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乳腺癌全基因组甲基化差异分析与重要功能基因的临床验证

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-26页
第一章 乳腺癌概况第26-45页
   ·乳腺癌的发病率和死亡率第26页
   ·乳腺癌的危险因素第26-27页
   ·病理特性第27-30页
     ·组织学分型第27-28页
     ·淋巴结第28页
     ·肿瘤大小第28页
     ·肿瘤分期第28页
     ·肿瘤分级第28-29页
     ·激素受体第29-30页
   ·诊断第30页
   ·治疗方法第30-32页
   ·乳腺癌的分子生物学特征第32-43页
     ·基因扩增第33页
     ·杂合性丢失(Loss of Heterozygosity,LOH)第33-34页
     ·基因突变第34-35页
     ·基因多态性第35-36页
     ·DNA甲基化第36-42页
     ·乳腺癌的基因表达模式第42-43页
   ·实验目的第43-44页
   ·预期目标第44-45页
第二章 Infinium Human Methylation 450 芯片的乳腺癌甲基化差异性分析第45-69页
   ·研究背景第45-47页
   ·材料与方法第47-55页
     ·研究对象第47页
     ·DNA的提取第47-48页
     ·DNA定量,纯度检测、完整性检测第48-49页
     ·DNA重亚硫酸盐转化第49-50页
     ·芯片杂交、甲基化位点扫描及数据分析第50-55页
   ·结果第55-65页
     ·不同实验组基因组DNA的纯化第55页
     ·甲基化芯片的质量控制分析第55-58页
     ·乳腺癌与正常乳腺组织的DNA甲基化差异第58-65页
   ·讨论第65-69页
第三章 RARβ基因甲基化可用于判断淋巴结转移乳腺癌患者的预后第69-84页
   ·研究背景第69-70页
   ·材料与方法第70-76页
     ·研究对象第70-71页
     ·DNA的提取第71页
     ·DNA亚硫酸氢钠的修饰第71-73页
     ·引物的设计第73-74页
     ·甲基化特异性PCR检测(MSP)第74-75页
     ·统计学处理第75-76页
   ·结果第76-81页
     ·RARβ基因的甲基化检测结果第76页
     ·RARβ基因甲基化与临床病理的关系第76-79页
     ·RARβ基因甲基化与预后的关系第79-81页
   ·讨论第81-84页
第四章 乳腺癌患者PTPRO基因异常甲基化的预后价值及其外周血检测的临床意义第84-107页
   ·研究背景第84-86页
   ·材料与方法第86-95页
     ·研究对象第86页
     ·标本的采集第86-87页
     ·DNA的提取第87页
     ·DNA的亚硫酸氢钠修饰第87-89页
     ·甲基化特异性PCR检测第89-90页
     ·基因测序第90-91页
     ·总RNA的提取第91-92页
     ·cDNA的合成第92页
     ·半定量RT-PCR法检测PTPRO mRNA的表达情况第92-93页
     ·细胞培养和去甲基化实验第93-94页
     ·统计学处理第94-95页
   ·结果第95-102页
     ·乳腺癌患者肿瘤组织及外周血中PTPRO基因启动子的甲基化情况第95-97页
     ·PTPRO基因启动子甲基化与临床病理特征相关性分析第97-98页
     ·PTPRO基因启动子甲基化与乳腺癌预后的相关性第98-100页
     ·PTPRO基因甲基化与其表达状态呈负相关第100-102页
   ·讨论第102-107页
参考文献第107-137页
英文缩写词第137-140页
攻读学位期间成果第140-141页
致谢第141-142页

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