| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-20页 |
| 1.1 ‘无子瓯柑’简介 | 第9页 |
| 1.2 无核柑橘品种及无核机理研究 | 第9-12页 |
| 1.2.1 无核柑橘品种 | 第9页 |
| 1.2.2 柑橘无核机理研究 | 第9-11页 |
| 1.2.2.1 雄性不育 | 第9-10页 |
| 1.2.2.2 雌性不育 | 第10页 |
| 1.2.2.3 自交不亲和 | 第10页 |
| 1.2.2.4 多倍体导致胚败育 | 第10-11页 |
| 1.2.2.5 环境条件和施用生长调节剂导致无核 | 第11页 |
| 1.2.3‘无子瓯柑’无核机理研究进展 | 第11-12页 |
| 1.3 植物减数分裂研究进展 | 第12-13页 |
| 1.3.1 减数分裂在细胞学中的研究进展 | 第12页 |
| 1.3.2 减数分裂转录组学研究进展 | 第12-13页 |
| 1.3.3 减数分裂蛋白质组学研究进展 | 第13页 |
| 1.4 分子标记类型及其应用 | 第13-17页 |
| 1.4.1 分子标记的类型及其特点 | 第13-15页 |
| 1.4.2 分子标记的应用 | 第15-16页 |
| 1.4.2.1 用于种质资源鉴定 | 第15页 |
| 1.4.2.2 用于遗传多样性分析 | 第15页 |
| 1.4.2.3 用于分子遗传图谱构建 | 第15-16页 |
| 1.4.2.4 用于基因定位及克隆 | 第16页 |
| 1.4.3 分子标记在果树芽变品种研究中的应用 | 第16-17页 |
| 1.5 全基因组重测序 | 第17-19页 |
| 1.5.1 全基因组重测序概念 | 第17页 |
| 1.5.2 全基因组重测序技术应用 | 第17-18页 |
| 1.5.2.1 基于基因组重测序技术的InDel标记的开发 | 第17-18页 |
| 1.5.2.2 基于基因组重测序技术的SV标记的开发 | 第18页 |
| 1.5.2.3 基于基因组重测序技术的SNP标记的开发 | 第18页 |
| 1.5.3 基因组重测序在遗传变异研究中的作用 | 第18-19页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第19-20页 |
| 第二章 有子瓯柑与‘无子瓯柑’全基因组重测序 | 第20-30页 |
| 2.1 材料与方法 | 第20-23页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第20页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第20-23页 |
| 2.1.2.1 DNA的提取 | 第20页 |
| 2.1.2.2 测序文库构建 | 第20-21页 |
| 2.1.2.3 全基因组重测序 | 第21页 |
| 2.1.2.4 生物信息学分析 | 第21-23页 |
| 2.1.2.4.1 DNA水平的变异基因功能注释 | 第22-23页 |
| 2.1.2.4.2 SNP分析 | 第23页 |
| 2.2 结果与分析 | 第23-29页 |
| 2.2.1 基因组测序数据产出统计及序列组装 | 第23-25页 |
| 2.2.2 DNA水平的变异基因分析 | 第25-26页 |
| 2.2.3 SNP位点发掘 | 第26页 |
| 2.2.4 SNP注释 | 第26-27页 |
| 2.2.5 基因差异表达分析 | 第27-29页 |
| 2.2.5.1 差异基因GO功能富集 | 第27-28页 |
| 2.2.5.2 差异基因COG分类 | 第28-29页 |
| 2.3 讨论 | 第29-30页 |
| 第三章 INDEL分子标记的开发 | 第30-39页 |
| 3.1 材料与方法 | 第30-32页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第30页 |
| 3.1.2 研究方法 | 第30-32页 |
| 3.1.2.1 DNA的提取 | 第30页 |
| 3.1.2.2 DNA质量检测 | 第30-31页 |
| 3.1.2.3 InDel引物设计 | 第31页 |
| 3.1.2.4 InDel-PCR扩增 | 第31-32页 |
| 3.2 结果与分析 | 第32-37页 |
| 3.2.1 InDel位点的分布 | 第32-33页 |
| 3.2.2 InDel注释 | 第33页 |
| 3.2.3 InDel引物设计及多态性检验 | 第33-37页 |
| 3.3 讨论 | 第37-39页 |
| 第四章 SV分子标记的开发 | 第39-48页 |
| 4.1 主要仪器与试剂 | 第39页 |
| 4.2 研究方法 | 第39-44页 |
| 4.2.1 SV引物设计及SV-PCR扩增 | 第39-42页 |
| 4.2.2 SV-PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测 | 第42页 |
| 4.2.3 PCR产物回收片段与PMD-19（simple）载体连接 | 第42-44页 |
| 4.3 结果与分析 | 第44-46页 |
| 4.3.1 SV信息 | 第44-45页 |
| 4.3.2 SV-PCR琼脂糖凝胶电泳 | 第45-46页 |
| 4.4 讨论 | 第46-48页 |
| 第五章 总结 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-56页 |
| 作者简介 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 附录 | 第58-66页 |
