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水体中云芝-F21a蓝藻互作机制的初步研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
1 文献综述第11-22页
    1.1 蓝藻与蓝藻水华第11-12页
    1.2 水体富营养化的成因第12-13页
        1.2.1 人为因素第12页
        1.2.2 气象因子第12页
        1.2.3 自身因素第12-13页
    1.3 蓝藻水华的治理第13-15页
        1.3.1 物理方法第13页
        1.3.2 化学方法第13页
        1.3.3 生物学方法第13-15页
    1.4 生物相互作用分子机理研究方法第15-18页
        1.4.1 基因差异表达研究方法(基于转录水平)第15-18页
    1.5 基因功能验证研究方法及主要进展第18-20页
    1.6 本研究的目的和意义第20-22页
2 材料与方法第22-34页
    2.1 材料及仪器第22-24页
        2.1.1 供试材料第22页
        2.1.2 主要仪器和试剂第22-23页
        2.1.3 主要培养基配方第23-24页
        2.1.4 主要试剂配制第24页
    2.2 研究方法第24-25页
        2.2.1 真菌菌丝膜的培养第24-25页
        2.2.2 藻细胞的培养第25页
        2.2.3 真菌降解藻细胞过程及蓝藻浓度的测定第25页
        2.2.4 扫描电镜观察第25页
    2.3 云芝-F21a藻过程转录组分析第25-29页
        2.3.1 真菌菌丝膜及藻细胞培养过程取样及分析第25-26页
        2.3.2 真菌云芝-F21a总RNA提取第26页
        2.3.3 总RNA中基因组去除第26页
        2.3.4 mRNA纯化第26-27页
        2.3.5 cDNA文库构建第27-28页
        2.3.6 文库质检和上机测序第28页
        2.3.7 生物信息学分析第28-29页
    2.4 半定量PCR验证云芝-F21a噬藻关键差异基因第29-31页
        2.4.1 半定量PCR验证第29-30页
        2.4.2 云芝-F21a噬藻过程部分酶活分析第30-31页
    2.5 云芝-F21a转化体系的建立第31-33页
        2.5.1 酶液配制第31页
        2.5.2 云芝-F21a原生质体的制备与再生过程第31-32页
        2.5.3 限制性内切酶介导的遗传转化:第32页
        2.5.4 原生质体转化第32页
        2.5.5 转化子验证第32-33页
    2.6 统计分析第33-34页
3 结果与分析第34-62页
    3.1 云芝-蓝藻共培养过程细胞生物学分析第34-35页
    3.2 云芝-F21a降解蓝藻转录组差异分析第35-49页
        3.2.1 RNA提取第35-36页
        3.2.2 转录组测序第36页
        3.2.3 测序数据质量评估第36-38页
        3.2.4 原始数据处理及统计第38页
        3.2.5 Mapping及结果分析第38-39页
        3.2.6 功能注释第39-40页
        3.2.7 基因表达差异分析第40-42页
        3.2.8 差异基因GO富集分析第42-43页
        3.2.9 差异基因Pathway富集分析第43-47页
        3.2.10 共培养过程中碳水化合物相关酶类组成变化第47-48页
        3.2.11 分解酶类导肽预测结果第48-49页
    3.3 半定量RT-PCR验证第49-53页
    3.4 水解酶基因相关性分析第53-57页
    3.5 酶活测定第57-58页
    3.6 原生质体的制备与再生第58-62页
        3.6.1 云芝-F21a原生质体的形态第58页
        3.6.2 不同因素对原生质体产率的影响第58-60页
        3.6.3 原生质体的再生及转化子验证第60-62页
4 讨论第62-65页
5 结论第65-66页
致谢第66-67页
参考文献第67-73页
附录第73-83页
作者简介第83页
在读期间投稿和发表的学术论文第83页

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