| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 朊病毒疾病概述 | 第10-18页 |
| 一 朊病毒疾病简介 | 第10-11页 |
| 二 动物和人类中最具代表性的朊病毒疾病 | 第11-15页 |
| 1 动物疾病 | 第11-12页 |
| 1.1 羊瘙痒病 | 第11-12页 |
| 1.2 疯牛病 | 第12页 |
| 2 人类疾病 | 第12-15页 |
| 2.1 库鲁病 | 第12-13页 |
| 2.2 克雅氏症 | 第13-14页 |
| 2.3 变异型克雅氏症 | 第14-15页 |
| 三 朊病毒疾病的致病机理 | 第15-18页 |
| 1 朊蛋白 | 第15-16页 |
| 2 朊病毒致病假说 | 第16页 |
| 3 Shadoo蛋白与朊病毒疾病 | 第16-18页 |
| 第二章 水牛中与疯牛病易感相关的朊病毒基因多态性研究 | 第18-53页 |
| 一 研究背景 | 第18-21页 |
| 1 不同的哺乳动物对朊病毒疾病的易感性不同 | 第18-19页 |
| 2 PRNP基因与朊病毒疾病的易感性相关 | 第19页 |
| 3 牛PRNP基因影响疯牛病易感性的因素 | 第19-21页 |
| 4 研究目的和意义 | 第21页 |
| 二 实验材料和方法 | 第21-37页 |
| 1 实验材料 | 第21-24页 |
| 1.1 实验样品 | 第21-22页 |
| 1.2 主要仪器 | 第22-23页 |
| 1.3 主要试剂 | 第23-24页 |
| 1.4 主要试剂盒 | 第24页 |
| 2 实验方法 | 第24-35页 |
| 2.1 血样采集 | 第24页 |
| 2.2 血样基因组DNA提取 | 第24-25页 |
| 2.3 基因组DNA浓度和纯度测定 | 第25-26页 |
| 2.4 基因组DNA琼脂糖凝胶电泳检测 | 第26页 |
| 2.5 PCR扩增 | 第26-28页 |
| 2.6 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染 | 第28-29页 |
| 2.7 PCR产物回收及检测 | 第29-30页 |
| 2.8 克隆 | 第30-32页 |
| 2.9 提质粒 | 第32-33页 |
| 2.10 测序 | 第33-35页 |
| 3 数据分析 | 第35-37页 |
| 3.1 PRNP基因23-bp和12-bp indel多态以及寡肽重复多态分析 | 第35-36页 |
| 3.2 PRNP基因编码区序列分析 | 第36-37页 |
| 三实验结果 | 第37-50页 |
| 1 23-bp和12-bp indel多态在中国水牛中的分布 | 第37-41页 |
| 1.1 水牛23-bp indel多态位点片段的PCR扩增及聚丙烯酰胺凝胶电泳结果 | 第37页 |
| 1.2 水牛12-bp indel多态位点片段的PCR扩增及聚丙烯酰胺凝胶电泳结果 | 第37-38页 |
| 1.3 中国水牛PRNP基因23-bp和12-bp indel多态基因型频率分布 | 第38-39页 |
| 1.4 中国水牛PRNP基因23-bp和12-bp indel多态等位基因频率分布 | 第39-40页 |
| 1.5 中国水牛PRNP基因23-bp和12-bp indel多态单倍型频率分布 | 第40-41页 |
| 2 黄牛和水牛两个indel多态分布的比较 | 第41-44页 |
| 3 中国水牛编码区寡肤重复的多态性情况 | 第44-45页 |
| 4 黄牛和水牛寡肽重复分布的比较 | 第45-47页 |
| 5 中国水牛氨基酸多态性情况 | 第47-48页 |
| 6 PRNP基因编码区序列分析 | 第48-50页 |
| 四 讨论 | 第50-52页 |
| 1 PrP蛋白质基因非编码区12-bp和23-bp indel多态 | 第50页 |
| 2 PrP蛋白寡肽重复数目 | 第50-51页 |
| 3 PrP蛋白编码区氨基酸多态 | 第51-52页 |
| 五 总结 | 第52-53页 |
| 第三章 基于分子动力学模拟研究残基S154N突变对朊蛋白构象变化的影响 | 第53-62页 |
| 一 分子动力学模拟概述 | 第53-54页 |
| 二 分子动力学模拟的原理 | 第54页 |
| 三 分子动力学模拟的方法 | 第54-56页 |
| 1 水溶液中的能量最小化 | 第55页 |
| 2 位置抑制性分子动力学模拟 | 第55-56页 |
| 3 分子动力学模拟 | 第56页 |
| 四 分子动力学模拟结果分析 | 第56-61页 |
| 1 PrP蛋白野生型1 dex0和S143N突变型的RMSD比较 | 第56-57页 |
| 2 二级结构随时间的变化情况 | 第57-59页 |
| 3 三维结构随时间的变化情况 | 第59-61页 |
| 五 讨论 | 第61页 |
| 六 总结 | 第61-62页 |
| 附录 | 第62-73页 |
| 参考文献 | 第73-85页 |
| 致谢 | 第85-87页 |
| 在学期间获奖和发表论文情况 | 第87页 |
