西瓜果糖含量评价与转录组分析
摘要 | 第8-9页 |
英文摘要 | 第9-10页 |
1 前言 | 第11-17页 |
1.1 本试验研究的目的与意义 | 第11页 |
1.2 西瓜果实糖分及含量研究现状 | 第11-14页 |
1.2.1 西瓜果实糖分构成 | 第11-12页 |
1.2.2 西瓜果实中糖分代谢的研究进展 | 第12-13页 |
1.2.3 西瓜果实中糖转运的研究进展 | 第13-14页 |
1.2.4 果糖与人体健康 | 第14页 |
1.3 转录组的概念与应用意义 | 第14-16页 |
1.3.1 转录组学与比较转录组分析 | 第14-15页 |
1.3.2 转录组测序的应用优势 | 第15页 |
1.3.3 转录组研究在植物方向的应用 | 第15-16页 |
1.4 本试验技术路线 | 第16-17页 |
2 材料与方法 | 第17-29页 |
2.1 试验材料 | 第17-20页 |
2.1.1 果糖评价群体材料 | 第17-20页 |
2.1.2 转录组测序材料 | 第20页 |
2.2 试验方法 | 第20-29页 |
2.2.1 群体表型性状测定 | 第20-22页 |
2.2.2 用于转录组分析的样品表型测定 | 第22页 |
2.2.3 总RNA的提取 | 第22-23页 |
2.2.4 建库测序 | 第23-25页 |
2.2.5 转录组测序数据分析 | 第25-27页 |
2.2.6 qPCR验证候选基因 | 第27-29页 |
3 结果与分析 | 第29-75页 |
3.1 果糖含量分析与评价 | 第29-38页 |
3.1.1 西瓜果糖含量描述性统计分析 | 第29-30页 |
3.1.2 西瓜果糖含量聚类分析 | 第30-34页 |
3.1.3 四种果糖类型西瓜中不同生态型的分布 | 第34-36页 |
3.1.4 不同瓤色西瓜果糖含量比较分析 | 第36-37页 |
3.1.5 西瓜果肉中果糖占总糖比例分析 | 第37-38页 |
3.2 三种果糖类型西瓜果肉转录组测序 | 第38-69页 |
3.2.1 三种类型西瓜不同发育时期的糖含量变化 | 第38-39页 |
3.2.2 总RNA的提取与检测 | 第39-40页 |
3.2.3 测序数据质量过滤与比对 | 第40-42页 |
3.2.4 基因表达分析 | 第42-46页 |
3.2.5 差异表达分析 | 第46-68页 |
3.2.6 可变剪接事件分析 | 第68-69页 |
3.3 比较分析三个西瓜品种转录组变化 | 第69-71页 |
3.3.1 同一时期不同品种间转录组横向分析 | 第69-70页 |
3.3.2 变异位点分析 | 第70-71页 |
3.4 果糖代谢相关候选基因发掘 | 第71-74页 |
3.5 转录组数据qPCR验证 | 第74-75页 |
4 讨论 | 第75-78页 |
4.1 果糖含量评价与分析 | 第75页 |
4.2 转录组测序分析 | 第75-78页 |
5 结论 | 第78-79页 |
致谢 | 第79-80页 |
参考文献 | 第80-85页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第85页 |