致谢 | 第1-6页 |
摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-12页 |
第一章 引言 | 第12-21页 |
·电离辐射 | 第12-13页 |
·电离辐射对人体的损伤 | 第12-13页 |
·细胞对电离辐射的应答机制 | 第13页 |
·长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lnc RNA) | 第13-18页 |
·lnc RNA简介 | 第13-14页 |
·lnc RNA的调控方式 | 第14-16页 |
·lnc RNA的研究思路和方法 | 第16-18页 |
·电离辐射应答lnc RNA研究计划 | 第18-21页 |
·lnc RNA-Seq高通量测序技术的使用 | 第18-19页 |
·lnc RNA的筛选和不同条件的验证 | 第19-21页 |
第二章 材料与方法 | 第21-31页 |
·实验材料 | 第21-23页 |
·主要试剂材料 | 第21页 |
·仪器设备 | 第21-23页 |
·实验方法 | 第23-31页 |
·细胞培养 | 第23页 |
·X射线和重离子辐照处理 | 第23页 |
·总RNA的提取 | 第23-24页 |
·RNA反转录 | 第24-25页 |
·实时荧光定量PCR(q RT-PCR) | 第25-26页 |
·lnc RNA高通量测序和生物信息学分析 | 第26-30页 |
·数据处理 | 第30-31页 |
第三章 实验结果 | 第31-54页 |
·He La细胞接受X射线辐照后lnc RNA高通量测序 | 第31-38页 |
·lnc RNA高通量测序流程 | 第31-33页 |
·lnc RNA预测 | 第33-38页 |
·测序结果分析 | 第38-39页 |
·lnc RNA表达量差异性比对结果 | 第38-39页 |
·lnc RNA转录本的分类和注释结果 | 第39页 |
·测序结果的q RT-PCR验证 | 第39-41页 |
·辐照后不同时间点和剂量点lnc RNA表达 | 第41-46页 |
·离子辐照对lnc RNA表达量的影响 | 第46-48页 |
·不同细胞系对电离辐照的应答 | 第48-54页 |
·四种细胞系分别接受X射线辐照后lnc RNA表达量变化结果比较 | 第48-50页 |
·四种细胞系分别接受碳离子辐照后lnc RNA表达量变化结果比较 | 第50-52页 |
·四种细胞系分别接受铁离子辐照后lnc RNA表达量变化结果比较 | 第52-54页 |
第四章 总结与讨论 | 第54-57页 |
·结论 | 第54页 |
·讨论 | 第54-56页 |
·后续工作计划 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-63页 |
附录一 引物序列 | 第63-65页 |
附录二 发表文章 | 第65页 |