| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略语 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-38页 |
| ·插入序列 | 第12-20页 |
| ·插入序列的结构与特性 | 第12-13页 |
| ·插入序列的命名与分类 | 第13-15页 |
| ·插入序列的研究进展 | 第15-20页 |
| ·针对单个插入序列的研究 | 第15-16页 |
| ·插入序列组学研究进展 | 第16-19页 |
| ·小结与展望 | 第19-20页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群基因组的研究进展 | 第20-29页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群全基因组测序进展 | 第20-26页 |
| ·炭疽芽胞杆菌 | 第22页 |
| ·蜡状芽胞杆菌 | 第22-23页 |
| ·苏云金芽胞杆菌 | 第23-24页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群其他菌株 | 第24-25页 |
| ·苏云金芽胞杆菌YBT-1520简介 | 第25-26页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群比较基因组研究进展 | 第26-29页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群中双组份系统的比较基因组研究 | 第26-28页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群中两类内含子的比较基因组研究 | 第28-29页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群插入序列研究进展 | 第29-37页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群中插入序列的比较研究 | 第29-31页 |
| ·苏云金芽胞杆菌插入序列研究进展 | 第31-37页 |
| ·IS231 | 第32-35页 |
| ·IS232 | 第35-36页 |
| ·IS240 | 第36页 |
| ·其他家族的插入序列 | 第36-37页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第37-38页 |
| 2 材料与方法 | 第38-44页 |
| ·实验材料 | 第38-39页 |
| ·菌株 | 第38页 |
| ·培养基 | 第38-39页 |
| ·试剂和仪器 | 第39页 |
| ·试剂 | 第39页 |
| ·仪器 | 第39页 |
| ·实验方法 | 第39-42页 |
| ·苏云金芽胞杆菌总DNA的抽提 | 第39-40页 |
| ·PCR扩增 | 第40页 |
| ·Southern杂交 | 第40-42页 |
| ·转膜 | 第40-41页 |
| ·杂交 | 第41-42页 |
| ·生物信息学分析 | 第42-44页 |
| ·基因预测 | 第42页 |
| ·数据集的构建 | 第42页 |
| ·插入序列的确认和分类 | 第42-43页 |
| ·序列分析 | 第43-44页 |
| 3 结果与讨论 | 第44-84页 |
| ·菌株YBT-1520中插入序列的分布与特性 | 第44-61页 |
| ·IS4家族 | 第44-47页 |
| ·IS21家族 | 第47-48页 |
| ·IS3家族 | 第48页 |
| ·IS110家族 | 第48-52页 |
| ·IS200/IS605及IS607家族 | 第52页 |
| ·菌株YBT-1520质粒上的插入序列 | 第52-54页 |
| ·插入序列对功能基因的影响 | 第54-57页 |
| ·菌株YBT-1520中高拷贝插入序列的分布 | 第57-59页 |
| ·苏云金芽胞杆菌CT-43中插入序列分析 | 第59页 |
| ·小结 | 第59-61页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群基因组中插入序列的分布与比较研究 | 第61-77页 |
| ·炭疽芽胞杆菌基因组中插入序列的分布与特性 | 第63-64页 |
| ·蜡状芽胞杆菌基因组中插入序列的分布与特性 | 第64-68页 |
| ·B. cereus ATCC 14579 | 第64-65页 |
| ·B. cereus ATCC 10987 | 第65-66页 |
| ·B. cereus G9842 | 第66页 |
| ·B. cereus B4264 | 第66-67页 |
| ·B. cereus AH187 | 第67页 |
| ·B. cereus Q1 | 第67页 |
| ·B. cereus E33L | 第67-68页 |
| ·B. cereus AH820 | 第68页 |
| ·B. cereus 03BB102 | 第68页 |
| ·B. cereus subsp. cytotoxis NVH391-98 | 第68页 |
| ·苏云金芽胞杆菌基因组中插入序列的分布与特性 | 第68-69页 |
| ·B. thuringiensis konkukian 97-27 | 第68-69页 |
| ·B. thuringiensis Al Hakam | 第69页 |
| ·插入序列在蜡状芽胞杆菌群中的比较基因组研究 | 第69-76页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群基因组MLST进化分析 | 第69-70页 |
| ·IS3家族插入序列在蜡状芽胞杆菌群中的进化关系 | 第70-72页 |
| ·IS200/IS605家族插入序列在蜡状芽胞杆菌群中的进化关系 | 第72-74页 |
| ·IS110家族插入序列在蜡状芽胞杆菌群中分布的特异性 | 第74-76页 |
| ·小结 | 第76-77页 |
| ·鼻疽诺卡菌中细胞色素P450家族的比较基因组研究 | 第77-84页 |
| ·鼻疽诺卡菌IFM10152中P450蛋白的分布与特性 | 第77-81页 |
| ·鼻疽诺卡菌IFM10152中P450蛋白的比较基因组分析 | 第81-84页 |
| 4 总结与展望 | 第84-87页 |
| ·总结 | 第84-86页 |
| ·展望 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 附录1 已发表和待发表论文及主要成果 | 第98-99页 |
| 附录2 B.th.I3嵌入IS231C的序列 | 第99-101页 |
| 附录3 ISBth166序列特征 | 第101-102页 |
| 附录4 本研究新命名的插入序列特征 | 第102-115页 |
