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酿酒酵母SDT1和CDC73的结构生物学研究

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
第1章 嘧啶核苷酸酶SDT1 蛋白的结构与功能研究第9-53页
   ·酿酒酵母源SDT1 蛋白研究进展第9-26页
     ·HALO 酸水解酶家族概述第9-19页
       ·HAD 水解酶大家族与其它Rossmann 型折叠花样家族的关联第10-12页
       ·HAD 水解酶大家族在核心Rossmannoid 结构域上的变化第12-13页
       ·HAD 水解酶大家族的保守结构特征第13-15页
       ·HAD 水解酶大家族的帽子结构域第15-18页
       ·HAD 水解酶大家族的帽子结构域在催化水解中的作用第18-19页
     ·核苷酸酶家族概述第19-24页
       ·大肠杆菌源的胞质核苷酸酶第21-22页
       ·胞质内的核糖核苷酸酶第22-24页
     ·SDT1 蛋白研究进展第24-26页
   ·实验方法和结果第26-39页
     ·SDT1(26-280)-pET-22b 质粒构建第26-28页
     ·SDT1(26-280)的蛋白表达与纯化第28-31页
     ·SDT1(26-280)的酶活测定第31-32页
     ·SDT1(26-280)蛋白的晶体生长条件筛选、优化及晶体衍射数据收集第32-34页
     ·SDT1(26-280)蛋白的衍射数据的处理及结构解析第34-36页
     ·SDT1(26-280)的模型与电子密度图的吻合情况第36-37页
     ·SDT1(26-280)蛋白D61A 突变体的质粒构建、表达纯化、晶体生长以及底物的浸泡第37-39页
   ·SDT1(26-280)蛋白晶体结构分析以及D61A 突变体与底物相互作用的讨论第39-48页
     ·SDT1(26-280)蛋白的序列分析第39-40页
     ·SDT1(26-280)蛋白的整体晶体结构第40-45页
     ·SDT1 与其它核苷酸酶结构的比较第45-46页
     ·SDT1 的D61A 突变体与底物的复合物结构揭示了SDT1 与底物的结合模式第46-48页
 本章小结第48-49页
 参考文献第49-53页
第2章 酿酒酵母PAF1 复合物亚基CDC73 蛋白结构与功能研究第53-79页
   ·PAF1 复合物与CDC73 蛋白的研究进展第53-64页
     ·PAF1 复合物的发现第53-54页
     ·PAF1 复合物参与到转录循环中的过程第54-57页
     ·与PAF1 复合物功能密切相关的生物学过程第57-62页
       ·修饰组蛋白第57-59页
       ·影响端粒长度和端粒沉默第59页
       ·影响RNA 聚合酶II 的C 端结构域2 位丝氨酸磷酸化第59页
       ·影响转录的延伸第59-61页
       ·影响mRNA 的3’-末端结构并招募mRNA 的3’-末端切割因子第61页
       ·影响snoRNA 的3′末端结构第61-62页
     ·与PAF1 复合物有直接相互作用的因子第62-63页
     ·CDC73 的研究进展第63-64页
   ·实验方法和结果第64-69页
     ·CDC73 (235-393)-pET-22b 质粒构建第64-65页
     ·CDC73 (235-393)蛋白的表达与纯化第65-66页
     ·CDC73 (235-393)蛋白的晶体筛选、数据收集及初步处理第66-67页
     ·CDC73 (235-393)蛋白的结构解析及模型质量分析第67-68页
     ·CDC73 (235-393)蛋白的GTPase 活性的测定第68-69页
   ·CDC73 (235-393)蛋白晶体结构分析与讨论第69-73页
     ·CDC73 (235-393)蛋白的序列分析及它的整体结构第69-70页
     ·CDC73 (235-393)与其它小G 蛋白的结构比对第70-72页
     ·CDC73 是否是一个G 蛋白第72-73页
 本章小结与展望第73-74页
 参考文献第74-79页
附录1 试剂与电泳配方第79-80页
附录2 Top10 感受态细胞的制作第80页
附录3 质粒图谱第80-82页
附录4 质粒的小量抽提第82-83页
致谢第83-84页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第84-85页

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