| 摘要 | 第8-9页 |
| 英文摘要 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第11-26页 |
| 1.1 我国民猪资源 | 第11-14页 |
| 1.1.1 体型外貌 | 第12页 |
| 1.1.2 体重体长 | 第12-14页 |
| 1.2 猪的驯化与体长性状的变异 | 第14-17页 |
| 1.2.1 猪体长性状的育种意义 | 第16页 |
| 1.2.2 猪体长性状遗传学基础的前期研究 | 第16-17页 |
| 1.3 控制猪体长性状的研究进展 | 第17-20页 |
| 1.3.1 多形性腺瘤基因 1 | 第18-19页 |
| 1.3.2 生殖细胞核因子 | 第19-20页 |
| 1.3.3 配体依赖的核受体辅阻遏物-like | 第20页 |
| 1.4 SNPs及其应用 | 第20-23页 |
| 1.4.1 SNPs的概念及特点 | 第20-21页 |
| 1.4.2 SNPs的检测方法 | 第21-23页 |
| 1.5 连锁不平衡分析 | 第23-25页 |
| 1.5.1 连锁不平衡的概念 | 第23页 |
| 1.5.2 单倍型和BLOCK | 第23-24页 |
| 1.5.3 连锁分析的基本原理 | 第24页 |
| 1.5.4 影响连锁不平衡的因素 | 第24-25页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第25-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第26-28页 |
| 2.1.1 研究对象 | 第26页 |
| 2.1.2 试剂及耗材 | 第26页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第26-27页 |
| 2.1.4 缓冲液及主要溶液的配制 | 第27页 |
| 2.1.5 主要分子生物学软件 | 第27页 |
| 2.1.6 相关生物信息学网站 | 第27-28页 |
| 2.2 实验方法 | 第28-33页 |
| 2.2.1 基因组DNA的提取 | 第28-29页 |
| 2.2.2 质量和浓度检测 | 第29页 |
| 2.2.3 单核苷酸多态位点选择 | 第29-30页 |
| 2.2.4 引物的设计与合成 | 第30-31页 |
| 2.2.5 PCR扩增 | 第31-32页 |
| 2.2.6 PCR产物的纯化 | 第32页 |
| 2.2.7 测序 | 第32-33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-59页 |
| 3.1 耳组织DNA提取结果 | 第33-34页 |
| 3.1.1 DNA基因组的紫外吸收光谱分析 | 第33页 |
| 3.1.2 DNA基因组的琼脂糖凝胶电泳分析 | 第33-34页 |
| 3.2 PCR扩增结果 | 第34页 |
| 3.3 PLAG1基因与体长性状的连锁不平衡分析 | 第34-42页 |
| 3.3.1 PLAG1基因的多态性SNPs位点 | 第34-36页 |
| 3.3.2 PLAG1各位点基因频率 | 第36-39页 |
| 3.3.3 PLAG1基因的SNPs位点的连锁不平衡构建和单倍型分析 | 第39-41页 |
| 3.3.4 PLAG1基因的候选SNP位点在民猪群体中的检验 | 第41-42页 |
| 3.4 NR6A1基因与体长性状的连锁不平衡分析 | 第42-49页 |
| 3.4.1 NR6A1基因的多态性遗传标记 | 第42-43页 |
| 3.4.2 NR6A1各位点基因频率 | 第43-46页 |
| 3.4.3 NR6A1基因的SNPs位点的连锁不平衡构建和单倍型分析 | 第46-48页 |
| 3.4.4 NR6A1基因的候选SNP位点在民猪群体中的检验 | 第48-49页 |
| 3.5 LCORL基因与体长性状的连锁不平衡分析 | 第49-55页 |
| 3.5.1 LCORL基因的多态性遗传标记 | 第49-50页 |
| 3.5.2 LCORL各位点基因频率 | 第50-52页 |
| 3.5.3 LCORL基因的SNPs位点的连锁不平衡构建和单倍型分析 | 第52-54页 |
| 3.5.4 LCORL基因的候选SNP位点在民猪群体中的检验 | 第54-55页 |
| 3.6 合并基因型分析 | 第55-59页 |
| 4 讨论 | 第59-63页 |
| 4.1 SNPs和LD block构建及研究意义 | 第59页 |
| 4.2 PLAG1的连锁不平衡分析结果讨论 | 第59-60页 |
| 4.3 NR6A1的连锁不平衡分析结果讨论 | 第60-61页 |
| 4.4 LCORL的连锁不平衡分析结果讨论 | 第61-63页 |
| 5 结论 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-69页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第69页 |
