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基于连锁不平衡的籼稻核心种质资源源、库相关性状的关联分析

摘要第1-11页
Abstract第11-14页
第一章 文献综述第14-30页
   ·水稻源、库的研究进展第14-22页
     ·水稻源、库的概念及衡量指标第14页
     ·水稻源、库的衡量指标第14-16页
     ·水稻源、库类型划分第16-17页
     ·水稻源、库对产量形成的影响第17-19页
     ·水稻源、库理论的应用第19-21页
     ·水稻源、库理论研究展望第21-22页
   ·关联分析第22-28页
     ·关联分析的原理第22-25页
     ·关联分析的方法第25-26页
     ·关联分析的特点第26-27页
     ·关联分析在水稻中的应用第27-28页
   ·本研究的目的意义第28-29页
   ·技术路线第29-30页
第二章 籼稻种质资源源库相关性状的聚类分析第30-52页
   ·材料与方法第30-31页
     ·供试材料第30页
     ·试验方法第30页
     ·田间性状调查第30-31页
     ·数据统计分析第31页
   ·结果与分析第31-47页
     ·不同地点间水稻源库相关性状的差异分析第31页
     ·不同地点间水稻源库相关性状的相关分析第31-35页
     ·水稻源库相关性状的主成分分析第35-38页
     ·基于主成分的水稻源库相关性状的综合评价第38-40页
     ·基于主成分的水稻源库特性聚类分析第40-45页
     ·不同源库类型干物质积累与分配特征第45-47页
   ·讨论第47-49页
   ·本章结论第49-52页
第三章 籼稻种质资源源库相关性状的全基因组关联分析第52-88页
   ·材料与方法第52页
     ·供试材料第52页
     ·试验方法第52页
     ·DNA提取与基因型分析第52页
     ·表型鉴定第52页
   ·数据分析第52-53页
     ·表型数据统计分析第52页
     ·遗传多样性分析第52页
     ·群体结构分析第52-53页
     ·亲缘关系(Kinship)分析第53页
     ·关联分析第53页
   ·结果与分析第53-82页
     ·SNP遗传多样性分析第53-54页
     ·群体结构分析第54-56页
     ·连锁不平衡分析第56-57页
     ·亲缘关系分析第57-58页
     ·水稻源库相关性状全基因组关联分析第58-82页
   ·讨论第82-86页
     ·关联分析模型选择第82-83页
     ·关联分析显著水平的选择第83页
     ·水稻群体结构对关联分析的影响第83-84页
     ·水稻群体连锁不平衡水平对关联分析的影响第84页
     ·环境变化对数量性状的影响第84-85页
     ·水稻源库相关性状QTL的重演性第85-86页
     ·与多个源库相关性状关联的QTL位点第86页
   ·本章结论第86-88页
第四章 全文结论第88-90页
参考文献第90-100页
附录第100-116页
致谢第116-118页
攻读博士学位期间发表的学术论文第118页

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