| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-22页 |
| ·课题来源及研究的目的和意义 | 第9-10页 |
| ·机械加工过程分子动力学仿真及国内外研究现状 | 第10-13页 |
| ·纳米级切削、压痕和研磨过程分子动力学仿真国内外研究现状 | 第11-12页 |
| ·超精密磨削过程分子动力学仿真及国内外研究现状 | 第12-13页 |
| ·分子动力学仿真并行算法和国内外研究现状 | 第13-18页 |
| ·分子动力学基本原理 | 第18-21页 |
| ·分子动力学仿真模型的建立 | 第18-19页 |
| ·分子动力学计算初始条件的确定 | 第19-20页 |
| ·系统运动方程及其算法 | 第20页 |
| ·弛豫(趋于平衡)过程 | 第20-21页 |
| ·课题研究内容 | 第21-22页 |
| 2 串行程序设计与分析 | 第22-26页 |
| ·物理模型的建立与分析 | 第22-23页 |
| ·计算过程的设计与分析 | 第23-24页 |
| ·初始化 | 第23页 |
| ·力的计算 | 第23页 |
| ·系统运动方程的数值求解 | 第23-24页 |
| ·弛豫过程的设计与分析 | 第24页 |
| ·分子动力学仿真串行程序设计 | 第24页 |
| ·分子动力学仿真串行程序分析 | 第24-26页 |
| 3 分子动力学仿真并行算法的研究 | 第26-48页 |
| ·并行算法设计基础 | 第26-29页 |
| ·PCAM设计方法学 | 第26-27页 |
| ·并行程序模式的分析及选择 | 第27-29页 |
| ·并行计算模型的分析与选择 | 第29-31页 |
| ·BSP模型与LogP模型的分析与比较 | 第29-30页 |
| ·BSP模型中的计算分析 | 第30-31页 |
| ·单晶硅超精密磨削分子动力学仿真并行算法的研究 | 第31-42页 |
| ·空间区域的划分模型 | 第31-33页 |
| ·基于区域二次划分的分子动力学并行仿真 | 第33-38页 |
| ·算法流程描述 | 第38-40页 |
| ·并行程序中各策略的具体实现 | 第40-42页 |
| ·消息传递策略的设计 | 第42-46页 |
| ·MPI消息传递模式分析与选择 | 第42-44页 |
| ·基于“永久序号”的原子信息调用和消息传递 | 第44-46页 |
| ·断点保存和程序的重启运行 | 第46-48页 |
| ·断点的保存 | 第47页 |
| ·程序的重启运行 | 第47-48页 |
| 4 并行程序的设计环境 | 第48-56页 |
| ·并行计算机硬件环境 | 第48-50页 |
| ·并行机的体系结构分析 | 第48页 |
| ·微机机群(Beowulf PC-Cluster)的性能特点分析 | 第48-50页 |
| ·并行程序设计软件环境 | 第50-56页 |
| ·并行机系统软件 | 第50-51页 |
| ·并行程序设计环境的分析与选择 | 第51-52页 |
| ·并行程序的编译和运行 | 第52-53页 |
| ·并行程序调试 | 第53-56页 |
| 5 并行数据的处理和分析 | 第56-63页 |
| ·并行数据处理 | 第56页 |
| ·数据可视化 | 第56-58页 |
| ·并行程序性能分析 | 第58-63页 |
| ·串、并行数据对比分析 | 第58-60页 |
| ·并行算法性能分析 | 第60-63页 |
| 结论 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-68页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 大连理工大学学位论文版权使用授权书 | 第70页 |