| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一部分 宁波地区手足口病病原学分型 | 第12-27页 |
| 引言 | 第12-13页 |
| 1 材料与方法 | 第13-19页 |
| ·材料 | 第13-15页 |
| ·样本来源 | 第13页 |
| ·诊断标准 | 第13页 |
| ·样本的采集和处理 | 第13-14页 |
| ·试剂使用 | 第14页 |
| ·仪器与耗材 | 第14-15页 |
| ·方法 | 第15-19页 |
| ·核酸提取 | 第15-16页 |
| ·荧光定量 RT-PCR 检测样本 | 第16页 |
| ·RT-PCR 引物 | 第16-17页 |
| ·RT-PCR 扩增 | 第17-18页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测扩增条带 | 第18页 |
| ·基因测序 | 第18页 |
| ·序列拼接与统计方法 | 第18-19页 |
| 2 结果 | 第19-24页 |
| ·荧光定量 RT-PCR 检测手足病样本结果 | 第19页 |
| ·VP4 区 RT-PCR 扩增及琼脂糖凝胶电泳结果 | 第19-20页 |
| ·VP4 区序列测定结果 | 第20-21页 |
| ·引起手足口病肠道病毒病原学分布 | 第21页 |
| ·流行病学特征 | 第21-24页 |
| ·临床状况 | 第21-22页 |
| ·时间分布 | 第22页 |
| ·人群分布 | 第22-24页 |
| ·性别 | 第22页 |
| ·年龄 | 第22-24页 |
| 3 讨论 | 第24-26页 |
| 4 小结 | 第26-27页 |
| 第二部分 肠道病毒 71 型的全基因组序列测定与分析 | 第27-68页 |
| 引言 | 第27-29页 |
| 1 材料与方法 | 第29-37页 |
| ·材料 | 第29-31页 |
| ·病毒株 | 第29页 |
| ·细胞系 | 第29页 |
| ·试剂使用 | 第29-30页 |
| ·仪器与耗材 | 第30-31页 |
| ·方法 | 第31-37页 |
| ·病毒分离和增殖 | 第31页 |
| ·核酸提取 | 第31页 |
| ·荧光定量 RT-PCR 鉴定核酸浓度 | 第31页 |
| ·引物设计 | 第31-33页 |
| ·RT-PCR | 第33页 |
| ·5'UTR 基因扩增操作过程 | 第33-34页 |
| ·3'UTR 基因扩增操作过程 | 第34-35页 |
| ·VP1 区基因扩增 | 第35页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测扩增条带和序列测定 | 第35页 |
| ·序列的拼接与分析 | 第35-37页 |
| 2 结果 | 第37-62页 |
| ·病例的临床表现 | 第37页 |
| ·病毒分离和序列扩增结果 | 第37-39页 |
| ·病毒分离 | 第37页 |
| ·荧光定量 RT-PCR 鉴定 EV71 增殖 | 第37-38页 |
| ·RT-PCR 扩增及琼脂糖凝胶电泳 | 第38-39页 |
| ·序列测定结果 | 第39页 |
| ·宁波株 EV71 GenBank 登录号 | 第39页 |
| ·EV71 全基因组序列及蛋白组成 | 第39-40页 |
| ·全基因组核苷酸和编码区氨基酸组成分析 | 第40-41页 |
| ·核苷酸 | 第40页 |
| ·氨基酸 | 第40-41页 |
| ·宁波株与其他 EV71 毒株的核苷酸同源性比较 | 第41-46页 |
| ·全基因组核苷酸序列同源性比较 | 第43页 |
| ·5'UTR 核苷酸序列同源性比较 | 第43页 |
| ·VP1 区核苷酸序列同源性比较 | 第43-44页 |
| ·VP2 区核苷酸序列同源性比较 | 第44页 |
| ·VP3 区核苷酸序列同源性比较 | 第44-45页 |
| ·VP4 区核苷酸序列同源性比较 | 第45页 |
| ·P1 区核苷酸序列同源性比较 | 第45页 |
| ·P2P3 区核苷酸序列同源性比较 | 第45页 |
| ·3'UTR 核苷酸序列同源性比较 | 第45-46页 |
| ·宁波株与其他 EV71 毒株的氨基酸同源性比较 | 第46-49页 |
| ·编码区氨基酸序列同源性比较 | 第48页 |
| ·VP1 区氨基酸序列同源性比较 | 第48页 |
| ·VP4 区氨基酸序列同源性比较 | 第48-49页 |
| ·P1 区氨基酸序列同源性比较 | 第49页 |
| ·P2P3 区氨基酸序列同源性比较 | 第49页 |
| ·宁波株与其他 EV71 毒株各区段亲缘进化分析 | 第49-57页 |
| ·五张进化树图的五大共同的聚类趋势 | 第49-50页 |
| ·五张进化树图的特性分析 | 第50-57页 |
| ·全基因组进化压力分析 | 第57页 |
| ·肠道病毒 71 型 VP1 蛋白二级结构及 B 细胞表位的预测 | 第57-62页 |
| ·30 株 EV71 VP1 区测序结果 | 第57-58页 |
| ·宁波 EV71 流行株 VP1 蛋白同源性和遗传进化分析 | 第58-60页 |
| ·EV71 VP1 蛋白二级结构 | 第60-61页 |
| ·EV71 VP1 蛋白亲水性、柔韧性、表面可能性和 B 细胞抗原表位的预测 | 第61-62页 |
| 3 讨论 | 第62-67页 |
| 4 小结 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-71页 |
| 附录A 文献综述 | 第71-79页 |
| 参考文献 | 第76-79页 |
| 附录B 氨基酸中文名称及英文缩写 | 第79-80页 |
| 附录C 技术路线 | 第80-81页 |
| 在学研究成果 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
