18页 |
| 1.3.2 选择信号检测方法 | 第18-20页 |
| 1.3.3 山羊选择信号研究进展 | 第20-21页 |
| 1.4 展望 | 第21-25页 |
| 1.4.1 古DNA | 第22页 |
| 1.4.2 结构变异 | 第22页 |
| 1.4.3 多组学 | 第22-25页 |
| 第二章 引言 | 第25-27页 |
| 2.1 研究目的和意义 | 第25-26页 |
| 2.2 技术路线 | 第26-27页 |
| 第三章 实验材料和方法 | 第27-31页 |
| 3.1 实验动物 | 第27页 |
| 3.2 实验方法 | 第27-31页 |
| 3.2.1 DNA提取 | 第27页 |
| 3.2.2 全基因组重测序 | 第27-28页 |
| 3.2.3 变异检测 | 第28页 |
| 3.2.4 群体结构分析 | 第28页 |
| 3.2.5 变异比较分析 | 第28页 |
| 3.2.6 选择信号检测 | 第28-31页 |
| 第四章 结果与分析 | 第31-49页 |
| 4.1 DNA提取结果 | 第31页 |
| 4.2 重测序测序结果 | 第31页 |
| 4.3 SNPs检测结果 | 第31-32页 |
| 4.4 群体结构分析 | 第32-37页 |
| 4.5 变异比较分析 | 第37页 |
| 4.6 选择信号 | 第37-49页 |
| 4.6.1 Hp计算结果 | 第38-41页 |
| 4.6.2 Fst计算结果 | 第41-43页 |
| 4.6.3 受选择区域筛选结果 | 第43-46页 |
| 4.6.4 候选基因或位点分析 | 第46-49页 |
| 第五章 讨论 | 第49-57页 |
| 5.1 基因组测序 | 第49-50页 |
| 5.2 群体结构 | 第50页 |
| 5.3 变异比较分析 | 第50-51页 |
| 5.3.1 毛色 | 第51页 |
| 5.4 选择信号 | 第51-57页 |
| 5.4.1 毛长 | 第52-53页 |
| 5.4.2 繁殖性状 | 第53-54页 |
| 5.4.3 环境适应性 | 第54-57页 |
| 第六章 结论 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-71页 |
| 致谢 | 第71-73页 |
| 发表论文及参加课题一览表 | 第73-75页 |
| 附录 | 第75-93页 |
