中文摘要 | 第4-7页 |
abstract | 第7-9页 |
前言 | 第12-19页 |
第一部分 基于芯片数据的生物信息学分析挖掘结直肠癌中的关键MIRNA及相关通路分析 | 第19-45页 |
前言 | 第19页 |
数据与方法 | 第19-23页 |
1. miRNA表达谱数据获取 | 第19-20页 |
2. miRNA表达谱数据预处理 | 第20页 |
3. 差异miRNA分析 | 第20页 |
4. 差异miRNA靶基因预测 | 第20页 |
5. 差异miRNA功能富集分析 | 第20-21页 |
6. mRNA表达谱数据获取 | 第21页 |
7. mRNA表达谱数据预处理 | 第21页 |
8. 差异mRNA分析 | 第21-22页 |
9. miRNA调控差异靶基因关系预测 | 第22页 |
10. 差异表达基因功能富集分析 | 第22页 |
11. 蛋白质相互作用网络分析 | 第22-23页 |
12. 疾病相关转录因子预测 | 第23页 |
13. 基于miRNA-PPI网络的转录因子预测和网络整合 | 第23页 |
14. 直肠癌相关的重要miRNA及m RNA的筛选 | 第23页 |
15. miR-20a靶基因分析 | 第23页 |
结果 | 第23-36页 |
1. 差异miRNA筛选 | 第23-24页 |
2. 差异miRNA靶基因预测 | 第24-25页 |
3. 差异miRNA的功能富集分析 | 第25-26页 |
4. 差异表达基因筛选 | 第26页 |
5. 差异表达基因功能富集分析 | 第26-28页 |
6. 蛋白质相互作用网络构建 | 第28-31页 |
7. miRNA调控差异靶基因关系预测 | 第31-32页 |
8. 差异基因的转录因子预测 | 第32页 |
9. miRNA-转录因子-靶基因整合网络分析 | 第32-34页 |
10. 直肠癌相关重要的miRNA及mRNA的筛选 | 第34-35页 |
11. miR-20a靶基因的分析 | 第35-36页 |
讨论 | 第36-43页 |
本章小结 | 第43-45页 |
第二部分 MIR-20A在结直肠癌病人的血清、肿瘤组织和细胞中表达分析 | 第45-55页 |
前言 | 第45页 |
材料与方法 | 第45-49页 |
一、材料 | 第45-47页 |
二、方法 | 第47-49页 |
结果 | 第49-51页 |
1. miR-20a在结肠癌组织和配对的癌旁组织中的表达情况 | 第49-50页 |
2. miR-20a在结肠癌病人血清样本和对照组样本中的表达情况 | 第50-51页 |
3. miR-20a在结直肠癌细胞株中的表达情况 | 第51页 |
讨论 | 第51-54页 |
本章小结 | 第54-55页 |
第三部分 MIR-20A调控TRAIL在治疗结直肠癌中的敏感性研究 | 第55-81页 |
前言 | 第55页 |
材料与方法 | 第55-64页 |
一、材料 | 第55-57页 |
二、方法 | 第57-64页 |
结果 | 第64-76页 |
1.Anti-mi R-20a通过caspase依赖的细胞凋亡途径来增加TRAIL敏感性 | 第64-68页 |
2.在SW480细胞中BID是miR-20a的靶基因 | 第68-70页 |
3.Anti-mi R-20a增加tBid从胞浆到线粒体的易位 | 第70-72页 |
4.TRAIL和anti-miR-20a联合引起的细胞凋亡依赖于BID的上调 | 第72-73页 |
5.抑制miR-20a能够逆转由持续暴露在TRAIL中引起的结直肠癌细胞耐药 | 第73-76页 |
讨论 | 第76-80页 |
本章小结 | 第80-81页 |
参考文献 | 第81-96页 |
综述 MIRNA在结直肠癌发生发展过程中的调控机制研究进展 | 第96-106页 |
参考文献 | 第102-106页 |
博士期间发表文献 | 第106-107页 |
致谢 | 第107-108页 |