| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 常用专业名词缩写 | 第10-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-42页 |
| 1 定量蛋白质组学及研究技术概述 | 第11-26页 |
| ·定量蛋白质组学概念及研究技术分类 | 第11-12页 |
| ·传统的2-DE为基础的定量检测技术 | 第12-14页 |
| ·生物质谱为基础的定量检测技术 | 第14-23页 |
| ·定量技术比较以及优化组合方案 | 第23-26页 |
| 2 肝癌蛋白质组学研究现状及进展 | 第26-34页 |
| ·我国肝癌的现状 | 第26-27页 |
| ·癌症相关的蛋白质组研究进展 | 第27-33页 |
| ·定量蛋白组在癌症标志物研究中的进展 | 第33-34页 |
| 3 本论文选题目的、意义和创新点 | 第34-35页 |
| 参考文献 | 第35-42页 |
| 第二章 季铵化新方法探索以及在定量蛋白质组中的潜在应用 | 第42-52页 |
| 1 研究背景 | 第42-44页 |
| 2 实验部分(材料、步骤) | 第44页 |
| ·试剂与仪器 | 第44页 |
| ·实验方法 | 第44页 |
| 3 结果与讨论 | 第44-49页 |
| ·季铵化新旧方法比较 | 第44-46页 |
| ·ESI-MS检测季铵化产物 | 第46-49页 |
| ·同位素标记用于定量 | 第49页 |
| 4 本章小结与前景展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-52页 |
| 第三章 AACT定量蛋白质组技术平台的建立 | 第52-69页 |
| 1 研究背景 | 第52-53页 |
| 2 实验部分 | 第53-55页 |
| ·仪器和试剂 | 第53页 |
| ·AACT技术标记细胞株 | 第53页 |
| ·全蛋白液提取条件以及蛋白定量 | 第53-54页 |
| ·蛋白质—维凝胶分离、胶上酶解和肽段提取 | 第54页 |
| ·LC-ESI-MS-MS分离分析 | 第54-55页 |
| 3 实验结果和讨论 | 第55-66页 |
| ·AACT标记细胞株 | 第55-57页 |
| ·全蛋白液提取条件以及蛋白定量 | 第57-58页 |
| ·质谱相对定量内标分子的选择 | 第58-59页 |
| ·生物学方法Western blot的蛋白质水平验证 | 第59-60页 |
| ·蛋白质分离、鉴定和定量参数优化 | 第60-65页 |
| ·AACT在蛋白质定量的技术优势体现 | 第65-66页 |
| 4 本章小结 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-69页 |
| 第四章 AACT技术用于QSG-7701/QGY-7703定量蛋白质组研究 | 第69-100页 |
| 1 研究背景 | 第69-70页 |
| 2 实验部分 | 第70-71页 |
| ·细胞株QSG-7701和QGY-7703的标记 | 第70页 |
| ·蛋白质/肽的分离分析 | 第70页 |
| ·生物信息学分析 | 第70页 |
| ·免疫印迹Western blot验证 | 第70-71页 |
| 3 实验结果和讨论 | 第71-94页 |
| ·人肝细胞蛋白质表达谱 | 第71-73页 |
| ·正常人肝细胞QSG-7701和肝癌细胞QGY-7703的蛋白质定量谱 | 第73-75页 |
| ·蛋白质家族亚型的鉴定以及定量 | 第75页 |
| ·免疫印迹Western blot验证定量结果 | 第75-76页 |
| ·定量蛋白质的GO分类和生物信息学分析 | 第76-78页 |
| ·差异蛋白质的功能分类和讨论 | 第78-93页 |
| ·分子标志物的预测以及组织样本的验证 | 第93-94页 |
| 4 本章小结 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-100页 |
| 第五章 AACT技术用于MHCC97H/L定量蛋白质组研究肝癌的转移 | 第100-115页 |
| 1 研究背景 | 第100-101页 |
| 2 实验部分 | 第101页 |
| ·仪器 | 第101页 |
| ·AACT技术标记细胞株 | 第101页 |
| ·蛋白质/肽的分离分析 | 第101页 |
| ·质谱数据检索 | 第101页 |
| ·免疫印迹Western blot | 第101页 |
| 3 结果与讨论 | 第101-109页 |
| ·细胞株MHCC97H/L蛋白质表达定量谱 | 第102页 |
| ·细胞株MHCC97H/L蛋白质表达差异谱 | 第102-103页 |
| ·蛋白质MS定量的实例 | 第103-104页 |
| ·差异蛋白质的比较和功能分类讨论 | 第104-108页 |
| ·Western blot验证差异蛋白质在其他细胞中的表达 | 第108-109页 |
| 4 本章小结 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-115页 |
| 第六章 亚细胞器分离方法优化以及用于肝组织的亚细胞器纯化 | 第115-131页 |
| 1 引言 | 第115-116页 |
| 2 实验部分 | 第116-124页 |
| ·细胞中细胞核、线粒体分离 | 第116-119页 |
| ·C57BL/6J小鼠组织中细胞核、线粒体分离 | 第119-123页 |
| ·中国健康人肝组织中细胞核、线粒体分离 | 第123页 |
| ·细胞核、线粒体分离纯度鉴定方法 | 第123-124页 |
| 3 结果与讨论 | 第124-129页 |
| ·细胞样品细胞核、线粒体的纯化情况 | 第124-125页 |
| ·C57BL/6J小鼠细胞核、线粒体分离纯化得率、纯度鉴定 | 第125-128页 |
| ·健康人肝 | 第128-129页 |
| 4 本章小结 | 第129-130页 |
| 参考文献 | 第130-131页 |
| 附表1:QSG-7701/QGY-7703蛋白表达谱 | 第131-135页 |
| 附表2:QSG-7701/QGY-7703蛋白定量谱 | 第135-141页 |
| 攻读博士学位期间发表论文情况 | 第141-143页 |
| 致谢 | 第143-144页 |
