| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-23页 |
| 1.1 microRNA的研究现状 | 第11-14页 |
| 1.1.1 microRNA的发现 | 第11-12页 |
| 1.1.2 microRNA的产生 | 第12-13页 |
| 1.1.3 miRNA的作用机制 | 第13-14页 |
| 1.2 miRNA研究方法 | 第14-18页 |
| 1.2.1 miRNA的鉴定 | 第14-15页 |
| 1.2.2 miRNA的表达 | 第15-16页 |
| 1.2.3 miRNA靶基因预测 | 第16-18页 |
| 1.3 miRNA数据库 | 第18-19页 |
| 1.4 miRNA基因的起源与进化 | 第19-20页 |
| 1.4.1 miRNA基因的起源 | 第19-20页 |
| 1.4.2 miRNA的进化历程 | 第20页 |
| 1.5 蝗虫miRNA研究现状 | 第20-21页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第21-23页 |
| 第2章 实验材料和方法 | 第23-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 实验标本 | 第23页 |
| 2.1.2 实验仪器与试剂 | 第23-25页 |
| 2.2 长翅素木蝗、疣蝗、日本蚱成虫和若虫六个样本的总RNA提取 | 第25-27页 |
| 2.2.1 实验前准备 | 第25-26页 |
| 2.2.2 提取步骤 | 第26页 |
| 2.2.3 总RNA样品质量检测 | 第26-27页 |
| 2.3 sRNA测序文库的构建 | 第27-28页 |
| 2.4 cDNA文库测序 | 第28页 |
| 2.5 生物信息学分析 | 第28-35页 |
| 2.5.1 原始测序数据的存储 | 第28-29页 |
| 2.5.2 clean reads数据的获得 | 第29页 |
| 2.5.3 与参考基因组比对 | 第29页 |
| 2.5.4 保守miRNA鉴定 | 第29页 |
| 2.5.5 小RNA分类注释 | 第29-30页 |
| 2.5.6 新的miRNA预测 | 第30-31页 |
| 2.5.7 成虫和若虫保守miRNA的差异表达分析 | 第31-32页 |
| 2.5.8 差异表达的保守miRNA的靶基因预测及功能分析 | 第32页 |
| 2.5.9 差异表达的保守miRNA的GO功能分析 | 第32-33页 |
| 2.5.10 差异表达的保守miRNA的KEGG代谢通路分析 | 第33-35页 |
| 第3章 实验结果 | 第35-63页 |
| 3.1 样本总RNA的质量检测 | 第35-37页 |
| 3.1.1 琼脂糖凝胶电泳检测结果 | 第35页 |
| 3.1.2 超微量核酸分析仪检测结果 | 第35-36页 |
| 3.1.3 Agilent 2100 Bioanalyzer检测 | 第36-37页 |
| 3.2 长翅素木蝗miRNA生物信息学分析 | 第37-46页 |
| 3.2.1 测序数据统计 | 第37-38页 |
| 3.2.2 序列长度分布 | 第38-39页 |
| 3.2.3 与参考基因组比对 | 第39页 |
| 3.2.4 保守miRNA鉴定 | 第39-40页 |
| 3.2.5 小RNA分类注释 | 第40-41页 |
| 3.2.6 新的miRNA预测 | 第41页 |
| 3.2.7 成虫和若虫保守miRNA的差异表达分析 | 第41-42页 |
| 3.2.8 差异表达的保守miRNA的靶基因预测 | 第42-43页 |
| 3.2.9 差异表达的保守miRNA的GO分析 | 第43-44页 |
| 3.2.10 差异表达的保守miRNA的KEGG代谢通路分析 | 第44-46页 |
| 3.3 疣蝗miRNA生物信息学分析 | 第46-54页 |
| 3.3.1 测序数据统计 | 第46页 |
| 3.3.2 序列长度分布 | 第46-47页 |
| 3.3.3 与参考基因组比对 | 第47页 |
| 3.3.4 保守miRNA鉴定 | 第47-48页 |
| 3.3.5 小RNA分类注释 | 第48页 |
| 3.3.6 新的miRNA预测 | 第48-49页 |
| 3.3.7 成虫和若虫保守miRNA的差异表达分析 | 第49-50页 |
| 3.3.8 差异表达的保守miRNA的靶基因预测 | 第50-51页 |
| 3.3.9 差异表达的保守miRNA的GO分析 | 第51-52页 |
| 3.3.10 差异表达的保守miRNA的KEGG代谢通路分析 | 第52-54页 |
| 3.4 日本蚱miRNA生物信息学分析 | 第54-63页 |
| 3.4.1 测序数据统计 | 第54页 |
| 3.4.2 序列长度分布 | 第54-55页 |
| 3.4.3 与参考基因组比对 | 第55页 |
| 3.4.4 保守miRNA鉴定 | 第55页 |
| 3.4.5 小RNA分类注释 | 第55-56页 |
| 3.4.6 新的miRNA预测 | 第56-57页 |
| 3.4.7 成虫和若虫保守miRNA的差异表达分析 | 第57-58页 |
| 3.4.8 差异表达的保守miRNA的靶基因预测 | 第58-59页 |
| 3.4.9 差异表达的保守miRNA的GO分析 | 第59-60页 |
| 3.4.10 差异表达的保守miRNA的KEGG代谢通路分析 | 第60-63页 |
| 第4章 讨论 | 第63-67页 |
| 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 致谢 | 第77-79页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第79页 |
