摘要 | 第6-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
第一章 绪论 | 第12-14页 |
第二章 癌症二代测序数据中融合基因的研究 | 第14-27页 |
第一节 人类癌症及其分子生物学概述 | 第14-19页 |
第二节 融合基因在癌症中的作用 | 第19-22页 |
第三节 二代测序技术概述 | 第22-24页 |
第四节 二代测序技术在癌症研究中的应用 | 第24-26页 |
第五节 本论文的研究意义 | 第26-27页 |
第三章 癌症RNA-seq数据中融合基因的挖掘 | 第27-55页 |
第一节 材料与方法 | 第27-35页 |
一、癌症转录组数据集 | 第27-28页 |
二、融合基因挖掘和数据库构建的技术路线 | 第28-29页 |
三、融合基因数据挖掘和过滤 | 第29-31页 |
四、融合基因的结构功能注释 | 第31-34页 |
五、基因的KEGG、GO和InterPro富集功能注释 | 第34页 |
六、融合基因的driver作用可能性预测 | 第34-35页 |
七、数据库构建及网页设计 | 第35页 |
第二节 结果与讨论 | 第35-53页 |
一、结直肠癌RNA-seq数据中融合基因的挖掘 | 第35-44页 |
二、癌症融合基因数据库的构建 | 第44-48页 |
三、讨论 | 第48-53页 |
第三节 结论 | 第53-55页 |
一、结论 | 第53页 |
二、本研究创新之处 | 第53-54页 |
三、展望 | 第54-55页 |
附录 | 第55-59页 |
参考文献 | 第59-69页 |
攻读硕士期间学术成果 | 第69-70页 |
致谢 | 第70页 |