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细胞极性蛋白PAR-3调节DNA双链断裂修复的机理研究

1. 摘要第1-9页
 摘要第6-7页
 Summary第7-9页
2. 前言第9-29页
   ·细胞极性的建立和维持第9-15页
   ·紧密连接和信号传导第15-16页
   ·紧密连接和相关疾病第16-23页
   ·双链DNA损伤的识别第23-26页
   ·双链DNA损伤修复通路第26-29页
3. 材料和方法第29-48页
   ·材料第29-31页
     ·细菌菌系,细胞系第29-31页
   ·方法第31-48页
     ·DNA的制备,分析和酶切处理第31-34页
     ·DNA 片段的扩增及处理第34-35页
     ·GST 融合蛋白在细菌中的诱导表达和纯化以及定量第35-37页
     ·多抗的制备第37-39页
     ·动物细胞培养及相关技术第39-42页
     ·蛋白质的检测技术第42-47页
     ·彗星实验(Comet assay)第47页
     ·脉冲凝胶电泳(Pulse-field gel electrophoresis)第47-48页
4. 结果第48-150页
   ·PAR-3 蛋白多抗的制备第48-55页
   ·PERVANADATE处理细胞可以引起PAR-3 蛋白的酪氨酸磷酸化第55-61页
   ·在JURKAT和A431 细胞中筛选与PAR-3 PDZ结构域相互作用的蛋白第61-70页
   ·质谱分析与PAR-3 PDZ 结构域结合的蛋白第70-75页
   ·WESTERN BLOT验证潜在与PAR3 蛋白的相互结合第75-80页
   ·KU70 和KU80 多抗的制备第80-83页
   ·KU70 和KU80 特异性的和PAR-3 在体外(IN VITRO)和体内(IN VIVO)相互作用第83-91页
   ·PAR-3 PDZ2 和PDZ3 之间的LINKER区域介导了它与KU70 N端的结合第91-95页
   ·PAR-3 既定位于HELA细胞的膜上又定位于其细胞核中第95-103页
   ·在用伽马射线或ETO处理诱导DNA双链断裂的细胞中,PAR-3 与KU蛋白的结合会增加第103-106页
   ·伽马射线照射引起的DNA双链断裂可以增强PAR-3 的核定位并与DNA依赖的蛋白激酶(DNA-PK)形成复合物第106-110页
   ·DNA-PK的催化亚基DNA-PKCS在经过伽马射线照射后也会和PAR-3/KU70/KU80 形成复合物第110-113页
   ·当PAR-3 过表达时,经伽马射线照射的细胞内DNA-PK,相对于对照而言,会发生激活上调;而在PAR-3 表达量减少后,对于射线照射的激活会下调.第113-121页
   ·PAR-3 在DNA双链损伤后和DNA损伤MARKER H2AX以及磷酸化的DNA-PKCS (PT2609) 部分共定位第121-125页
   ·PAR-3 参与DNA损伤后的DNA修复和细胞存活第125-137页
   ·PAR-3 蛋白与有丝分裂的关系第137-142页
   ·PMA的刺激可以诱导PAR-3 的细胞膜定位第142-146页
   ·γ-射线照射对紧密连接的影响第146-150页
5. 讨论第150-162页
   ·体外结合实验(IN VITRO BINDING ASSAY) 加上液相色谱质谱联用(LC-MS/MS)技术鉴定了新的PAR-3 结合蛋白第150-158页
   ·PAR-3 参与DNA双链断裂修复第158-159页
   ·细胞连接和DNA损伤修复第159-162页
6. 参考文献第162-181页
附录第181-197页
 附录1:主要缩略语列表(ABBREVIATIONS)第181-183页
 附录2:重要商用试剂列表第183-185页
 附录3:主要培养基及溶液列表第185-189页
 附录4:实验室自制抗体第189-190页
 附录5:主要质粒信息列表第190-196页
  1. 原始质粒第190-191页
  2. 带有插入片段的质粒第191-193页
  3. 质粒及对应的引物序列第193-196页
 附录6:合成短的抑制内源基因表达的双链RNA (SHRNA) 列表第196-197页
8. 发表的研究论文第197-198页
9. 致谢第198-199页

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