| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-15页 |
| ·生物信息学简介 | 第11页 |
| ·基因芯片实验数据分析流程 | 第11-13页 |
| ·基于概率方法的数据分析 | 第13-14页 |
| ·本文主要研究内容和思路 | 第14页 |
| ·本文的组织结构 | 第14-15页 |
| 第二章 生物背景介绍 | 第15-21页 |
| ·生物背景知识 | 第15-17页 |
| ·基因芯片技术 | 第17-20页 |
| ·基因芯片技术简介 | 第17-18页 |
| ·Affymetrix 基因芯片 | 第18-20页 |
| ·本章小结 | 第20-21页 |
| 第三章 原始数据分析相关方法 | 第21-25页 |
| ·传统方法 | 第21页 |
| ·概率方法 | 第21-23页 |
| ·BGX (Bayesian Gene Expression Index) | 第22页 |
| ·gMOS 和 mgMOS | 第22-23页 |
| ·multi-mgMOS | 第23页 |
| ·传统方法用于外显子芯片 | 第23-24页 |
| ·本章小结 | 第24-25页 |
| 第四章 PM-mmgMOS 模型 | 第25-37页 |
| ·multi-mgMOS 模型改进目的及思路 | 第25页 |
| ·PM-mmgMOS 模型构建 | 第25-27页 |
| ·gc分布的近似计算 | 第26-27页 |
| ·表达水平的计算 | 第27页 |
| ·PM-mmgMOS 模型实现 | 第27-29页 |
| ·实现的软件基础 | 第27-28页 |
| ·PM-mmgMOS 实现过程 | 第28-29页 |
| ·实验结果分析 | 第29-35页 |
| ·MAQC U133 GeneChips 数据集 | 第29-34页 |
| ·实验结果分析与讨论 | 第31-34页 |
| ·Mouse Embryo 数据集 | 第34-35页 |
| ·实验结果分析与讨论 | 第34-35页 |
| ·本章小结 | 第35-37页 |
| 第五章 GME 模型 | 第37-49页 |
| ·基因、剪切异构体和探针之间的多元映射 | 第37-38页 |
| ·构建 GME 模型 | 第38-41页 |
| ·gkc分布近似计算 | 第39-40页 |
| ·表达水平的计算 | 第40-41页 |
| ·GME 模型的实现 | 第41-42页 |
| ·实验结果分析 | 第42-48页 |
| ·基因表达水平计算验证 | 第42-45页 |
| ·MAQC 外显子数据集 | 第42页 |
| ·结果分析与讨论 | 第42-45页 |
| ·剪切异构体表达水平计算验证 | 第45-48页 |
| ·HNSCC 数据集 | 第45页 |
| ·结果分析与讨论 | 第45-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第六章 结束语 | 第49-51页 |
| ·工作总结 | 第49页 |
| ·研究展望 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 在学期间的研究成果与发表的学术论文 | 第56-57页 |
| 附录A 外显子芯片通过 qRT-PCR 验证变化基因详细结果 | 第57-64页 |
| 附录B 四个条件下 5 次重复实验结果两两间的相关系数 | 第64页 |
