| 中文摘要 | 第3-4页 |
| 英文摘要 | 第4-5页 |
| 1 绪论 | 第8-16页 |
| 1.1 我国猪粪便污染状况 | 第8-9页 |
| 1.2 粪便污染源检测方法 | 第9-11页 |
| 1.2.1 依赖于数据库方法 | 第9页 |
| 1.2.2 不依赖于数据库方法 | 第9-11页 |
| 1.3 水体粪便污染指示菌的选择 | 第11-12页 |
| 1.4 粪便指示菌衰变特性研究 | 第12页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第12-14页 |
| 1.6 技术路线 | 第14-15页 |
| 1.7 研究创新点 | 第15-16页 |
| 2 实验材料及方法 | 第16-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第16-20页 |
| 2.1.1 粪便样品采集 | 第16-17页 |
| 2.1.2 环境水样采集 | 第17-18页 |
| 2.1.3 主要实验试剂与耗材 | 第18页 |
| 2.1.4 实验试剂盒 | 第18页 |
| 2.1.5 主要仪器设备 | 第18-19页 |
| 2.1.6 实验部分溶液配制方法 | 第19-20页 |
| 2.2 实验方法及步骤 | 第20-33页 |
| 2.2.1 粪便样品基因组DNA提取 | 第20-21页 |
| 2.2.2 粪便基因组DNA的验证 | 第21页 |
| 2.2.3 PCR扩增 | 第21-22页 |
| 2.2.4 回收纯化PCR产物 | 第22-23页 |
| 2.2.5 454焦磷酸测序 | 第23页 |
| 2.2.6 生物信息分析 | 第23-24页 |
| 2.2.7 引物设计 | 第24页 |
| 2.2.8 Faecalibacterium菌通用引物验证 | 第24-25页 |
| 2.2.9 猪粪便特异性引物验证 | 第25页 |
| 2.2.10 阳性率检测 | 第25-26页 |
| 2.2.11 灵敏度测定 | 第26-30页 |
| 2.2.12 确定最佳猪粪便Faecalibacterium特异性引物 | 第30页 |
| 2.2.13 衰变特性的初步检测 | 第30-32页 |
| 2.2.14 环境水样验证 | 第32-33页 |
| 3 实验结果 | 第33-45页 |
| 3.1 微生物种类和多样性结果 | 第33-37页 |
| 3.1.1 微生物种类结果 | 第33-35页 |
| 3.1.2 微生物多样性结果 | 第35-37页 |
| 3.1.3 小结与讨论 | 第37页 |
| 3.2 引物验证结果 | 第37-39页 |
| 3.2.1 Faecalibacterium菌通用引物验证结果 | 第37-38页 |
| 3.2.2 猪粪便Faecalibacterium菌引物特异性验证结果 | 第38页 |
| 3.2.3 小结与讨论 | 第38-39页 |
| 3.3 猪粪便特异性引物的阳性率和灵敏度检测结果 | 第39-41页 |
| 3.3.1 猪粪便特异性引物的阳性率检测结果 | 第39页 |
| 3.3.2 猪粪便特异性引物灵敏度测定结果 | 第39-40页 |
| 3.3.3 小结与讨论 | 第40-41页 |
| 3.4 猪粪便Faecalibacterium菌基因标记衰变状况 | 第41-43页 |
| 3.4.1 温度和光照对标记物衰变特征影响 | 第41-42页 |
| 3.4.2 小结与讨论 | 第42-43页 |
| 3.5 环境水样检测结果与分析 | 第43-45页 |
| 3.5.1 环境水样检测结果 | 第43页 |
| 3.5.2 小结与讨论 | 第43-45页 |
| 4 结论与展望 | 第45-48页 |
| 4.1 总结 | 第45页 |
| 4.2 讨论 | 第45-47页 |
| 4.3 后续实验研究及展望 | 第47-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-55页 |
| 附录 | 第55页 |
