| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 计算化学理论背景 | 第11-17页 |
| 1.1 计算机辅助药物设计 | 第11-15页 |
| 1.1.1 定量构效关系研究 | 第12-13页 |
| 1.1.2 分子对接 | 第13页 |
| 1.1.3 分子动力学模拟 | 第13-14页 |
| 1.1.4 结合自由能计算 | 第14-15页 |
| 1.1.5 虚拟筛选 | 第15页 |
| 1.2 计算平台 | 第15-16页 |
| 1.2.1 软件平台 | 第15-16页 |
| 1.2.2 硬件平台 | 第16页 |
| 1.3 主要研究工作 | 第16-17页 |
| 第2章 吡咯并嘧啶衍生物作为新型蛋白酪氨酸JAK3激酶抑制剂的理论计算研究 | 第17-46页 |
| 2.1 研究背景 | 第17-18页 |
| 2.2 方法与数据 | 第18-25页 |
| 2.2.1 数据集 | 第18-22页 |
| 2.2.2 分子模建和分子叠合 | 第22-23页 |
| 2.2.3 CoMFA和CoMSIA模型建立 | 第23-24页 |
| 2.2.4 分子对接 | 第24页 |
| 2.2.5 分子动力学模拟 | 第24-25页 |
| 2.2.6 结合自由能 | 第25页 |
| 2.2.7 虚拟筛选 | 第25页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第25-44页 |
| 2.3.1 3D-QSAR模型的可靠性 | 第25-29页 |
| 2.3.2 3D-QSAR模型的三维等值图分析 | 第29-33页 |
| 2.3.3 分子对接结果 | 第33-35页 |
| 2.3.4 设计新分子 | 第35-37页 |
| 2.3.5 分子动力学模拟分析 | 第37-42页 |
| 2.3.6 自由结合能 | 第42-43页 |
| 2.3.7 虚拟筛选 | 第43-44页 |
| 2.4 小结 | 第44-46页 |
| 第3章 新型甲基苯-N-烷基衍生物作为SH2域激酶抑制剂的分子设计研究 | 第46-59页 |
| 3.1 SH2简介 | 第46页 |
| 3.2 计算方法 | 第46-52页 |
| 3.2.1 数据集 | 第46-51页 |
| 3.2.2 分子结构构建与叠合 | 第51页 |
| 3.2.3 CoMFA模型和CoMSIA模型建立 | 第51-52页 |
| 3.2.4 分子对接模拟 | 第52页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第52-58页 |
| 3.3.1 3D-QSAR模型的统计结果 | 第52-53页 |
| 3.3.2 3D-QSAR模型的三维等值图分析 | 第53-56页 |
| 3.3.3 分子对接 | 第56-57页 |
| 3.3.4 设计新的抑制剂分子 | 第57-58页 |
| 3.4 小结 | 第58-59页 |
| 第4章 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 攻读学位期间所开展的科研项目和发表的学术论文 | 第70页 |