| 中文摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 目录 | 第5-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-33页 |
| ·引言 | 第8-9页 |
| ·生物信息学中的计算机技术应用 | 第9-13页 |
| ·论文选题来源及研究背景 | 第13-16页 |
| ·本论文研究内容 | 第16-17页 |
| ·本论文的组织结构 | 第17-18页 |
| ·生物系统背景知识 | 第18-32页 |
| 单元小结 | 第32-33页 |
| 第二章 国内外研究现状分析 | 第33-45页 |
| ·结构比对(structure aIignment)的现状 | 第33-36页 |
| ·VAST与DALI | 第36页 |
| ·全局与局部结构比较 | 第36-39页 |
| ·利用数学记号进行结构比较 | 第39-41页 |
| ·生物大分子表面结构的比较 | 第41-42页 |
| ·三维结构比较的研究 | 第42-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第三章 MATLAB下蛋白质三维结构可视化实现 | 第45-51页 |
| ·蛋白质存储结构分析 | 第45-46页 |
| ·PDB文件中对于大分子结构的描述 | 第46-48页 |
| ·MATLAB下蛋白质三维结构可视化实现 | 第48-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 第四章 统一坐标系下蛋白质三维结构频谱建立 | 第51-70页 |
| ·三维物体形状特征提取 | 第51-57页 |
| ·统一坐标系的建立 | 第57-59页 |
| ·蛋白质中心点确立 | 第57-58页 |
| ·坐标轴的确立 | 第58-59页 |
| ·小波分析 | 第59-60页 |
| ·基于蛋白质α碳原子距离的多分辨频谱建立 | 第60-66页 |
| ·蛋白质α碳原子距离的多分辨频谱建立 | 第61-66页 |
| ·相关频谱讨论 | 第66页 |
| ·基于统一坐标序列的蛋白质三维结构多分辨频谱建立 | 第66-69页 |
| ·方法与步骤 | 第66页 |
| ·实验结果及讨论 | 第66-69页 |
| ·本章小结 | 第69-70页 |
| 第五章 基于灰色关联的蛋白质三维结构相似性分析 | 第70-92页 |
| ·三维模型相似性比较 | 第70-74页 |
| ·灰色系统理论概述 | 第74-77页 |
| ·蛋白质三维结构相似性的灰色关联分析 | 第77-84页 |
| ·原理与方法 | 第77-78页 |
| ·实验结果及讨论 | 第78-84页 |
| ·蛋白质三维结构频谱的灰色关联分析 | 第84-91页 |
| ·方法与步骤 | 第84-85页 |
| ·实验结果及讨论 | 第85-91页 |
| ·本章小结 | 第91-92页 |
| 第六章 蛋白质三维结构空间复杂性的分形研究 | 第92-109页 |
| ·生物学中的分形[Den06] | 第92-94页 |
| ·分形概述 | 第94-96页 |
| ·基于分形的蛋白质三维空间结构复杂性研究 | 第96-102页 |
| ·原子覆盖法的C_α碳骨架分维数计算 | 第96-98页 |
| ·实验结果及讨论 | 第98-102页 |
| ·基于结构频谱分维的蛋白质三维结构相似性比较 | 第102-108页 |
| ·方法与步骤 | 第102-103页 |
| ·实验结果及讨论 | 第103-108页 |
| ·结语 | 第108页 |
| ·本章小结 | 第108-109页 |
| 第七章 蛋白质三维结构视图系统 | 第109-112页 |
| ·系统框架 | 第109页 |
| ·系统功能 | 第109-110页 |
| ·本章小结 | 第110-112页 |
| 第八章 总结和展望 | 第112-115页 |
| ·本文工作总结 | 第112-113页 |
| ·进一步工作展望 | 第113-115页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第115-116页 |
| 主要参考文献 | 第116-130页 |
| 致谢 | 第130页 |