| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 综述 | 第11-25页 |
| 1.1 浮游动物简介及其研究进展 | 第11-14页 |
| 1.1.1 浮游动物概述 | 第11-12页 |
| 1.1.2 浮游动物研究进展 | 第12-14页 |
| 1.2 长腹剑水蚤(Oithona)简介及其研究进展 | 第14-18页 |
| 1.2.1 不同海域长腹剑水蚤种类的分布 | 第14-15页 |
| 1.2.2 长腹剑水蚤的种类鉴定 | 第15-17页 |
| 1.2.3 长腹剑水蚤研究概况 | 第17-18页 |
| 1.3 分子系统学及其研究进展 | 第18-23页 |
| 1.3.1 分子系统学研究方法 | 第19-20页 |
| 1.3.2 物种界定算法比较 | 第20-21页 |
| 1.3.3 分子系统树构建方法 | 第21页 |
| 1.3.4 核酸分子在系统学研究中的应用 | 第21-23页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第23-25页 |
| 第二章 基于COI基因的长腹剑水蚤系统进化分析 | 第25-46页 |
| 2.1 实验材料及方法 | 第25-30页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第25-26页 |
| 2.1.2 主要仪器与试剂 | 第26-27页 |
| 2.1.3 实验方法 | 第27-30页 |
| 2.2 数据处理与分析 | 第30-33页 |
| 2.2.1 COI序列整理 | 第30-32页 |
| 2.2.2 DNA分类 | 第32-33页 |
| 2.2.3 系统学分类 | 第33页 |
| 2.3 结果 | 第33-40页 |
| 2.3.1 不同提取方式扩增结果 | 第33页 |
| 2.3.2 PCR扩增结果 | 第33-35页 |
| 2.3.3 测序结果 | 第35页 |
| 2.3.4 碱基组成分析 | 第35-36页 |
| 2.3.5 密码子使用频率 | 第36-37页 |
| 2.3.6 碱基替换分析 | 第37页 |
| 2.3.7 遗传距离分析 | 第37页 |
| 2.3.8 基于ABGD模型和GMYC模型的物种界定 | 第37-38页 |
| 2.3.9 基于贝叶斯和最大似然法的系统进化分析 | 第38-40页 |
| 2.4 讨论 | 第40-46页 |
| 2.4.1 DNA提取方法的讨论 | 第40-41页 |
| 2.4.2 DNA分类 | 第41-42页 |
| 2.4.3 系统进化关系 | 第42-46页 |
| 第三章 基于18SrDNA基因的长腹剑水蚤系统进化分析 | 第46-59页 |
| 3.1 材料和方法 | 第46-47页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第46页 |
| 3.1.2 主要仪器与试剂 | 第46页 |
| 3.1.3 实验方法 | 第46-47页 |
| 3.2 数据处理与分析 | 第47-49页 |
| 3.2.1 18SrDNA序列整理 | 第47-49页 |
| 3.2.2 系统学分类 | 第49页 |
| 3.3 结果 | 第49-55页 |
| 3.3.1 18SrDNA扩增结果 | 第49-50页 |
| 3.3.2 碱基组成分析 | 第50-51页 |
| 3.3.3 密码子使用频率 | 第51页 |
| 3.3.4 碱基替换分析 | 第51-52页 |
| 3.3.5 遗传距离分析 | 第52页 |
| 3.3.6 系统进化树分析 | 第52-55页 |
| 3.4 讨论 | 第55-59页 |
| 3.4.1 序列分歧度分析 | 第56页 |
| 3.4.2 系统进化分析 | 第56-59页 |
| 第四章 结论与展望 | 第59-62页 |
| 4.1 结论 | 第59-60页 |
| 4.2 创新点 | 第60页 |
| 4.3 展望 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 附录1 硕士期间发表的论文和参加的会议 | 第68-69页 |
| 附录2 资助论文研究的科研项目 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
