基于ITS和trnH-psbA对川西南杓兰的分子系统学研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩略词表 | 第8-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1 植物系统学及分子系统学研究概况 | 第12-19页 |
| ·植物分类学与系统学 | 第12页 |
| ·分子系统学 | 第12-14页 |
| ·系统树的构建 | 第13-14页 |
| ·DNA序列在高等植物分子系统研究中的应用 | 第14-19页 |
| ·核基因组(nDNA) | 第15-17页 |
| ·叶绿体基因组(cpDNA) | 第17-18页 |
| ·线粒体基因组(mtDNA) | 第18-19页 |
| ·DNA条形码概述 | 第19页 |
| 2 杓兰属植物概况 | 第19-25页 |
| ·杓兰属植物资源及其分布 | 第19-20页 |
| ·杓兰属植物研究价值 | 第20-21页 |
| ·杓兰属植物研究概况 | 第21-25页 |
| ·形态分类研究 | 第21-22页 |
| ·系统地理学研究 | 第22页 |
| ·分子生物学方法在杓兰系统发育研究中的应用 | 第22-23页 |
| ·ITS在杓兰系统发育研究中的应用 | 第23-24页 |
| ·trnH-psbA在杓兰系统发育研究中的应用 | 第24-25页 |
| 3 本研究的目的和意义 | 第25-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-34页 |
| 1 材料 | 第26-27页 |
| ·供试材料 | 第26-27页 |
| ·供试材料图片 | 第27页 |
| ·菌株与载体 | 第27页 |
| ·生化药品与试剂 | 第27页 |
| ·主要仪器设备 | 第27页 |
| 2 试验方法 | 第27-34页 |
| ·杓兰基因组DNA提取 | 第27-28页 |
| ·PCR引物设计与合成 | 第28-29页 |
| ·ITS序列扩增引物 | 第28页 |
| ·trnH-psbA序列扩增引物 | 第28-29页 |
| ·PCR反应体系及扩增程序 | 第29-30页 |
| ·ITS序列PCR反应体系及扩增程序 | 第29页 |
| ·trnH-psbA序列PCR反应体系及扩增程序 | 第29-30页 |
| ·PCR产物的回收与纯化 | 第30页 |
| ·目的片段与克隆载体的连接 | 第30-31页 |
| ·大肠杆菌感受态的制备 | 第31页 |
| ·大肠杆菌质粒转化(热激法) | 第31-32页 |
| ·阳性克隆鉴定 | 第32页 |
| ·菌落PCR鉴定 | 第32页 |
| ·重组质粒鉴定 | 第32页 |
| ·核苷酸序列测定 | 第32-33页 |
| ·序列排序及分析 | 第33页 |
| ·ITS假基因序列判断 | 第33页 |
| ·系统发育树构建 | 第33-34页 |
| 第三章 试验结果与分析 | 第34-53页 |
| 1 杓兰基因组DNA提取结果 | 第34页 |
| 2 ITS序列试验结果 | 第34-46页 |
| ·ITS序列PCR扩增结果 | 第34-35页 |
| ·ITS阳性克隆鉴定结果 | 第35-36页 |
| ·ITS序列分析 | 第36-40页 |
| ·ITS序列假基因验证 | 第37-38页 |
| ·ITS序列特征 | 第38-39页 |
| ·核苷酸多样性及中心进化检测 | 第39页 |
| ·遗传距离分析 | 第39-40页 |
| ·ITS系统发育分析 | 第40-46页 |
| 3 trnH-psbA序列试验结果 | 第46-53页 |
| ·trnH-psbA序列PCR扩增结果 | 第46页 |
| ·trnH-psbA序列分析 | 第46-48页 |
| ·trnH-psbA序列特征 | 第46-47页 |
| ·核苷酸多样性及中心进化检测 | 第47-48页 |
| ·遗传距离分析 | 第48页 |
| ·ITS系统发育分析 | 第48-53页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第53-57页 |
| 1 杓兰亚科属间亲缘关系 | 第53-54页 |
| 2 杓兰属植物种间亲缘关系 | 第54-55页 |
| ·杓兰属中个别种的进化地位 | 第54-55页 |
| ·川西南杓兰的种间亲缘关系 | 第55页 |
| 3 ITS及trnH-psbA适用性探讨 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-64页 |
| 致谢 | 第64-66页 |
| 攻读硕士学位期间所取的成果 | 第66页 |
