| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-31页 |
| 1.1 马尾松种质遗传多样性的研究进展 | 第14-22页 |
| 1.1.1 马尾松的起源与分布 | 第14-15页 |
| 1.1.2 马尾松遗传多样性的研究方法 | 第15-16页 |
| 1.1.3 DNA分子标记的类型 | 第16-18页 |
| 1.1.4 分子标记在马尾松遗传多样性研究上的应用 | 第18-22页 |
| 1.2 植物转录组测序技术的研究进展 | 第22-25页 |
| 1.2.1 转录组测序技术的发展及平台 | 第22-23页 |
| 1.2.2 转录组测序技术的原理及在马尾松研究中的应用 | 第23-25页 |
| 1.3 马尾松SSR分子标记的研究进展 | 第25-29页 |
| 1.3.1 SSR标记的原理 | 第25页 |
| 1.3.2 马尾松SSR分子标记的研究进展 | 第25-27页 |
| 1.3.3 马尾松SSR分子标记试验体系研究进展 | 第27-29页 |
| 1.4 本研究的目的意义、内容及技术路线 | 第29-31页 |
| 1.4.1 目的意义 | 第29页 |
| 1.4.2 主要研究内容 | 第29-30页 |
| 1.4.3 技术路线 | 第30-31页 |
| 第二章 基于转录组测序的马尾松SSR分子标记的开发 | 第31-56页 |
| 2.1 实验材料与设备 | 第31-33页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第31-32页 |
| 2.1.2 主要试剂及配制 | 第32-33页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第33页 |
| 2.2 实验方法 | 第33-38页 |
| 2.2.1 总DNA的提取及检测 | 第33页 |
| 2.2.2 转录组测序序列分析 | 第33页 |
| 2.2.3 SSR引物的设计合成 | 第33-34页 |
| 2.2.4 SSR-PCR反应体系建立 | 第34页 |
| 2.2.5 聚丙烯酰胺变性凝胶电泳及银染体系的建立 | 第34-36页 |
| 2.2.6 SSR引物的筛选 | 第36页 |
| 2.2.7 SSR-PCR扩增 | 第36页 |
| 2.2.8 马尾松种质指纹图谱及MCID图谱的构建 | 第36页 |
| 2.2.9 数据处理 | 第36-38页 |
| 2.3 结果与分析 | 第38-52页 |
| 2.3.1 SSR标记的分布特征 | 第38-41页 |
| 2.3.2 基因组DNA的质量检测 | 第41-42页 |
| 2.3.3 模板DNA和引物浓度对SSR反应体系的影响 | 第42-43页 |
| 2.3.4 退火温度对SSR反应体系的影响 | 第43页 |
| 2.3.5 SSR引物的筛选 | 第43-45页 |
| 2.3.6 SSR分子标记的鉴定 | 第45-52页 |
| 2.4 讨论 | 第52-55页 |
| 2.4.1 转录组序列中SSRs出现的频率 | 第52-53页 |
| 2.4.2 马尾松转录组序列中SSRs的类型 | 第53-54页 |
| 2.4.3 EST-SSR位点多态性分析 | 第54-55页 |
| 2.5 小结 | 第55-56页 |
| 第三章 马尾松种质资源遗传多样性的SSR评价 | 第56-76页 |
| 3.1 材料与方法 | 第56-59页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第56-58页 |
| 3.1.2 基因组DNA的提取 | 第58页 |
| 3.1.3 SSR引物 | 第58页 |
| 3.1.4 PCR扩增及电泳 | 第58页 |
| 3.1.5 数据处理 | 第58-59页 |
| 3.2 结果与分析 | 第59-71页 |
| 3.2.1 马尾松群体内遗传多样性 | 第59-62页 |
| 3.2.2 单个种质的聚类分析 | 第62-64页 |
| 3.2.3 NTSYS-PCA主成分分析 | 第64-65页 |
| 3.2.4 马尾松群体间遗传多样性 | 第65页 |
| 3.2.5 马尾松STURCTURE群体遗传结构分析 | 第65-69页 |
| 3.2.6 马尾松群体间的遗传分化 | 第69-70页 |
| 3.2.7 居群间遗传距离及群体聚类 | 第70-71页 |
| 3.3 讨论 | 第71-74页 |
| 3.3.1 马尾松优良家系遗传多样性 | 第71-72页 |
| 3.3.2 马尾松优良家系遗传分化 | 第72-73页 |
| 3.3.3 种质聚类及群体划分在育种中的思考 | 第73-74页 |
| 3.3.4 EST-SSR标记在马尾松研究中的地位 | 第74页 |
| 3.4 小结 | 第74-76页 |
| 第四章 总结与展望 | 第76-77页 |
| 4.1 总结 | 第76页 |
| 4.2 展望 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-85页 |
| 致谢 | 第85-87页 |
| 附录 | 第87-88页 |
