| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5页 |
| 第一章 引言 | 第9-19页 |
| 1.1 岩溶水现状 | 第9页 |
| 1.2 岩溶地下水的污染状况 | 第9-10页 |
| 1.3 抗生素污染现状 | 第10-13页 |
| 1.3.1 抗生素的种类 | 第10-12页 |
| 1.3.2 抗生素使用情况及来源 | 第12页 |
| 1.3.3 抗生素抗性基因研究 | 第12-13页 |
| 1.3.4 抗生素污染机制 | 第13页 |
| 1.4 微生物来源追踪方法 | 第13-16页 |
| 1.4.1 微生物来源追踪(MST) | 第13-15页 |
| 1.4.2 MST研究现状 | 第15-16页 |
| 1.5 目的与意义 | 第16页 |
| 1.6 研究内容 | 第16-17页 |
| 1.7 研究路线 | 第17-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-35页 |
| 2.1 样品采集 | 第19-21页 |
| 2.1.1 采样点的位置及分布 | 第19-21页 |
| 2.1.2 采样方法 | 第21页 |
| 2.2 现场数据测量 | 第21-23页 |
| 2.3 主要仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.4 主要试剂 | 第24-26页 |
| 2.5 理化指标检测 | 第26-28页 |
| 2.5.1 ICP测阳离子 | 第26-27页 |
| 2.5.2 HLCP测阴离子 | 第27页 |
| 2.5.3 全自动固相萃取仪测抗生素 | 第27-28页 |
| 2.6 微生物培养及分子生物学实验 | 第28-31页 |
| 2.6.1 DNA提取 | 第28-29页 |
| 2.6.2 16S rRNA测序 | 第29-30页 |
| 2.6.3 肠球菌的培养 | 第30-31页 |
| 2.6.4 肠球菌验证 | 第31页 |
| 2.7 微生物源追踪技术 | 第31-33页 |
| 2.7.1 引物选取 | 第31-33页 |
| 2.7.2 PCR扩增 | 第33页 |
| 2.7.3 qPCR实验 | 第33页 |
| 2.8 数据统计分析 | 第33-35页 |
| 第三章 结果与分析 | 第35-69页 |
| 3.1 阴阳离子检测结果 | 第35-39页 |
| 3.2 抗生素浓度检测结果 | 第39-41页 |
| 3.3 小结 | 第41页 |
| 3.4 16S rRNA微生物多样性分析 | 第41-55页 |
| 3.4.1 总OTU分析 | 第42-47页 |
| 3.4.2 Alpha多样性分析 | 第47-48页 |
| 3.4.3 物种组成分析 | 第48-50页 |
| 3.4.4 Beta多样性分析 | 第50-51页 |
| 3.4.5 样本分组分析 | 第51-52页 |
| 3.4.6 群落组成分析 | 第52-55页 |
| 3.5 小结 | 第55页 |
| 3.6 关联与模型预测分析 | 第55-59页 |
| 3.7 小结 | 第59-60页 |
| 3.8 肠球菌培养结果 | 第60-61页 |
| 3.9 PCR实验分析 | 第61-62页 |
| 3.10 qPCR实验 | 第62-66页 |
| 3.10.1 qPCR结果统计与分析 | 第62-64页 |
| 3.10.2 基因表达、抗生素浓度、菌落数的相关性分析 | 第64-66页 |
| 3.11 小结 | 第66-67页 |
| 3.12 微生物源示踪分析 | 第67-69页 |
| 3.12.1 引物敏感性,特异性分析 | 第67-68页 |
| 3.12.2 样本点分组 | 第68页 |
| 3.12.3 微生物源追踪确定 | 第68-69页 |
| 第四章 结论 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70-72页 |
| 参考文献 | 第72-80页 |
| 附录 | 第80-82页 |