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牛冠状病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

目录第1-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-12页
英文缩写符号及中英对照表第12-13页
文献综述第13-20页
 1.病原学第13-14页
   ·分类地位第13页
   ·理化性质第13页
   ·病毒培养特性第13-14页
   ·基因组及编码蛋白第14页
 2.流行病学第14-16页
   ·流行情况及分布第14-15页
   ·易感动物第15页
   ·传播途径第15-16页
 3.BCoV 诊断技术第16-20页
   ·病原学检测第16页
     ·电镜观察第16页
     ·病毒的分离与鉴定第16页
   ·血清学检测第16-17页
     ·血凝和血凝抑制试验第16-17页
     ·中和试验第17页
     ·酶联免疫吸附试验第17页
   ·分子生物学检测第17-20页
     ·常规 PCR第17页
     ·巢式 PCR第17-18页
     ·多重 PCR第18页
     ·实时荧光定量 PCR第18页
     ·RT-LAMP第18-20页
第一章 牛冠状病毒 SYBR Green I 荧光定量 PCR 检测方法的建立及优化第20-36页
 1 实验材料第20-22页
   ·菌株、质粒、病料第20页
   ·主要仪器设备第20-21页
   ·主要试剂第21页
   ·实验所用溶液及其配置第21-22页
 2 实验方法第22-29页
   ·特异性引物的设计与合成第22-23页
   ·病毒 RNA 的提取第23页
   ·cDNA 的合成第23页
   ·常规 RT-PCR 方法的建立及优化第23-24页
   ·PCR 产物的琼脂糖凝胶电泳检测第24-25页
   ·PCR 产物的凝胶回收第25页
   ·PCR 产物的连接第25页
   ·连接产物的转化第25-26页
   ·质粒提取第26-27页
   ·重组质粒酶切鉴定第27页
   ·重组质粒测序鉴定第27页
   ·重组质粒浓度的测定第27页
   ·荧光定量 PCR 标准曲线的建立第27-28页
   ·荧光定量 PCR 熔解曲线的建立第28页
   ·荧光定量 PCR 特异性检测第28页
   ·荧光定量 PCR 敏感性检测第28页
   ·荧光定量 PCR 重复性检测第28-29页
 3 实验结果第29-34页
   ·牛冠状病毒 N 基因片段的克隆第29页
   ·牛冠状病毒 N 基因片段的测序鉴定第29-30页
   ·重组质粒的酶切鉴定第30页
   ·重组质粒的浓度测定第30页
   ·荧光定量 PCR 反应条件的确定第30-32页
   ·荧光定量 PCR 标准曲线的建立第32-33页
   ·荧光定量 PCR 特异性检测结果第33页
   ·荧光定量 PCR 敏感性检测结果第33-34页
   ·荧光定量 PCR 重复性检测结果第34页
 4 讨论第34-36页
第二章 我国部分地区规模化奶牛场牛冠状病毒感染的流行病学调查第36-43页
 1 实验材料第36页
   ·送检病料第36页
   ·主要仪器设备第36页
   ·主要试剂第36页
   ·实验所用溶液及其配制第36页
 2 实验方法第36-38页
   ·特异性引物的设计与合成第36页
   ·病料的处理第36-37页
     ·粪便样本的处理第36页
     ·鼻拭子样本的处理第36-37页
   ·病毒 RNA 的提取及 cDNA 的合成第37页
   ·临床样本的检测第37页
     ·常规 PCR 检测 BCoV第37页
     ·荧光定量 PCR 检测 BCoV第37页
     ·常规 PCR 检测 BEV、BVDV、IBRV 和 BPIV325第37页
   ·牛冠状病毒 N 基因全序列的扩增第37-38页
   ·牛冠状病毒 N 基因的系统发生分析第38页
 3 实验结果第38-41页
   ·检测结果统计第38-39页
     ·牛冠状病毒检测结果第38-39页
     ·BEV、BVDV、IBRV 和 BPIV3 与 BCoV 混合感染检测结果第39页
   ·牛冠状病毒 N 基因的克隆第39-40页
   ·牛冠状病毒 N 基因的测序鉴定第40页
   ·牛冠状病毒 N 基因的系统发生分析第40-41页
 4 讨论第41-43页
第三章 结论第43-44页
参考文献第44-49页
致谢第49-50页
攻读学位期间发表的学术论文第50页

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