| 致谢 | 第4-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| 1 文献综述 | 第9-17页 |
| 1.1 泡桐新品种研究现状 | 第9-10页 |
| 1.1.1 泡桐的用途 | 第9页 |
| 1.1.2 泡桐新品种的培育及其特性 | 第9页 |
| 1.1.3 四倍体泡桐 | 第9-10页 |
| 1.2 植物对盐胁迫的响应 | 第10-11页 |
| 1.2.1 盐胁迫对植物生长发育的影响 | 第10页 |
| 1.2.2 盐胁迫的分子机理 | 第10-11页 |
| 1.2.3 盐胁迫对泡桐生长的影响 | 第11页 |
| 1.3 植物miRNA | 第11-14页 |
| 1.3.1 miRNA的特征 | 第11-12页 |
| 1.3.2 miRNA的作用机制 | 第12-13页 |
| 1.3.3 miRNA与植物生长发育 | 第13页 |
| 1.3.4 生物和非生物胁迫对miRNA的影响 | 第13-14页 |
| 1.3.5 泡桐的miRNAs研究 | 第14页 |
| 1.4 miRNA的研究内容 | 第14-15页 |
| 1.4.1 miRNA的鉴定 | 第14页 |
| 1.4.2 miRNA靶基因的鉴定 | 第14-15页 |
| 1.4.3 miRNA及其靶基因的验证 | 第15页 |
| 1.5 本研究的目的与意义 | 第15-17页 |
| 2 引言 | 第17-18页 |
| 3 材料与方法 | 第18-24页 |
| 3.1 试验材料及盐处理 | 第18页 |
| 3.2 主要试剂和仪器设备 | 第18-19页 |
| 3.2.1 主要试剂 | 第18页 |
| 3.2.2 主要仪器设备 | 第18-19页 |
| 3.3 总RNA的提取与检测 | 第19页 |
| 3.3.1 白花泡桐总RNA的提取 | 第19页 |
| 3.3.2 总RNA质量检测 | 第19页 |
| 3.4 白花泡桐sRNA文库的构建及测序 | 第19-20页 |
| 3.5 白花泡桐sRNA信息分析 | 第20-21页 |
| 3.6 已知miRNAs的鉴定 | 第21页 |
| 3.7 新miRNAs的鉴定 | 第21-22页 |
| 3.8 miRNA的差异表达分析 | 第22页 |
| 3.9 降解组测序鉴定miRNA的靶基因 | 第22-23页 |
| 3.10 qRT-PCR验证差异表达miRNAs及其靶基因 | 第23-24页 |
| 4 结果与分析 | 第24-63页 |
| 4.1 小RNA库的构建 | 第24-25页 |
| 4.2 sRNA文库的分类注释 | 第25-28页 |
| 4.2.1 Genbank数据库比对 | 第25-26页 |
| 4.2.2 Rfam数据库比对 | 第26-27页 |
| 4.2.3 sRNA分类注释 | 第27-28页 |
| 4.3 白花泡桐中已知miRNAs的鉴定 | 第28-31页 |
| 4.4 白花泡桐中新miRNAs的鉴定 | 第31-41页 |
| 4.5 PF2和PF2-S4文库中miRNAs的差异表达分析 | 第41-47页 |
| 4.6 降解组测序分析miRNA的靶基因 | 第47-61页 |
| 4.6.1 数据预处理 | 第47-48页 |
| 4.6.2 Rfam检索、Genbank检索和Poly N鉴定 | 第48-50页 |
| 4.6.2.1 Rfam检索 | 第48-49页 |
| 4.6.2.2 Genbank检索 | 第49页 |
| 4.6.2.3 Poly N鉴定 | 第49-50页 |
| 4.6.3 Clean tags分类注释 | 第50页 |
| 4.6.4 miRNA降解位点的鉴定 | 第50-60页 |
| 4.6.5 miRNA靶基因的功能注释 | 第60-61页 |
| 4.7 qRT-PCR验证差异表达miRNAs和靶基因 | 第61-63页 |
| 5 结论与讨论 | 第63-66页 |
| 5.1 高通量测序及缺乏白花泡桐基因组信息的局限性 | 第63页 |
| 5.2 盐胁迫下差异表达miRNAs的分析 | 第63-64页 |
| 5.3 预测和分析白花泡桐miRNA的靶基因 | 第64-65页 |
| 5.4 主要创新点及展望 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-73页 |
| ABSTRACT | 第73页 |
