大豆曲茎性状基因定位、表达谱及候选基因功能分析
| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 缩略词表及英汉对照 | 第12-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-32页 |
| ·作物株型育种研究概况 | 第14-20页 |
| ·植物株型的概念 | 第14-15页 |
| ·主要农作物株型遗传育种研究概况 | 第15-19页 |
| ·大豆株型育种研究 | 第19-20页 |
| ·植物曲茎形态的遗传与育种利用研究 | 第20-24页 |
| ·植物茎形态特点与遗传育种研究 | 第20-21页 |
| ·曲茎性状的遗传调控机制 | 第21-23页 |
| ·大豆曲茎研究进展 | 第23-24页 |
| ·图位克隆技术 | 第24-26页 |
| ·图位克隆技术的原理 | 第24页 |
| ·图位克隆的技术环节 | 第24-26页 |
| ·大豆基因图位克隆研究进展 | 第26页 |
| ·基因芯片技术 | 第26-31页 |
| ·基因芯片的测序原理 | 第27-28页 |
| ·基因芯片的类型 | 第28页 |
| ·基因芯片和待分析样品的制备 | 第28-29页 |
| ·基因芯片技术在农作物上的应用 | 第29-30页 |
| ·展望 | 第30-31页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
| 第二章 大豆曲茎基因的定位与候选基因分析 | 第32-44页 |
| ·试验材料 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-36页 |
| ·田间试验及性状调查 | 第32-33页 |
| ·大豆叶片DNA提取 | 第33-34页 |
| ·SSR引物 | 第34页 |
| ·PCR扩增 | 第34-35页 |
| ·PAGE检测 | 第35页 |
| ·候选基因的预测分析 | 第35-36页 |
| ·结果分析 | 第36-42页 |
| ·大豆曲茎性状的遗传分析 | 第36-37页 |
| ·农艺性状的调查和分析 | 第37-38页 |
| ·大豆曲茎突变体sb基因的定位 | 第38-41页 |
| ·候选区段的基因分析 | 第41-42页 |
| ·讨论 | 第42-44页 |
| 第三章 大豆曲茎近等基因系的基因表达谱分析 | 第44-68页 |
| ·试验材料 | 第44-45页 |
| ·试验方法 | 第45-49页 |
| ·大豆曲茎材料种植和处理 | 第45页 |
| ·总RNA的提取 | 第45-46页 |
| ·芯片的制备 | 第46-48页 |
| ·荧光定量PCR | 第48-49页 |
| ·结果分析 | 第49-65页 |
| ·总RNA质检结果 | 第49-50页 |
| ·原始数据的归一化 | 第50-51页 |
| ·差异基因的筛选 | 第51-52页 |
| ·基因芯片数据的聚类分析 | 第52-54页 |
| ·差异基因生物学功能分析 | 第54-57页 |
| ·差异基因信号转导通路分析 | 第57-58页 |
| ·共表达网络分析 | 第58-63页 |
| ·芯片可靠性的验证 | 第63-65页 |
| ·讨论 | 第65-68页 |
| ·影响芯片结果准确性的因素 | 第65页 |
| ·曲茎重要候选基因的筛选 | 第65-68页 |
| 第四章 大豆曲茎相关基因GmC4H1的表达鉴定 | 第68-80页 |
| ·实验材料 | 第68页 |
| ·实验方法 | 第68-72页 |
| ·RNA提取 | 第68-69页 |
| ·RT-PCR反应 | 第69-70页 |
| ·基因扩增的PCR反应 | 第70-71页 |
| ·琼脂糖凝胶的制备 | 第71页 |
| ·PCR产物的回收 | 第71页 |
| ·连接、转化及转化子的筛选 | 第71-72页 |
| ·荧光定量PCR | 第72页 |
| ·结果分析 | 第72-77页 |
| ·GmC4H1序列分析 | 第72-74页 |
| ·GmC4H1荧光定量分析 | 第74-75页 |
| ·GmC4H1共表达基因分析 | 第75-77页 |
| ·讨论 | 第77-80页 |
| ·细胞色素P450家族 | 第77页 |
| ·植物C4H基因的功能 | 第77-78页 |
| ·与GmC4H1共表达的基因 | 第78-80页 |
| 第五章 曲茎候选基因GmPPR1的功能鉴定 | 第80-90页 |
| ·实验材料 | 第80页 |
| ·实验方法 | 第80-84页 |
| ·载体信息 | 第80-81页 |
| ·表达载体构建 | 第81-83页 |
| ·表达载体转化农杆菌 | 第83页 |
| ·GmPPR1基因转化拟南芥 | 第83页 |
| ·转基因植株的筛选 | 第83-84页 |
| ·分子鉴定 | 第84页 |
| ·结果分析 | 第84-88页 |
| ·植物表达载体的构建及检测 | 第84-85页 |
| ·农杆菌转化子的检测 | 第85-86页 |
| ·GUS染色检测 | 第86-87页 |
| ·分子检测 | 第87页 |
| ·转基因植株的观察 | 第87-88页 |
| ·讨论 | 第88-90页 |
| 全文结论与创新之处 | 第90-92页 |
| 参考文献 | 第92-104页 |
| 附录 | 第104-116页 |
| 致谢 | 第116页 |
