| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-13页 |
| 1.1 研究背景 | 第9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-10页 |
| 1.3 本文的主要工作 | 第10-11页 |
| 1.4 本文的组织结构 | 第11-13页 |
| 第二章 相关知识 | 第13-19页 |
| 2.1 引言 | 第13页 |
| 2.2 相关概念 | 第13-17页 |
| 2.2.1 Hadoop及Hbase平台介绍 | 第13-15页 |
| 2.2.2 生物数据 | 第15-16页 |
| 2.2.3 生物数据库 | 第16-17页 |
| 2.3 存在的不足 | 第17页 |
| 2.4 本章小结 | 第17-19页 |
| 第三章 生物数据库建设及序列存储模式应用 | 第19-32页 |
| 3.1 引言 | 第19页 |
| 3.2 HBASE介绍 | 第19-20页 |
| 3.3 生物数据类图模型及HBASE表结构设计 | 第20-26页 |
| 3.4 生物序列数据比对 | 第26-31页 |
| 3.4.1 Overlapping模式应用 | 第27-28页 |
| 3.4.2 Non-overlapping存储模式应用 | 第28-29页 |
| 3.4.3 窗口大小为1的讨论 | 第29-31页 |
| 3.5 小结 | 第31-32页 |
| 第四章 相空间与DNA序列分析 | 第32-39页 |
| 4.1 引言 | 第32页 |
| 4.2 相空间介绍 | 第32页 |
| 4.3 K-WORDS介绍 | 第32-33页 |
| 4.4 结果和讨论 | 第33-38页 |
| 4.5 小结 | 第38-39页 |
| 第五章 分形与DNA序列分析 | 第39-47页 |
| 5.1 引言 | 第39页 |
| 5.2 数据和映射规则 | 第39-40页 |
| 5.3 计算方法 | 第40-41页 |
| 5.4 结果与讨论 | 第41-46页 |
| 5.5 小结 | 第46-47页 |
| 第六章 总结和展望 | 第47-49页 |
| 6.1 总结 | 第47-48页 |
| 6.2 展望 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 攻读硕士学位期刊参与科研项目 | 第57-58页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第58页 |