| 致谢 | 第4-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| 1.文献综述 | 第9-14页 |
| 1.1 烟碱含量的意义 | 第9页 |
| 1.2 烟碱生物合成途径 | 第9-10页 |
| 1.3 烟碱生物合成的调控及研究进展 | 第10-12页 |
| 1.3.1 烟碱生物合成的调控 | 第10页 |
| 1.3.2 烟碱生物合成调控的目前进展 | 第10-12页 |
| 1.3.2.1 打顶对烟草根系烟碱合成的影响 | 第11页 |
| 1.3.2.2 打顶与根-冠交流 | 第11-12页 |
| 1.4 数字化表达谱技术（DGE） | 第12-14页 |
| 1.4.1 DGE的原理和方法 | 第12-13页 |
| 1.4.2 DGE的特点 | 第13-14页 |
| 2 引言 | 第14-15页 |
| 3 实验材料与方法 | 第15-23页 |
| 3.1 实验材料 | 第15页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第15页 |
| 3.1.2 试剂材料 | 第15页 |
| 3.1.3 主要器材 | 第15页 |
| 3.2 试验方法 | 第15-23页 |
| 3.2.1 表达谱分析和后期检测所用材料的取样方法 | 第15页 |
| 3.2.2 总RNA提取 | 第15-16页 |
| 3.2.2.1 总RNA的提取 | 第15-16页 |
| 3.2.2.2 RNA检测方法 | 第16页 |
| 3.2.3 DGE文库构建 | 第16-17页 |
| 3.2.4 数字化表达谱（DGE）数据的分析方法 | 第17-19页 |
| 3.2.4.1 原始数据的过滤方法 | 第17页 |
| 3.2.4.2 原始clean tags表达量及分布分析、测序饱和度分析 | 第17页 |
| 3.2.4.3 clean tags的注释和标准化 | 第17-18页 |
| 3.2.4.4 差异基因的筛选 | 第18页 |
| 3.2.4.5 差异表达模式聚类分析 | 第18页 |
| 3.2.5.6 Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第18-19页 |
| 3.2.4.7 KEGG Pathway显著性富集分析 | 第19页 |
| 3.2.5 c DNA第一链的制备 | 第19-20页 |
| 3.2.6 相关基因的半定量检测 | 第20页 |
| 3.2.7 q RT-PCR验证 | 第20-21页 |
| 3.2.8 Northern blotting分析 | 第21-23页 |
| 3.2.8.1 RT-PCR检测 | 第21页 |
| 3.2.8.2 Northern印迹杂交检测 | 第21-23页 |
| 4 结果与分析 | 第23-32页 |
| 4.1 根冠交流早期响应基因表达模式的建立 | 第23-24页 |
| 4.2 打顶响应相关基因的筛选 | 第24-25页 |
| 4.3 烟草根尖打顶响应基因的分析 | 第25-26页 |
| 4.4 q RT-PCR验证差异基因验证 | 第26-29页 |
| 4.5 结合SSH文库分析DGE文库中差异表达基因 | 第29页 |
| 4.6 Nta-mi R164a和Nt NAC-R1参与调控根系发育 | 第29-30页 |
| 4.7 Nta-mi R171d和Nt GRAS-R1参与打顶后烟草根系的发育 | 第30页 |
| 4.8 Nta-mi R167d和Nt WRKY-R1参与打顶后烟碱的生物合成 | 第30-32页 |
| 5 讨论 | 第32-33页 |
| 6 结论 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-39页 |
| 补充信息 | 第39-55页 |
| Abstract | 第55-56页 |
