| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-23页 |
| ·mRNA前体的可变剪接 | 第12-17页 |
| ·可变剪接的发现 | 第12-13页 |
| ·可变剪接的剪接类型 | 第13-15页 |
| ·可变剪接的剪接机制 | 第15-17页 |
| ·可变剪接影响大脑及胰腺器官发育及功能 | 第17页 |
| ·可变剪接的检测方法 | 第17-22页 |
| ·生物信息学分析法 | 第18-19页 |
| ·微阵列探针法 | 第19-20页 |
| ·RNA-Seq | 第20-22页 |
| ·本研究目的及意义 | 第22-23页 |
| 第二章 材料和方法 | 第23-36页 |
| ·原始数据 | 第23-24页 |
| ·EST序列数据 | 第23页 |
| ·mRNA序列数据 | 第23页 |
| ·基因组序列数据 | 第23页 |
| ·RNA-Seq序列数据 | 第23-24页 |
| ·编程软件 | 第24-27页 |
| ·Perl编程语言 | 第24页 |
| ·序列比对软件 | 第24-25页 |
| ·构建数据库相关软件 | 第25-26页 |
| ·EST处理软件 | 第26-27页 |
| ·实验仪器 | 第27页 |
| ·软件的安装及使用 | 第27-31页 |
| ·本地Blat的使用和安装 | 第27页 |
| ·本地Blast的使用和安装 | 第27-28页 |
| ·Linux下Apache+PHP+Mysql的安装和配置 | 第28页 |
| ·Perl和bioperl的安装 | 第28-29页 |
| ·Repeatmasker的使用和安装 | 第29页 |
| ·Crossmatch的使用和安装 | 第29-30页 |
| ·Seqclean的使用和安装 | 第30页 |
| ·Maq的使用和安装 | 第30-31页 |
| ·实验步骤 | 第31-36页 |
| ·EST序列去污染 | 第31页 |
| ·STWA算法流程 | 第31-32页 |
| ·小鼠大脑及胰腺组织时序特异性可变剪接转录本的注释和定位 | 第32-33页 |
| ·利用RNA-Seq验证时序特异性转录本预测结果 | 第33页 |
| ·构建小鼠大脑及胰腺组织时序特异性可变剪接转录本数据库 | 第33-35页 |
| ·小鼠胰腺组织成体期特异性可变剪接新转录本的通路分析 | 第35页 |
| ·小鼠胰腺组织成体期特异性可变剪接新转录本的遗传病易感位点分析 | 第35-36页 |
| 第三章 结果与分析 | 第36-52页 |
| ·小鼠大脑及胰腺组织时序特异性可变剪接转录本筛选结果 | 第36-38页 |
| ·小鼠大脑及胰腺组织时序特异性可变剪接转录本数据库 | 第38-41页 |
| ·小鼠大脑组织时序特异性可变剪接转录本的染色体偏好 | 第41-42页 |
| ·小鼠大脑组织时序特异性可变剪接转录本的剪接类型偏好 | 第42-43页 |
| ·小鼠大脑组织时序特异性可变剪接转录本的剪接位点偏好 | 第43-44页 |
| ·小鼠胰腺组织时序特异性可变剪接新转录本所涉及的代谢通路 | 第44-50页 |
| ·胰腺分泌代谢通路 | 第44-45页 |
| ·脂肪消化及吸收代谢通路 | 第45-46页 |
| ·甘油脂代谢通路 | 第46-47页 |
| ·蛋白质消化及吸收代谢通路 | 第47-48页 |
| ·PI3K-AKT信号通路 | 第48-49页 |
| ·细胞周期 | 第49-50页 |
| ·Pnliprp1的可变剪接与肥胖 | 第50-52页 |
| 第四章 讨论 | 第52-56页 |
| ·小鼠大脑及胰腺组织时序特异性可变剪接数据库的建立 | 第52-53页 |
| ·小鼠胰腺组织时序特异性可变剪接新转录本对代谢功能和信号通路的影响 | 第53-54页 |
| ·Pnliprp1的可变剪接与小鼠肥胖 | 第54-56页 |
| 第五章 结论与展望 | 第56-57页 |
| ·本研究的创新点 | 第56页 |
| ·未来的方向 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 附录1 论文词汇中英文对照表 | 第63-64页 |
| 附录2 EST序列文库分类表 | 第64-67页 |
| 附录3 Perl源代码(STWA算法实现) | 第67-69页 |
| 附录4 已得到RNA-Seq数据验证的可变剪接转录本注释信息 | 第69-70页 |
| 附录5 小鼠大脑组织时序特异性可变剪接转录本汇总表 | 第70-71页 |
| 附录6 硕士在读期间学术成果 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
