摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-9页 |
引言 | 第9-11页 |
第一章 绪论 | 第11-15页 |
·序列比对研究背景及意义 | 第11-12页 |
·序列比对研究现状 | 第12-13页 |
·序列比对研究内容 | 第13-15页 |
第二章 生物序列比对 | 第15-22页 |
·生物信息学中的基本概念 | 第15-16页 |
·核酸 | 第15页 |
·蛋白质 | 第15-16页 |
·生物序列分析 | 第16-22页 |
·多序列比对问题的描述 | 第17-18页 |
·空位罚分 | 第18-19页 |
·打分矩阵 | 第19-22页 |
第三章 序列比对方法 | 第22-33页 |
·双序列比对算法 | 第22-27页 |
·点阵法 | 第23页 |
·动态规划算法思想 | 第23-26页 |
·Fasta 算法和Blast 算法 | 第26-27页 |
·多序列比对算法 | 第27-31页 |
·多重序列的动态规划算法 | 第28-29页 |
·Clustal 算法 | 第29-30页 |
·星比对算法 | 第30-31页 |
·迭代法 | 第31页 |
·序列比对算法评价 | 第31-33页 |
第四章 基于自适应免疫遗传算法的多序列比对算法 | 第33-48页 |
·遗传算法基本概念 | 第33页 |
·遗传算法基本原理 | 第33-38页 |
·遗传算法基本步骤 | 第34-37页 |
·遗传算法特点 | 第37页 |
·遗传算法总结 | 第37-38页 |
·自适应遗传算法 | 第38-40页 |
·免疫算法 | 第40-42页 |
·生物免疫系统的学习机理 | 第40-41页 |
·免疫算法的描述 | 第41页 |
·免疫算子的机理 | 第41-42页 |
·基于自适应免疫遗传算法的多序列比对算法分析与设计 | 第42-48页 |
·遗传算法的基本实现技术 | 第43-45页 |
·免疫算子的设计 | 第45-46页 |
·算法流程图 | 第46-48页 |
第五章 MSAAIGA 实验结果及分析 | 第48-51页 |
·实验结果 | 第48-49页 |
·算法收敛性分析 | 第49-51页 |
·遗传算法缺陷 | 第49页 |
·MSAAIGA 算法收敛性分析 | 第49-51页 |
结束语 | 第51-52页 |
致谢 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-55页 |
在校期间公开发表论文及著作情况 | 第55页 |