| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 縮略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| ·棉花水分胁迫研究进展 | 第12-17页 |
| ·植物miRNA与水分胁迫研究进展 | 第17-19页 |
| ·基于高通量的功能基因组学研究方法 | 第19-24页 |
| ·基于生物芯片的研究方法 | 第20-21页 |
| ·基于RNA-seq的研究方法 | 第21-23页 |
| ·基于小RNA测序的研究方法 | 第23-24页 |
| ·研究意义和目的 | 第24-26页 |
| 第二章 陆地棉根部应答盐胁迫的表达谱分析 | 第26-52页 |
| ·引言 | 第26页 |
| ·实验材料与方法 | 第26-32页 |
| ·实验材料 | 第26-27页 |
| ·相对电导率测量方法 | 第27页 |
| ·盐胁迫处理与总RNA提取 | 第27-28页 |
| ·芯片实验与数据分析 | 第28-29页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第29-32页 |
| ·棉花基因转拟南芥 | 第32页 |
| ·结果与分析 | 第32-49页 |
| ·挑选合适的盐浓度和胁迫时间点 | 第32-33页 |
| ·芯片质量控制与差异表达分析 | 第33-34页 |
| ·GO功能富集分析 | 第34-36页 |
| ·转录因子分析,JA与乙烯代谢途径 | 第36-39页 |
| ·实时荧光定量PCR验证 | 第39-43页 |
| ·陆地棉与拟南芥根部响应盐胁迫表达谱比较 | 第43-47页 |
| ·陆地棉与拟南芥根部响应盐胁迫的与植物激素信号途径相关的基因的比较 | 第47页 |
| ·候选基因的选择及克隆 | 第47-49页 |
| ·讨论 | 第49-52页 |
| 第三章 亚洲棉响应水分胁迫的小RNA表达谱分析 | 第52-78页 |
| ·引言 | 第52页 |
| ·实验材料与方法 | 第52-60页 |
| ·实验材料 | 第52页 |
| ·棉花培养、胁迫处理及取材、总RNA提取 | 第52-53页 |
| ·小RNA测序及数据分析 | 第53-56页 |
| ·实时荧光定量PCR验证miRNA表达模式 | 第56-60页 |
| ·结果与分析 | 第60-74页 |
| ·小RNA测序结果 | 第60页 |
| ·小RNA分类注释 | 第60-63页 |
| ·已知miRNA表达谱构建及差异分析 | 第63-64页 |
| ·已知miRNA表达模式分析 | 第64-68页 |
| ·实时荧光定量PCR验证miRNA表达模式 | 第68-70页 |
| ·已知miRNA的靶基因预测 | 第70-72页 |
| ·已知miRNA靶基因的GO注释 | 第72-73页 |
| ·新的miRNA及其靶基因预测 | 第73-74页 |
| ·讨论 | 第74-78页 |
| 第四章 结论与展望 | 第78-80页 |
| ·结论 | 第78-79页 |
| ·展望 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-90页 |
| 致谢 | 第90-92页 |
| 附录 | 第92-134页 |
| 作者简历 | 第134页 |