| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第14-30页 |
| 1.1 研究目的与意义 | 第14页 |
| 1.2 文献综述 | 第14-27页 |
| 1.2.1 畜禽粪便中重金属残留现状及其堆肥过程的变化 | 第14-16页 |
| 1.2.2 好氧堆肥过程细菌群落的变化 | 第16-17页 |
| 1.2.3 好氧堆肥过程氮循环过程研究 | 第17-26页 |
| 1.2.4 好氧堆肥过程抗性基因的研究 | 第26-27页 |
| 1.3 主要研究内容与技术路线 | 第27-30页 |
| 1.3.1 研究内容 | 第27-29页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第29-30页 |
| 第二章 铜对堆肥过程中细菌丰度和群落多样性的影响 | 第30-54页 |
| 2.1 材料与方法 | 第31-34页 |
| 2.1.1 堆肥试验 | 第31-32页 |
| 2.1.2 理化性质及重金属测定 | 第32页 |
| 2.1.3 DNA提取和qPCR定量检测 | 第32-33页 |
| 2.1.4 16S高通量测序分析 | 第33-34页 |
| 2.1.5 数据统计与分析 | 第34页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第34-53页 |
| 2.2.1 Cu对堆肥过程中理化性质变化的影响 | 第34-37页 |
| 2.2.2 Cu对堆肥过程细菌丰度的影响 | 第37-38页 |
| 2.2.3 Cu对堆肥过程细菌群落β多样性的影响 | 第38-40页 |
| 2.2.4 Cu对堆肥过程细菌群落组成的影响 | 第40-44页 |
| 2.2.5 PICRUSt对细菌酶生产潜力的预测 | 第44-48页 |
| 2.2.6 好氧堆肥过程细菌群落network分析 | 第48-50页 |
| 2.2.7 环境因素和细菌群落之间的关系 | 第50-53页 |
| 2.3 小结 | 第53-54页 |
| 第三章 铜对堆肥过程中氨氧化微生物群落及其基因丰度变化的影响 | 第54-68页 |
| 3.1 材料与方法 | 第55-57页 |
| 3.1.1 堆肥试验 | 第55-56页 |
| 3.1.2 理化性质及潜在氨氧化势的测定 | 第56页 |
| 3.1.3 DNA样品的提取和定量PCR | 第56页 |
| 3.1.4 PCR变性凝胶电泳(DGGE)和测序分析 | 第56-57页 |
| 3.1.5 数据统计与分析 | 第57页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第57-67页 |
| 3.2.1 Cu对堆肥过程中理化性质的影响 | 第57-59页 |
| 3.2.2 Cu对堆肥过程潜在氨氧化势的影响 | 第59-60页 |
| 3.2.3 Cu对堆肥过程氨氧化古菌和氨氧化细菌amoA基因丰度的影响 | 第60-62页 |
| 3.2.4 堆肥过程中氨氧化微生物群落DGGE指纹图谱分析 | 第62-65页 |
| 3.2.5 Cu对堆肥过程氨氧化古菌和氨氧化细菌群落多样性的影响 | 第65-66页 |
| 3.2.6 堆肥过程氨氧化古菌和氨氧化细菌系统发育分析 | 第66-67页 |
| 3.3 小结 | 第67-68页 |
| 第四章 铜对堆肥过程中反硝化微生物群落及其基因丰度的影响 | 第68-87页 |
| 4.1 材料与方法 | 第69-70页 |
| 4.1.1 堆肥试验 | 第69页 |
| 4.1.2 理化性质及重金属测定 | 第69页 |
| 4.1.3 DNA提取和qPCR定量检测 | 第69页 |
| 4.1.4 反硝化功能基因高通量测序分析 | 第69页 |
| 4.1.5 数据统计与分析 | 第69-70页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第70-86页 |
| 4.2.1 Cu对畜禽粪便堆肥过程中反硝化功能基因丰度的影响 | 第70-72页 |
| 4.2.2 Cu对猪粪堆肥过程中反硝化细菌群落多样性及结构的影响 | 第72-75页 |
| 4.2.3 Cu对猪粪堆肥过程中反硝化微生物群落组成的影响 | 第75-79页 |
| 4.2.4 堆肥过程中反硝化基因和反硝化微生物的network分析 | 第79-83页 |
| 4.2.5 环境因子对反硝化微生物群落结构的影响 | 第83-86页 |
| 4.3 小结 | 第86-87页 |
| 第五章 铜对堆肥过程中固氮微生物丰度及其群落变化的影响 | 第87-103页 |
| 5.1 材料与方法 | 第88-89页 |
| 5.1.1 堆肥试验 | 第88页 |
| 5.1.2 理化性质及重金属测定 | 第88页 |
| 5.1.3 DNA提取和qPCR定量检测 | 第88页 |
| 5.1.4 固氮功能基因高通量测序分析 | 第88页 |
| 5.1.5 数据统计与分析 | 第88-89页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第89-102页 |
| 5.2.1 畜禽粪便中残留的Cu对堆肥过程nifH基因丰度的影响 | 第89-90页 |
| 5.2.2 Cu对堆肥过程携带nifH基因固氮细菌群落结构的影响 | 第90-94页 |
| 5.2.3 Cu对堆肥过程固氮细菌群落组成的影响 | 第94-97页 |
| 5.2.4 堆肥过程固氮微生物的共现性分析 | 第97-102页 |
| 5.3 小结 | 第102-103页 |
| 第六章 铜对堆肥过程中抗铜基因和抗生素抗性基因的影响 | 第103-117页 |
| 6.1 材料与方法 | 第104-106页 |
| 6.1.1 堆肥试验 | 第104页 |
| 6.1.2 理化性质及重金属测定 | 第104页 |
| 6.1.3 DNA提取和qPCR定量检测 | 第104-106页 |
| 6.1.4 16SrRNA高通量测序分析 | 第106页 |
| 6.1.5 数据统计与分析 | 第106页 |
| 6.2 结果与讨论 | 第106-115页 |
| 6.2.1 Cu对堆肥过程中CRGs丰度的影响 | 第106-108页 |
| 6.2.2 Cu对堆肥过程中ARGs和intI1的影响 | 第108-110页 |
| 6.2.3 Cu对好氧堆肥过程中细菌属的影响 | 第110-111页 |
| 6.2.4 CRGs、ARGs与intI1和环境因子之间的关系 | 第111-113页 |
| 6.2.5 CRGs、ARGs与intI1和主要细菌属之间network分析 | 第113-115页 |
| 6.3 小结 | 第115-117页 |
| 第七章 结论与展望 | 第117-119页 |
| 7.1 主要结论 | 第117-118页 |
| 7.2 研究展望 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-137页 |
| 致谢 | 第137-138页 |
| 作者简介 | 第138-140页 |
