| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 资源家系测定性状的英文缩写 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-26页 |
| 1 引言 | 第14页 |
| 2 猪基因组研究现状 | 第14-15页 |
| 3 比较基因组学及在猪遗传育种中的应用 | 第15-16页 |
| ·比较基因组学的研究进展 | 第15-16页 |
| ·比较基因组学在猪遗传育种中的应用 | 第16页 |
| 4 分子标记技术研究进展 | 第16-21页 |
| ·限制性片段长度多态性技术 | 第17页 |
| ·微卫星标记技术 | 第17-18页 |
| ·DNA指纹标记标记技术 | 第18页 |
| ·随机扩增多态性DNA标记技术 | 第18-19页 |
| ·扩增片段长度多态性标记技术 | 第19页 |
| ·聚合酶链式反应一单链构象多态性分析技术 | 第19页 |
| ·单核苷酸多态性标记技术 | 第19-20页 |
| ·DNA芯片技术 | 第20-21页 |
| 5 电子克隆技术在分离新基因中的应用 | 第21-23页 |
| 6 拟分离基因的研究现状 | 第23-26页 |
| ·葡萄糖6磷酸酶催化亚基(glucose-6-phosphatase,catalyticsubunit,G6PC) | 第23页 |
| ·卵磷脂胆固醇酰基转移酶(lecithin:cholesterol acyltransferase,LCAT) | 第23-24页 |
| ·核受体相关因子1(nuclear receptor-related factor 1,Nurr1) | 第24-26页 |
| 第二章 研究目的和意义 | 第26-27页 |
| 第三章 材料与方法 | 第27-38页 |
| 1 试验材料 | 第27-29页 |
| ·试验样品和性状测定 | 第27页 |
| ·主要仪器和设备 | 第27页 |
| ·主要药品及试剂 | 第27-28页 |
| ·缓冲液和常用试剂的配制 | 第28-29页 |
| 2 试验方法 | 第29-34页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第29页 |
| ·基因组DNA的浓度测定和质量检测 | 第29-30页 |
| ·总RNA的提取及利用RT-PCR方法扩增cDNA | 第30-31页 |
| ·候选基因的确定及引物设计 | 第31-32页 |
| ·PCR产物的回收、纯化、克隆测序 | 第32-34页 |
| ·PCR产物回收与纯化 | 第32-33页 |
| ·回收的PCR产物与pMD18-T Vector的连接 | 第33页 |
| ·感受态细胞的制备(CaCl_2法制备感受态) | 第33-34页 |
| ·连接产物的转化 | 第34页 |
| ·阳性克隆子鉴定及测序 | 第34页 |
| 3 生物信息学分析相应软件 | 第34页 |
| 4 候选基因基因组序列的分离及SNPs研究 | 第34-36页 |
| ·引物设计 | 第34-36页 |
| ·PCR反应体系和反应条件 | 第36页 |
| ·PCR产物的酶切及检测 | 第36页 |
| 5 统计分析 | 第36-37页 |
| ·分子标记在不同猪种中的等位基因频率及基因型频率计算 | 第36-37页 |
| ·分子标记的基因效应分析 | 第37页 |
| 6 组织表达谱分析 | 第37-38页 |
| 第四章 结果与分析 | 第38-65页 |
| 1 总RNA的提取 | 第38页 |
| 2 猪G6PC基因 | 第38-50页 |
| ·猪G6PC基因cDNA序列的克隆 | 第38-39页 |
| ·猪G6PC基因部分基因组序列的克隆 | 第39页 |
| ·猪G6PC基因cDNA序列生物信息学分析结果 | 第39-42页 |
| ·猪G6PC基因的SNPs研究 | 第42-50页 |
| ·猪G6PC基因的组织表达谱分析 | 第50页 |
| 3 LCAT基因 | 第50-58页 |
| ·猪LCAT基因部分基因组序列的克隆 | 第50-51页 |
| ·猪LCAT基因序列的生物信息学分析 | 第51-55页 |
| ·猪LCAT基因的SNPs研究 | 第55-57页 |
| ·猪LCAT基因的组织表达谱分析 | 第57-58页 |
| 4 猪Nurr1基因 | 第58-65页 |
| ·猪Nurr1基因部分基因组序列的克隆 | 第58页 |
| ·猪Nurr1基因cDNA序列的克隆 | 第58-59页 |
| ·猪Nurr1基因序列的生物信息学分析 | 第59-64页 |
| ·猪Nurr1基因的组织表达谱分析 | 第64-65页 |
| 第五章 讨论 | 第65-70页 |
| 1 新基因的克隆与生物信息学分析 | 第65-66页 |
| ·新基因的克隆 | 第65-66页 |
| ·新基因的分析和鉴定 | 第66页 |
| 2 基因单核苷酸多态性(SNPs)与性状关联分析 | 第66-68页 |
| ·单核苷酸多态性及生物学效应 | 第66-67页 |
| ·基因多态与性状关联分析 | 第67-68页 |
| 3 组织表达谱分析 | 第68-70页 |
| ·猪G6PC基因的组织表达谱分析 | 第68-69页 |
| ·猪LCAT基因的组织表达谱分析 | 第69页 |
| ·猪Nurr1基因的组织表达谱分析 | 第69-70页 |
| 第六章 小结 | 第70-72页 |
| 1 本研究获得的结果 | 第70页 |
| 2 本研究的创新点 | 第70-71页 |
| 3 下一步工作计划 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-78页 |
| 致谢 | 第78页 |
