巢湖水体浮游细菌群落结构时空差异的分子生态学研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 1 文献综述 | 第8-15页 |
| ·微生物分子生态学涉及的主要研究方法 | 第8-11页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第9页 |
| ·16S rDNA文库的构建 | 第9-10页 |
| ·限制性片段长度多态性(RFLP) | 第10-11页 |
| ·荧光原位杂交(FISH) | 第11页 |
| ·微生物分子生态学的主要研究领域及其进展 | 第11-14页 |
| ·海洋微生物多样性研究 | 第11-12页 |
| ·淡水微生物多样性研究 | 第12-13页 |
| ·土壤微生物多样性研究 | 第13-14页 |
| ·微生物分子生态学研究展望 | 第14-15页 |
| 2 引言 | 第15-17页 |
| 3 材料与方法 | 第17-28页 |
| ·采样时间和地点 | 第17页 |
| ·现场水样的采集和处理 | 第17-18页 |
| ·采样前准备 | 第17页 |
| ·水样采集和保存 | 第17-18页 |
| ·环境参数的测定 | 第18页 |
| ·水体浮游细菌的计数 | 第18-19页 |
| ·主要器材和试剂 | 第18页 |
| ·DAPI染色液制备 | 第18页 |
| ·细菌染色 | 第18-19页 |
| ·细菌荧光计数 | 第19页 |
| ·浮游细菌数量计算公式 | 第19页 |
| ·PCR-DGGE | 第19-25页 |
| ·器材与试剂 | 第19-21页 |
| ·浮游细菌DNA的提取 | 第21-22页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测 | 第22页 |
| ·PCR扩增 | 第22-23页 |
| ·PCR扩增产物纯化 | 第23-24页 |
| ·PCR扩增产物测序验证 | 第24-25页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第25页 |
| ·DGGE特异条带的测序 | 第25页 |
| ·DGGE图谱分析 | 第25-26页 |
| ·聚类分析 | 第25-26页 |
| ·细菌种群丰度和群落多样性分析 | 第26页 |
| ·系统进化树的构建 | 第26页 |
| ·细菌结构与环境因子的典型对应分析(CCA) | 第26-27页 |
| ·16S rDNA文库的构建 | 第27-28页 |
| 4 结果与分析 | 第28-40页 |
| ·理化环境参数比较 | 第28-29页 |
| ·浮游细菌数量 | 第29-31页 |
| ·浮游细菌DAPI荧光染色效果分析 | 第29-30页 |
| ·浮游细菌数量比较 | 第30-31页 |
| ·浮游细菌DNA提取结果 | 第31-32页 |
| ·PCR扩增结果 | 第32-33页 |
| ·浮游细菌种群丰度变化 | 第33-34页 |
| ·DGGE结果分析 | 第33页 |
| ·浮游细菌种群丰度的时空差异 | 第33-34页 |
| ·浮游细菌群落多样性的时空差异 | 第34-35页 |
| ·浮游细菌群落组成的聚类分析 | 第35-36页 |
| ·浮游细菌群落结构与环境因子的关系 | 第36-38页 |
| ·浮游细菌的遗传多样性分析 | 第38-40页 |
| 5 讨论 | 第40-44页 |
| ·巢湖水体营养状况与细菌数量的关系分析及讨论 | 第40页 |
| ·巢湖水体浮游细菌的种群丰度 | 第40-41页 |
| ·巢湖水体浮游细菌的遗传多样性 | 第41页 |
| ·巢湖水体浮游细菌群落结构与环境因素的关系 | 第41-42页 |
| ·实验中存在的不足及建议 | 第42-44页 |
| ·DGGE技术自身存在的缺限 | 第42页 |
| ·遗传多样性分析及16S rDNA文库的构建 | 第42页 |
| ·对今后开展类似研究的建议 | 第42-44页 |
| 6 结论 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-51页 |
| 附录A | 第51-52页 |
| 附录B | 第52-54页 |
| 附录C | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 作者简介 | 第56页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第56页 |
