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芒草驯养湘西黄牛(Bos taurus)瘤胃微生物多样性及β-葡萄糖苷酶新基因的克隆与表达研究

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
前言第13-29页
 1 第二代生物燃料作物芒的应用潜力第13-15页
   ·发展可再生能源的必要性第13页
   ·生物燃料的发展趋势第13-14页
   ·芒的应用潜力第14-15页
 2 β-葡萄糖苷酶的研究进展第15-17页
   ·β-葡萄糖苷酶的理化性质第15-16页
   ·新的β-葡萄糖苷酶的发现第16-17页
 3 瘤胃未培养微生物蕴含着巨大的可开发资源第17-22页
   ·瘤胃微生物组成第18-22页
   ·芒草驯养对发掘牛瘤胃微生物纤维素降解酶的意义第22页
 4 宏基因组学是开发利用未培养微生物资源的重要途径第22-27页
   ·宏基因组学研究策略第22-23页
   ·宏基因组学技术应用现状第23-24页
   ·宏基因组学技术目前存在的问题第24-27页
 5 本论文立题依据、研究目标及技术路线第27-29页
   ·立题依据第27页
   ·研究目标第27-28页
   ·技术路线第28-29页
第一章 芒草驯养对黄牛瘤胃微生物群落的影响第29-55页
 1 材料与方法第29-35页
   ·实验材料第29-31页
   ·实验方法第31-35页
     ·高分子量瘤胃微生物总DNA的提取第31-32页
     ·PCR反应体系及条件第32-33页
     ·16S rRNA和18S rRNA基因克隆文库的构建第33-35页
     ·生物信息学分析及系统进化树的构建第35页
 2 结果与分析第35-51页
   ·瘤胃微生物16S rRNA、18S rRNA基因文库的构建第35-41页
     ·瘤胃微生物总DNA的提取第35-36页
     ·瘤胃细菌16S rRNA基因扩增及阳性克隆的鉴定第36-37页
     ·瘤胃古菌16S rRNA基因扩增及阳性克隆的鉴定第37-38页
     ·瘤胃真菌18S rRNA基因扩增及阳性克隆的鉴定第38-39页
     ·核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析结果第39-41页
   ·16S rRNA基因多样性第41-47页
   ·18S rRNA基因多样性第47页
   ·不同饲养条件下牛瘤胃细菌、古菌、真菌的比较第47-51页
 3 讨论第51-55页
第二章 芒草驯养黄牛瘤胃微生物宏基因组Fosmid文库的构建及β-葡萄糖苷酶新基因的克隆与表达研究第55-90页
 1 材料与方法第55-69页
   ·实验材料第55-57页
   ·实验方法第57-69页
     ·高分子量瘤胃微生物宏总DNA的提取第57页
     ·宏基因组DNA的纯化第57-58页
     ·瘤胃微生物宏基因组文库构建第58-60页
     ·Fosmid文库的保存第60页
     ·Fosmid文库稳定性及文库效率的评价第60-62页
     ·Fosmid文库的筛选第62页
     ·亚克隆文库的构建和筛选第62-63页
     ·Unglu135B12的原核表达第63-64页
     ·诱导表达条件的优化第64-65页
     ·SDS-PAGE第65-66页
     ·Unglu135B12的纯化第66-67页
     ·纯化蛋白质功能验证第67页
     ·β-葡萄糖苷酶酶学性质研究第67-69页
 2 结果与分析第69-86页
   ·Fosmid文库构建和筛选第69-73页
     ·瘤胃微生物宏基因组DNA的提取和纯化第69-70页
     ·插入片段大小的验证第70页
     ·文库稳定性的评价第70-71页
     ·文库效率的评价第71-72页
     ·Fosmid文库随机测序结果第72页
     ·Fosmid文库的筛选第72-73页
   ·135B12亚克隆文库的构建及筛选第73-78页
     ·135B12亚克隆文库筛选结果第73-74页
     ·亚克隆135-138插入片段的测序及分析第74-76页
     ·Unglu135B12系统进化分析第76-78页
   ·Unglu135B12的原核表达第78-83页
     ·pUC19-unglu135B12与表达载体酶切结果第78页
     ·pET-unglu135B12酶切及菌液PCR验证第78页
     ·含pET-unglu135B12阳性克隆的功能验证第78-79页
     ·Unglu135B12蛋白质电泳及western检测第79-80页
     ·诱导条件的优化第80-83页
   ·β-葡萄糖苷酶酶学性质的研究第83-86页
     ·β-葡萄糖苷酶最适反应温度的确定第83页
     ·β-葡萄糖苷酶最适pH的确定第83-84页
     ·β-葡萄糖苷酶的热稳定性第84-85页
     ·β-葡萄糖苷酶的pH稳定性第85页
     ·金属离子对酶活力的影响第85-86页
     ·β-葡萄糖苷酶反应动力学的研究第86页
 3 讨论第86-90页
   ·Fosmid文库的构建第86-87页
   ·文库筛选第87-88页
   ·开发瘤胃微生物纤维素酶的潜力第88-89页
   ·新的β-葡萄糖苷酶的发现第89页
   ·新的β-葡萄糖苷酶的酶学性质第89-90页
结论、创新点及下一步工作计划第90-92页
参考文献第92-100页
附录第100-123页
致谢第123-124页
作者简历第124-125页

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