| 中文摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 鸟苷-3’，5’-单磷酸酯(cGMP)在溶液中构象分布的理论研究 | 第9-28页 |
| 第一节 前言 | 第9-12页 |
| 第二节 计算过程 | 第12-16页 |
| 第三节 结果和讨论 | 第16-24页 |
| ·cGMP/cGMPH几何优化后键的键级 | 第16-17页 |
| ·气相能量计算和计算级别及理论模型的相互关系 | 第17-19页 |
| ·溶液中的构象分布 | 第19-21页 |
| ·不同构象间相互转化反应 | 第21-23页 |
| ·微观和表观pKa值 | 第23-24页 |
| 第四节 结论 | 第24-25页 |
| 参考文献 | 第25-28页 |
| 第二章 铝、铜离子的络合物稳定常数的理论研究 | 第28-45页 |
| 第一节 前言 | 第28-29页 |
| 第二节 计算方法 | 第29-32页 |
| ·配体的构建 | 第30-31页 |
| ·络合物的准备 | 第31页 |
| ·考虑熵效应引起的吉布斯自由能改变 | 第31-32页 |
| 第三节 计算结果与讨论 | 第32-40页 |
| ·铝离子的计算结果与讨论 | 第32-37页 |
| ·铜离子的计算结果与讨论 | 第37-40页 |
| 第四节 结论 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 第三章 PDE4酶与底物cAMP结合的分子动力学模拟 | 第45-59页 |
| 第一节 前言 | 第45页 |
| 第二节 分子对接 | 第45-50页 |
| ·材料与计算方法 | 第46-48页 |
| ·结果与讨论 | 第48-50页 |
| ·结论 | 第50页 |
| 第三节 分子动力学 | 第50-53页 |
| ·计算方法 | 第50-51页 |
| ·结果与讨论 | 第51-53页 |
| ·结论 | 第53页 |
| 第四节 虚拟筛选 | 第53-56页 |
| ·虚拟筛选 | 第54-55页 |
| ·结果与讨论 | 第55-56页 |
| 第五节 本章小结 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59页 |